সংরক্ষণ করুন:
গ্রন্থ-পঞ্জীর বিবরন
প্রধান লেখক: Sun, Peisen
বিন্যাস: Recurso digital
ভাষা:ইংরেজি
প্রকাশিত: Zenodo 2025
বিষয়গুলি:
অনলাইন ব্যবহার করুন:https://doi.org/10.5281/zenodo.15314440
ট্যাগগুলো: ট্যাগ যুক্ত করুন
কোনো ট্যাগ নেই, প্রথমজন হিসাবে ট্যাগ করুন!
সূচিপত্রের সারণি:
  • <p><span lang="EN-US">Analysis complex spatial transcriptomics (ST) data are struggling for uneven sampling, sparsity and ambiguous tissue boundaries. Here, we present a protocol for deciphering complex ST data using STMiner. We describe the steps for installing STMiner, loading ST data into STMiner, identifying spatially variable genes, determining gene sets associated with the structure of interest, and obtaining spatial expression patterns. This protocol can be employed to decipher complex ST data across varying resolutions and platforms, without the need for additional reference data.</span></p>