Enregistré dans:
| Auteurs principaux: | Barkan, Casey O., Bruinsma, Robijn F. |
|---|---|
| Format: | Preprint |
| Publié: |
2022
|
| Sujets: | |
| Accès en ligne: | https://arxiv.org/abs/2209.03324 |
| Tags: |
Ajouter un tag
Pas de tags, Soyez le premier à ajouter un tag!
|
Documents similaires
SwitchCraft: A Programmatic Framework for Designing State-Switching Proteins
par: Jing, Bowen, et autres
Publié: (2026)
par: Jing, Bowen, et autres
Publié: (2026)
Full-Atom Peptide Design with Geometric Latent Diffusion
par: Kong, Xiangzhe, et autres
Publié: (2024)
par: Kong, Xiangzhe, et autres
Publié: (2024)
Ligand Pose Generation via QUBO-Based Hotspot Sampling and Geometric Triplet Matching
par: Yang, Pei-Kun
Publié: (2025)
par: Yang, Pei-Kun
Publié: (2025)
Modelling multiscale architecture of biofilm extracellular matrix and its role in oxygen transport
par: Moorthy, Raghu K., et autres
Publié: (2025)
par: Moorthy, Raghu K., et autres
Publié: (2025)
Electrostatics of Salt-Dependent Reentrant Phase Behaviors Highlights Diverse Roles of ATP in Biomolecular Condensates
par: Lin, Yi-Hsuan, et autres
Publié: (2024)
par: Lin, Yi-Hsuan, et autres
Publié: (2024)
Joint Geometric-Chemical Distance for Protein Surfaces
par: Swami, Himanshu, et autres
Publié: (2026)
par: Swami, Himanshu, et autres
Publié: (2026)
Simultaneous Fragment Docking for Geometrically Linkable Pose Pairs
par: Lee, Jiyun, et autres
Publié: (2026)
par: Lee, Jiyun, et autres
Publié: (2026)
Torsion-Space Diffusion for Protein Backbone Generation with Geometric Refinement
par: Singh, Lakshaditya, et autres
Publié: (2025)
par: Singh, Lakshaditya, et autres
Publié: (2025)
Geometric-informed GFlowNets for Structure-Based Drug Design
par: Lee, Grayson, et autres
Publié: (2024)
par: Lee, Grayson, et autres
Publié: (2024)
p2smi: A Python Toolkit for Peptide FASTA-to-SMILES Conversion and Molecular Property Analysis
par: Feller, Aaron L., et autres
Publié: (2025)
par: Feller, Aaron L., et autres
Publié: (2025)
GeoGraph: Geometric and Graph-based Ensemble Descriptors for Intrinsically Disordered Proteins
par: Quinn, Eoin, et autres
Publié: (2025)
par: Quinn, Eoin, et autres
Publié: (2025)
A Geometric Graph-Based Deep Learning Model for Drug-Target Affinity Prediction
par: Rana, Md Masud, et autres
Publié: (2025)
par: Rana, Md Masud, et autres
Publié: (2025)
Identifying critical residues of a protein using meaningfully-thresholded Random Geometric Graphs
par: Zhang, Chuqiao, et autres
Publié: (2025)
par: Zhang, Chuqiao, et autres
Publié: (2025)
ContactNet: Geometric-Based Deep Learning Model for Predicting Protein-Protein Interactions
par: Halfon, Matan, et autres
Publié: (2024)
par: Halfon, Matan, et autres
Publié: (2024)
Disordered But Rhythmic: the role of intrinsic protein disorder in eukaryotic circadian timing
par: Usher, Emery T., et autres
Publié: (2025)
par: Usher, Emery T., et autres
Publié: (2025)
EquiPocket: an E(3)-Equivariant Geometric Graph Neural Network for Ligand Binding Site Prediction
par: Zhang, Yang, et autres
Publié: (2023)
par: Zhang, Yang, et autres
Publié: (2023)
The standard coil or globule phases cannot describe the denatured state of structured proteins and intrinsically disordered proteins
par: Righini, F., et autres
Publié: (2025)
par: Righini, F., et autres
Publié: (2025)
Rotational Dynamics of ATP Synthase: Mechanical Constraints and Energy Dissipative Channels
par: Matar, Islam K., et autres
Publié: (2025)
par: Matar, Islam K., et autres
Publié: (2025)
Assessment of scoring functions for computational models of protein-protein interfaces
par: Sumner, Jacob, et autres
Publié: (2024)
par: Sumner, Jacob, et autres
Publié: (2024)
Fluorescence Phasor Analysis: Basic Principles and Biophysical Applications
par: Angelini, Alvaro A. Recoulat, et autres
Publié: (2025)
par: Angelini, Alvaro A. Recoulat, et autres
Publié: (2025)
Exploring Data-Driven Chemical SMILES Tokenization Approaches to Identify Key Protein-Ligand Binding Moieties
par: Temizer, Asu Büşra, et autres
Publié: (2022)
par: Temizer, Asu Büşra, et autres
