Suchergebnisse - Mathis, Simon

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    Flows, straight but not so fast: Exploring the design space of Rectified Flows in Protein Design von Chen, Junhua, Mathis, Simon, Harris, Charles, Didi, Kieran, Lio, Pietro

    Veröffentlicht 2025
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  2. 2
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    On the Expressive Power of Geometric Graph Neural Networks von Joshi, Chaitanya K., Bodnar, Cristian, Mathis, Simon V., Cohen, Taco, Liò, Pietro

    Veröffentlicht 2023
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    A framework for conditional diffusion modelling with applications in motif scaffolding for protein design von Didi, Kieran, Vargas, Francisco, Mathis, Simon V, Dutordoir, Vincent, Mathieu, Emile, Komorowska, Urszula J, Lio, Pietro

    Veröffentlicht 2023
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    Improving Antibody Design with Force-Guided Sampling in Diffusion Models von Kulytė, Paulina, Vargas, Francisco, Mathis, Simon Valentin, Wang, Yu Guang, Hernández-Lobato, José Miguel, Liò, Pietro

    Veröffentlicht 2024
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    gRNAde: Geometric Deep Learning for 3D RNA inverse design von Joshi, Chaitanya K., Jamasb, Arian R., Viñas, Ramon, Harris, Charles, Mathis, Simon V., Morehead, Alex, Anand, Rishabh, Liò, Pietro

    Veröffentlicht 2023
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  6. 6
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    DEFT: Efficient Fine-Tuning of Diffusion Models by Learning the Generalised $h$-transform von Denker, Alexander, Vargas, Francisco, Padhy, Shreyas, Didi, Kieran, Mathis, Simon, Dutordoir, Vincent, Barbano, Riccardo, Mathieu, Emile, Komorowska, Urszula Julia, Lio, Pietro

    Veröffentlicht 2024
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  7. 7
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    A Hitchhiker's Guide to Geometric GNNs for 3D Atomic Systems von Duval, Alexandre, Mathis, Simon V., Joshi, Chaitanya K., Schmidt, Victor, Miret, Santiago, Malliaros, Fragkiskos D., Cohen, Taco, Liò, Pietro, Bengio, Yoshua, Bronstein, Michael

    Veröffentlicht 2023
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  8. 8
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    RNA-FrameFlow: Flow Matching for de novo 3D RNA Backbone Design von Anand, Rishabh, Joshi, Chaitanya K., Morehead, Alex, Jamasb, Arian R., Harris, Charles, Mathis, Simon V., Didi, Kieran, Ying, Rex, Hooi, Bryan, Liò, Pietro

    Veröffentlicht 2024
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  9. 9
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    Evaluating representation learning on the protein structure universe von Jamasb, Arian R., Morehead, Alex, Joshi, Chaitanya K., Zhang, Zuobai, Didi, Kieran, Mathis, Simon V., Harris, Charles, Tang, Jian, Cheng, Jianlin, Lio, Pietro, Blundell, Tom L.

    Veröffentlicht 2024
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  10. 10
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    Latent-X: An Atom-level Frontier Model for De Novo Protein Binder Design von Latent Labs Team, Bridgland, Alex, Crabbé, Jonathan, Kenlay, Henry, Pretorius, Daniella, Schmon, Sebastian M., Hilmkil, Agrin, Bartke-Croughan, Rebecca, Rombach, Robin, Flashman, Michael, Matteson, Tomas, Mathis, Simon, Nelson, Alexander W. R., Yuan, David, Obika, Annette, Kohl, Simon A. A.

    Veröffentlicht 2025
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  11. 11
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    Drug-like antibodies with low immunogenicity in human panels designed with Latent-X2 von Latent Labs Team, Kenlay, Henry, Pretorius, Daniella, Crabbé, Jonathan, Bridgland, Alex, Schmon, Sebastian M., Hilmkil, Agrin, Vuckovic, James, Mathis, Simon, Matteson, Tomas, Bartke-Croughan, Rebecca, Motmaen, Amir, Rombach, Robin, Vlachynská, Mária, Nelson, Alexander W. R., Yuan, David, Obika, Annette, Kohl, Simon A. A.

    Veröffentlicht 2025
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  12. 12
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    Latent-Y: A Lab-Validated Autonomous Agent for De Novo Drug Design von Latent Labs Team, Schmon, Sebastian M., Pretorius, Daniella, Mathis, Simon, Bartke-Croughan, Rebecca, Puvanendran, Aishaini, Vuckovic, James, Kenlay, Henry, Vlachynská, Mária, Bridgland, Alex, Grishin, Ivan, Over, Sven, Li, David, Li, Bridget, Crabbé, Jonathan, Hilmkil, Agrin, Nelson, Alexander W. R., Yuan, David, Obika, Annette, Kohl, Simon A. A.

    Veröffentlicht 2026
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  13. 13
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    atomworks von Corley, Nathaniel, Mathis, Simon, Krishna, Rohith, Bauer, Magnus S., Thompson, Tuscan R., Ahern, Woody, Kazman, Maxwell W., Brent, Rafael I., Didi, Kieran, Kubaney, Andrew, McHugh, Liam, Nagle, Andrew, Favor, Adam, Kshirsagar, Meghana, Sturmfels, Pascal, Li, Yinuo, Butcher, John, Qiang, Bo, Schaaf, Luna L., Mitra, Ria, Campbell, Kerrie, Zhang, Opa, Weissman, Rose, Humphreys, Ian R., Cong, Qian, Jiang, Hanlun, Funk, Jason, Sonthalia, Satyaki, Lio, Pietro, Baker, David, DiMaio, Frank

    Veröffentlicht 2025
    Fuente: Zenodo
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  14. 14
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    Artificial Intelligence for Science in Quantum, Atomistic, and Continuum Systems von Zhang, Xuan, Wang, Limei, Helwig, Jacob, Luo, Youzhi, Fu, Cong, Xie, Yaochen, Liu, Meng, Lin, Yuchao, Xu, Zhao, Yan, Keqiang, Adams, Keir, Weiler, Maurice, Li, Xiner, Fu, Tianfan, Wang, Yucheng, Strasser, Alex, Yu, Haiyang, Xie, YuQing, Fu, Xiang, Xu, Shenglong, Liu, Yi, Du, Yuanqi, Saxton, Alexandra, Ling, Hongyi, Lawrence, Hannah, Stärk, Hannes, Gui, Shurui, Edwards, Carl, Gao, Nicholas, Ladera, Adriana, Wu, Tailin, Hofgard, Elyssa F., Tehrani, Aria Mansouri, Wang, Rui, Daigavane, Ameya, Bohde, Montgomery, Kurtin, Jerry, Huang, Qian, Phung, Tuong, Xu, Minkai, Joshi, Chaitanya K., Mathis, Simon V., Azizzadenesheli, Kamyar, Fang, Ada, Aspuru-Guzik, Alán, Bekkers, Erik, Bronstein, Michael, Zitnik, Marinka, Anandkumar, Anima, Ermon, Stefano, Liò, Pietro, Yu, Rose, Günnemann, Stephan, Leskovec, Jure, Ji, Heng, Sun, Jimeng, Barzilay, Regina, Jaakkola, Tommi, Coley, Connor W., Qian, Xiaoning, Qian, Xiaofeng, Smidt, Tess, Ji, Shuiwang

    Veröffentlicht 2023
    Fuente: arXiv
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