Résultats de la recherche - Mathis, Simon

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    Flows, straight but not so fast: Exploring the design space of Rectified Flows in Protein Design par Chen, Junhua, Mathis, Simon, Harris, Charles, Didi, Kieran, Lio, Pietro

    Publié 2025
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    On the Expressive Power of Geometric Graph Neural Networks par Joshi, Chaitanya K., Bodnar, Cristian, Mathis, Simon V., Cohen, Taco, Liò, Pietro

    Publié 2023
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    A framework for conditional diffusion modelling with applications in motif scaffolding for protein design par Didi, Kieran, Vargas, Francisco, Mathis, Simon V, Dutordoir, Vincent, Mathieu, Emile, Komorowska, Urszula J, Lio, Pietro

    Publié 2023
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    Improving Antibody Design with Force-Guided Sampling in Diffusion Models par Kulytė, Paulina, Vargas, Francisco, Mathis, Simon Valentin, Wang, Yu Guang, Hernández-Lobato, José Miguel, Liò, Pietro

    Publié 2024
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  5. 5
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    gRNAde: Geometric Deep Learning for 3D RNA inverse design par Joshi, Chaitanya K., Jamasb, Arian R., Viñas, Ramon, Harris, Charles, Mathis, Simon V., Morehead, Alex, Anand, Rishabh, Liò, Pietro

    Publié 2023
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  6. 6
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    DEFT: Efficient Fine-Tuning of Diffusion Models by Learning the Generalised $h$-transform par Denker, Alexander, Vargas, Francisco, Padhy, Shreyas, Didi, Kieran, Mathis, Simon, Dutordoir, Vincent, Barbano, Riccardo, Mathieu, Emile, Komorowska, Urszula Julia, Lio, Pietro

    Publié 2024
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  7. 7
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    A Hitchhiker's Guide to Geometric GNNs for 3D Atomic Systems par Duval, Alexandre, Mathis, Simon V., Joshi, Chaitanya K., Schmidt, Victor, Miret, Santiago, Malliaros, Fragkiskos D., Cohen, Taco, Liò, Pietro, Bengio, Yoshua, Bronstein, Michael

    Publié 2023
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  8. 8
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    RNA-FrameFlow: Flow Matching for de novo 3D RNA Backbone Design par Anand, Rishabh, Joshi, Chaitanya K., Morehead, Alex, Jamasb, Arian R., Harris, Charles, Mathis, Simon V., Didi, Kieran, Ying, Rex, Hooi, Bryan, Liò, Pietro

    Publié 2024
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  9. 9
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    Evaluating representation learning on the protein structure universe par Jamasb, Arian R., Morehead, Alex, Joshi, Chaitanya K., Zhang, Zuobai, Didi, Kieran, Mathis, Simon V., Harris, Charles, Tang, Jian, Cheng, Jianlin, Lio, Pietro, Blundell, Tom L.

    Publié 2024
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  10. 10
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    Latent-X: An Atom-level Frontier Model for De Novo Protein Binder Design par Latent Labs Team, Bridgland, Alex, Crabbé, Jonathan, Kenlay, Henry, Pretorius, Daniella, Schmon, Sebastian M., Hilmkil, Agrin, Bartke-Croughan, Rebecca, Rombach, Robin, Flashman, Michael, Matteson, Tomas, Mathis, Simon, Nelson, Alexander W. R., Yuan, David, Obika, Annette, Kohl, Simon A. A.

    Publié 2025
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  11. 11
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    Drug-like antibodies with low immunogenicity in human panels designed with Latent-X2 par Latent Labs Team, Kenlay, Henry, Pretorius, Daniella, Crabbé, Jonathan, Bridgland, Alex, Schmon, Sebastian M., Hilmkil, Agrin, Vuckovic, James, Mathis, Simon, Matteson, Tomas, Bartke-Croughan, Rebecca, Motmaen, Amir, Rombach, Robin, Vlachynská, Mária, Nelson, Alexander W. R., Yuan, David, Obika, Annette, Kohl, Simon A. A.

    Publié 2025
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  12. 12
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    Latent-Y: A Lab-Validated Autonomous Agent for De Novo Drug Design par Latent Labs Team, Schmon, Sebastian M., Pretorius, Daniella, Mathis, Simon, Bartke-Croughan, Rebecca, Puvanendran, Aishaini, Vuckovic, James, Kenlay, Henry, Vlachynská, Mária, Bridgland, Alex, Grishin, Ivan, Over, Sven, Li, David, Li, Bridget, Crabbé, Jonathan, Hilmkil, Agrin, Nelson, Alexander W. R., Yuan, David, Obika, Annette, Kohl, Simon A. A.

    Publié 2026
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  13. 13
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    atomworks par Corley, Nathaniel, Mathis, Simon, Krishna, Rohith, Bauer, Magnus S., Thompson, Tuscan R., Ahern, Woody, Kazman, Maxwell W., Brent, Rafael I., Didi, Kieran, Kubaney, Andrew, McHugh, Liam, Nagle, Andrew, Favor, Adam, Kshirsagar, Meghana, Sturmfels, Pascal, Li, Yinuo, Butcher, John, Qiang, Bo, Schaaf, Luna L., Mitra, Ria, Campbell, Kerrie, Zhang, Opa, Weissman, Rose, Humphreys, Ian R., Cong, Qian, Jiang, Hanlun, Funk, Jason, Sonthalia, Satyaki, Lio, Pietro, Baker, David, DiMaio, Frank

    Publié 2025
    Fuente: Zenodo
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  14. 14
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    Artificial Intelligence for Science in Quantum, Atomistic, and Continuum Systems par Zhang, Xuan, Wang, Limei, Helwig, Jacob, Luo, Youzhi, Fu, Cong, Xie, Yaochen, Liu, Meng, Lin, Yuchao, Xu, Zhao, Yan, Keqiang, Adams, Keir, Weiler, Maurice, Li, Xiner, Fu, Tianfan, Wang, Yucheng, Strasser, Alex, Yu, Haiyang, Xie, YuQing, Fu, Xiang, Xu, Shenglong, Liu, Yi, Du, Yuanqi, Saxton, Alexandra, Ling, Hongyi, Lawrence, Hannah, Stärk, Hannes, Gui, Shurui, Edwards, Carl, Gao, Nicholas, Ladera, Adriana, Wu, Tailin, Hofgard, Elyssa F., Tehrani, Aria Mansouri, Wang, Rui, Daigavane, Ameya, Bohde, Montgomery, Kurtin, Jerry, Huang, Qian, Phung, Tuong, Xu, Minkai, Joshi, Chaitanya K., Mathis, Simon V., Azizzadenesheli, Kamyar, Fang, Ada, Aspuru-Guzik, Alán, Bekkers, Erik, Bronstein, Michael, Zitnik, Marinka, Anandkumar, Anima, Ermon, Stefano, Liò, Pietro, Yu, Rose, Günnemann, Stephan, Leskovec, Jure, Ji, Heng, Sun, Jimeng, Barzilay, Regina, Jaakkola, Tommi, Coley, Connor W., Qian, Xiaoning, Qian, Xiaofeng, Smidt, Tess, Ji, Shuiwang

    Publié 2023
    Fuente: arXiv
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