The URDME manual Version 1.5
Fuente:
arXiv
Salvato in:
| Autore principale: | Engblom, Stefan |
|---|---|
| Natura: | Preprint |
| Pubblicazione: |
2009
|
| Soggetti: | |
| Accesso online: | |
| Tags: |
Aggiungi Tag
Nessun Tag, puoi essere il primo ad aggiungerne!!
|
Documenti analoghi
Modelling Population-Level Hes1 Dynamics: Insights from a Multi-Framework Approach
di: Menz, Gesina, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Menz, Gesina, et al.
Pubblicazione: (2024)
Multi-variable control to mitigate loads in CRISPRa networks: Extended Version
di: Manoj, Krishna, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Manoj, Krishna, et al.
Pubblicazione: (2024)
Competition for binding targets results in paradoxical effects for simultaneous activator and repressor action -- Extended Version
di: Al-Radhawi, M. Ali, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Al-Radhawi, M. Ali, et al.
Pubblicazione: (2024)
Molecular causality in the advent of foundation models
di: Lobentanzer, Sebastian, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Lobentanzer, Sebastian, et al.
Pubblicazione: (2024)
Piezo1 Decodes Mechanical Forces via Allosteric Network Reprogramming
di: Zhang, Yuling, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Zhang, Yuling, et al.
Pubblicazione: (2025)
Modelling 1D Partially Absorbing Boundaries for Brownian Molecular Communication Channels
di: Koca, Caglar, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Koca, Caglar, et al.
Pubblicazione: (2024)
Mathematical modeling of 1,2-propanediol utilization bacterial microcompartments in vivo activity
di: Archer, Andre G., et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Archer, Andre G., et al.
Pubblicazione: (2026)
Decomposable and essentially univariate mass-action systems: Extensions of the deficiency one theorem
di: Deshpande, Abhishek, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Deshpande, Abhishek, et al.
Pubblicazione: (2025)
Parametrized systems of generalized polynomial inequalitites via linear algebra and convex geometry
di: Müller, Stefan, et al.
Pubblicazione: (2023)
di: Müller, Stefan, et al.
Pubblicazione: (2023)
Network Pharmacology Reveals HSPA1A/BST2 as Potential Targets of Ci Bai Capsule's Active Compounds Intervening in Leukopenia
di: Zhang, Dingfan, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Zhang, Dingfan, et al.
Pubblicazione: (2025)
Dynamics of attractor transitions in Boolean networks under noise
di: Min, Byungjoon, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Min, Byungjoon, et al.
Pubblicazione: (2025)
State- versus Reaction-Based Information Processing in Biochemical Networks
di: Moor, Anne-Lena, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Moor, Anne-Lena, et al.
Pubblicazione: (2025)
Reciprocating thermochemical mediator of pre-biotic polymer decomposition on mineral surfaces
di: Ball, Rowena, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Ball, Rowena, et al.
Pubblicazione: (2025)
Curvature-Induced Saturation in Catalytic Reaction Networks: A Differential Geometrical Framework for Modeling Chemical Complexity
di: Rodriguez, Anderson M.
Pubblicazione: (2025)
di: Rodriguez, Anderson M.
Pubblicazione: (2025)
Multicellular control of gene networks
di: Allison, Kyle R.
Pubblicazione: (2025)
di: Allison, Kyle R.
Pubblicazione: (2025)
Why a chloroplast needs its own genome tethered to the thylakoid membrane -- Co-location for Redox Regulation
di: Allen, John F.
Pubblicazione: (2025)
di: Allen, John F.
Pubblicazione: (2025)
Understanding Cellular Noise with Optical Perturbation and Deep Learning
di: Liu, Chuanbo, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Liu, Chuanbo, et al.
Pubblicazione: (2024)
Parsimonious computational inference protocol for Boolean networks: Application to osteogenesis
di: Demongeot, Jacques, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Demongeot, Jacques, et al.
Pubblicazione: (2026)
Co-evolution of replicators and their parasites
di: Spirov, Alexander
Pubblicazione: (2023)
di: Spirov, Alexander
Pubblicazione: (2023)
Effective Kinetics of Chemical Reaction Networks
di: Suda, Tomoharu
Pubblicazione: (2024)
di: Suda, Tomoharu
Pubblicazione: (2024)
Analyzing and Comparing Omicron Lineage Variants Protein-Protein Interaction Network using Centrality Measure
di: Das, Mamata, et al.
Pubblicazione: (2023)
di: Das, Mamata, et al.
