محفوظ في:
| المؤلف الرئيسي: | |
|---|---|
| التنسيق: | Recurso digital |
| اللغة: | |
| منشور في: |
Zenodo
2025
|
| الوصول للمادة أونلاين: | https://doi.org/10.5281/zenodo.16809384 |
| الوسوم: |
إضافة وسم
لا توجد وسوم, كن أول من يضع وسما على هذه التسجيلة!
|
جدول المحتويات:
- <p>CRISPR-ScreenAnalysis is an automated Snakemake workflow for pooled CRISPR screen analysis using MAGeCK, supporting both single-end and paired-end data. The pipeline performs FASTQ quality control, sgRNA counting with a user-provided library, use of an automated or custom design matrix generation, and gene-level β score estimation via MAGeCK MLE. Designed for reproducibility and scalability in Slurm-managed HPC environments.</p>