Publié: (2022)
Unveiling Scaling Behaviors in Molecular Language Models: Effects of Model Size, Data, and Representation
par: Xu, Dong, et autres
Publié: (2026)
par: Xu, Dong, et autres
Publié: (2026)
The role of topology on protein thermal stability
par: Especial, João N. C., et autres
Publié: (2025)
par: Especial, João N. C., et autres
Publié: (2025)
Decoding Polyphenol-Protein Interactions with Deep Learning: From Molecular Mechanisms to Food Applications
par: Liu, Qiang, et autres
Publié: (2025)
par: Liu, Qiang, et autres
Publié: (2025)
Animal-associated marine Acidobacteria with a rich natural product repertoire
par: Leopold-Messer, Stefan, et autres
Publié: (2024)
par: Leopold-Messer, Stefan, et autres
Publié: (2024)
Dynamic PDB: A New Dataset and a SE(3) Model Extension by Integrating Dynamic Behaviors and Physical Properties in Protein Structures
par: Liu, Ce, et autres
Publié: (2024)
par: Liu, Ce, et autres
Publié: (2024)
Geometric-Facilitated Denoising Diffusion Model for 3D Molecule Generation
par: Xu, Can, et autres
Publié: (2024)
par: Xu, Can, et autres
Publié: (2024)
gRNAde: Geometric Deep Learning for 3D RNA inverse design
par: Joshi, Chaitanya K., et autres
Publié: (2023)
par: Joshi, Chaitanya K., et autres
Publié: (2023)
Geometric Self-Supervised Pretraining on 3D Protein Structures using Subgraphs
par: Chatzianastasis, Michail, et autres
Publié: (2024)
par: Chatzianastasis, Michail, et autres
Publié: (2024)
De novo design of high-affinity protein binders with AlphaProteo
par: Zambaldi, Vinicius, et autres
Publié: (2024)
par: Zambaldi, Vinicius, et autres
Publié: (2024)
On diffusion posterior sampling via sequential Monte Carlo for zero-shot scaffolding of protein motifs
par: Young, James Matthew, et autres
Publié: (2024)
par: Young, James Matthew, et autres
Publié: (2024)
Community recommendations on cryoEM data archiving and validation
par: Kleywegt, Gerard J., et autres
Publié: (2023)
par: Kleywegt, Gerard J., et autres
Publié: (2023)
The need to implement FAIR principles in biomolecular simulations
par: Amaro, Rommie, et autres
Publié: (2024)
par: Amaro, Rommie, et autres
Publié: (2024)
Statistical Survey of Chemical and Geometric Patterns on Protein Surfaces as a Blueprint for Protein-mimicking Nanoparticles
par: McBride, John M., et autres
Publié: (2024)
par: McBride, John M., et autres
Publié: (2024)
BioLM-Score: Language-Prior Conditioned Probabilistic Geometric Potentials for Protein-Ligand Scoring
par: Yang, Zhangfan, et autres
Publié: (2026)
par: Yang, Zhangfan, et autres
Publié: (2026)
Score-based 3D molecule generation with neural fields
par: Kirchmeyer, Matthieu, et autres
Publié: (2025)
par: Kirchmeyer, Matthieu, et autres
Publié: (2025)
Active Liquid-Liquid Phase-Separation in a Confining Environment
par: Lin, Chen, et autres
Publié: (2024)
par: Lin, Chen, et autres
Publié: (2024)
ApexGen: Simultaneous design of peptide binder sequence and structure for target proteins
par: Xia, Xiaoqiong, et autres
Publié: (2025)
par: Xia, Xiaoqiong, et autres
Publié: (2025)
Metrology of Complexity and Implications for the Study of the Emergence of Life
par: Walker, Sara Imari
Publié: (2026)
par: Walker, Sara Imari
Publié: (2026)
SeedProteo: Accurate De Novo All-Atom Design of Protein Binders
par: Qu, Wei, et autres
Publié: (2025)
par: Qu, Wei, et autres
Publié: (2025)
Documents similaires
-
SwitchCraft: A Programmatic Framework for Designing State-Switching Proteins
par: Jing, Bowen, et autres
Publié: (2026) -
Full-Atom Peptide Design with Geometric Latent Diffusion
par: Kong, Xiangzhe, et autres
Publié: (2024) -
Ligand Pose Generation via QUBO-Based Hotspot Sampling and Geometric Triplet Matching
par: Yang, Pei-Kun
Publié: (2025) -
Modelling multiscale architecture of biofilm extracellular matrix and its role in oxygen transport
par: Moorthy, Raghu K., et autres
Publié: (2025) -
Electrostatics of Salt-Dependent Reentrant Phase Behaviors Highlights Diverse Roles of ATP in Biomolecular Condensates
par: Lin, Yi-Hsuan, et autres
Publié: (2024)