Pubblicazione: (2023)
Molecular Network Control Through Boolean Canalization
di: Murrugarra, David, et al.
Pubblicazione: (2015)
di: Murrugarra, David, et al.
Pubblicazione: (2015)
Estimating Propensity Parameters using Google PageRank and Genetic Algorithms
di: Murrugarra, David, et al.
Pubblicazione: (2016)
di: Murrugarra, David, et al.
Pubblicazione: (2016)
NetAurHPD: Network Auralization Hyperlink Prediction Model to Identify Metabolic Pathways from Metabolomics Data
di: Bar-Tov, Tamir, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Bar-Tov, Tamir, et al.
Pubblicazione: (2024)
Enzyme-Substrate Complex Formation Modulates Diffusion-Driven Patterning In Metabolic Pathways
di: Farivar, Faezeh
Pubblicazione: (2025)
di: Farivar, Faezeh
Pubblicazione: (2025)
Evolving Diploid Boolean and Multi-Valued Gene Networks
di: Bull, Larry
Pubblicazione: (2023)
di: Bull, Larry
Pubblicazione: (2023)
A Characterization of Level-k Realizability for Clustering Systems
di: Dai, Shilong, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Dai, Shilong, et al.
Pubblicazione: (2026)
Optimal Inference of Asynchronous Boolean Network Models
di: Karlebach, Guy
Pubblicazione: (2025)
di: Karlebach, Guy
Pubblicazione: (2025)
Exact analytic expressions for discrete first-passage time probability distributions in Markov networks
di: Albert, Jaroslav
Pubblicazione: (2024)
di: Albert, Jaroslav
Pubblicazione: (2024)
PhosNetVis: a web-based tool for fast kinase-substrate enrichment analysis and interactive 2D/3D network visualizations of phosphoproteomics data
di: Rawal, Osho, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Rawal, Osho, et al.
Pubblicazione: (2024)
Genetic studies through the lens of gene networks
di: Subirana-Granés, Marc, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Subirana-Granés, Marc, et al.
Pubblicazione: (2024)
Control of genes by self-organizing multicellular interaction networks
di: Allison, Kyle R.
Pubblicazione: (2026)
di: Allison, Kyle R.
Pubblicazione: (2026)
Emergent kinetics of in vitro transcription from interactions of T7 RNA polymerase and DNA
di: Stover, Nathan M., et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Stover, Nathan M., et al.
Pubblicazione: (2025)
Input-to-state stability-based chemical reaction networks composition for molecular computations
di: Jiang, Renlei, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Jiang, Renlei, et al.
Pubblicazione: (2025)
Structural determinants of soft memory in recurrent biological networks
di: Vidal-Saez, Maria Sol, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Vidal-Saez, Maria Sol, et al.
Pubblicazione: (2025)
Hyperbolic Graph Embeddings Reveal the Host-Pathogen Interactome
di: Xia, Xiaoqiong, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Xia, Xiaoqiong, et al.
Pubblicazione: (2025)
Information Transmission and Processing in G-Protein-Coupled-Receptor Complexes
di: Jones, Roger D., et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Jones, Roger D., et al.
Pubblicazione: (2025)
Alias4SBML: A Python Package for Generating Alias Nodes in SBML Models
di: Heydarabadipour, Adel, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Heydarabadipour, Adel, et al.
Pubblicazione: (2025)
A Gene Ranking Framework Enhances the Design Efficiency of Genome-Scale Constraint-Based Metabolic Networks under Time Limits
di: Ma, Yier, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Ma, Yier, et al.
Pubblicazione: (2025)
Shu: Visualization of high dimensional biological pathways
di: Muriel, Jorge Carrasco, et al.
Pubblicazione: (2023)
di: Muriel, Jorge Carrasco, et al.
Pubblicazione: (2023)
Documenti analoghi
-
Modelling Population-Level Hes1 Dynamics: Insights from a Multi-Framework Approach
di: Menz, Gesina, et al.
Pubblicazione: (2024) -
Multi-variable control to mitigate loads in CRISPRa networks: Extended Version
di: Manoj, Krishna, et al.
Pubblicazione: (2024) -
Competition for binding targets results in paradoxical effects for simultaneous activator and repressor action -- Extended Version
di: Al-Radhawi, M. Ali, et al.
Pubblicazione: (2024) -
Molecular causality in the advent of foundation models
di: Lobentanzer, Sebastian, et al.
Pubblicazione: (2024) -
Piezo1 Decodes Mechanical Forces via Allosteric Network Reprogramming
di: Zhang, Yuling, et al.
Pubblicazione: (2025)