Buchumschlag

On the Mathematics of RNA Velocity II: Algorithmic Aspects

Fuente: arXiv

Gespeichert in:

Bibliographische Detailangaben
Hauptverfasser:	Li, Tiejun, Wang, Yizhuo, Yang, Guoguo, Zhou, Peijie
Format:	Preprint
Veröffentlicht:	2023
Schlagworte:	Numerical Analysis Genomics
Online-Zugang:	Acceder al recurso
Tags:	Tag hinzufügen Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!

Ähnliche Einträge

Penalized Principal Component Analysis Using Smoothing
von: Hurwitz, Rebecca M., et al.
Veröffentlicht: (2023)

WFR-MFM: One-Step Inference for Dynamic Unbalanced Optimal Transport
von: Wang, Xinyu, et al.
Veröffentlicht: (2026)

scCluBench: Comprehensive Benchmarking of Clustering Algorithms for Single-Cell RNA Sequencing
von: Xu, Ping, et al.
Veröffentlicht: (2025)

From Permits to Samples: Addressing Key Challenges for High-Quality Reference Genome Generation in Europe.
von: Reichel, Katja, et al.
Veröffentlicht: (2026)

CellStream: Dynamical Optimal Transport Informed Embeddings for Reconstructing Cellular Trajectories from Snapshots Data
von: Ling, Yue, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Partial domain adaptation enables cross domain cell type annotation between scRNA-seq and snRNA-seq
von: Chen, Xiran, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Genome sequence of the Mediterranean red coral Corallium rubrum.
von: Ganot, Philippe, et al.
Veröffentlicht: (2024)

MBGD: Microbial Genome Database for Comparative Analysis Featuring Enhanced Functionality to Characterize Gene and Genome Functions Through Large-scale Orthology Analysis.
von: Uchiyama, Ikuo, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Integrative analysis of ATAC-seq and RNA-seq for cells infected by human T-cell leukemia virus type 1
von: Tanaka, Azusa, et al.
Veröffentlicht: (2023)

Simultaneously Infer Cell Pseudotime,Velocity Field and Gene Interaction from Multi-Branch scRNA-seq Data with scPN
von: Zhou, Zhen, et al.
Veröffentlicht: (2024)

Timestamp calibration for time-series single cell RNA-seq expression data
von: Chen, Xiran, et al.
Veröffentlicht: (2024)

SiCmiR Atlas: Single-Cell miRNA Landscapes Reveals Hub-miRNA and Network Signatures in Human Cancers
von: Cai, Xiao-Xuan, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Categorization and analysis of 14 computational methods for estimating cell potency from single-cell RNA-seq data
von: Wang, Qingyang, et al.
Veröffentlicht: (2023)

Bridging Sequence-Structure Alignment in RNA Foundation Models
von: Yang, Heng, et al.
Veröffentlicht: (2024)

scUnified: An AI-Ready Standardized Resource for Single-Cell RNA Sequencing Analysis
von: Xu, Ping, et al.
Veröffentlicht: (2025)

scInterpreter: Training Large Language Models to Interpret scRNA-seq Data for Cell Type Annotation
von: Li, Cong, et al.
Veröffentlicht: (2024)

DNAMotifTokenizer: Towards Biologically Informed Tokenization of Genomic Sequences
von: Zhou, Xiaoxiao, et al.
Veröffentlicht: (2025)

scX: A user-friendly tool for scRNA-seq exploration
von: Waichman, Tomás Vega, et al.
Veröffentlicht: (2023)

A Graphical Method for Identifying Gene Clusters from RNA Sequencing Data
von: Patock, Jake R., et al.
Veröffentlicht: (2025)

GVAtlas: Pioneering Genomic Variant Analysis and Visualization for SARS CoV 2 and Beyond
von: Tahir, Bhatti, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Mix-Geneformer: Unified Representation Learning for Human and Mouse scRNA-seq Data
von: Nishio, Yuki, et al.
Veröffentlicht: (2025)

M6A Modification and Transcription Analysis of LncRNA in Cerebral Ischemia/Reperfusion Injury
von: Jierong Mo, et al.
Veröffentlicht: (2024)

Robust Clustering Analysis of Genes Related to Age-related Macular Degeneration using RNA-Seq
von: Gutierrez, Brayan, et al.
Veröffentlicht: (2026)

HybridQC: Machine Learning-Augmented Quality Control for Single-Cell RNA-seq Data
von: Lai, Kaitao
Veröffentlicht: (2025)

Functional characterization of protein SUMOylation in the miRNA transcription regulation during heat stress in Arabidopsis
von: Simin Xia, et al.
Veröffentlicht: (2024)

Predicting Breast Cancer Phenotypes from Single-cell RNA-seq Data Using CloudPred
von: Moghimianavval, Hossein, et al.
Veröffentlicht: (2024)

An improved, high yield method for isolating nuclei from individual zebrafish embryos for single-nucleus RNA sequencing
von: Rostomily, Clifford, et al.
Veröffentlicht: (2024)

Meta-analysis of scRNA-seq data for choroidal endothelial cells in dry Age-related Macular Degeneration
von: Veksler, Kyle M., et al.
Veröffentlicht: (2026)

Polarization-Induced Beam Bending: Mathematical Model, Discretization, and Algorithm
von: Antil, Harbir, et al.
Veröffentlicht: (2026)

Recovery of the Interface Velocity for the Incompressible Flow in Enhanced Velocity Mixed Finite Element Method
von: Amanbek, Yerlan, et al.
Veröffentlicht: (2019)

Phylogenomic workflow for uncultivable microbial eukaryotes using single-cell RNA sequencing - A case study with planktonic ciliates (Ciliophora, Oligotrichea).
von: Shazib, Shahed U A, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Minimum-Cost Synthetic Genome Planning: An Algorithmic Framework
von: Patsakis, Michail, et al.
Veröffentlicht: (2025)

JojoSCL: Shrinkage Contrastive Learning for single-cell RNA sequence Clustering
von: Wang, Ziwen
Veröffentlicht: (2025)

Knowledge-Guided Biomarker Identification for Label-Free Single-Cell RNA-Seq Data: A Reinforcement Learning Perspective
von: Xiao, Meng, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Bipartite Graph Attention-based Clustering for Large-scale scRNA-seq Data
von: Liang, Zhuomin, et al.
Veröffentlicht: (2026)

Complete genome sequence of Lysinibacillus sp. WB86, a potential antimicrobial lanthipeptides producer.
von: Sun, Huai-Ying, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Helix-mRNA: A Hybrid Foundation Model For Full Sequence mRNA Therapeutics
von: Wood, Matthew, et al.
Veröffentlicht: (2025)

scBench: Evaluating AI Agents on Single-Cell RNA-seq Analysis
von: Workman, Kenny, et al.
Veröffentlicht: (2026)

CodonMoE: DNA Language Models for mRNA Analyses
von: Du, Shiyi, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Algorithmic analysis towards time-domain extended source waveform inversion
von: Yang, Pengliang, et al.
Veröffentlicht: (2022)