CTAGE: Curvature-Based Topology-Aware Graph Embedding for Learning Molecular Representations
Fuente:
arXiv
Gespeichert in:
| Hauptverfasser: | Chen, Yili, Li, Zhengyu, Wan, Zheng, Yu, Hui, Wei, Xian |
|---|---|
| Format: | Preprint |
| Veröffentlicht: |
2023
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| Schlagworte: | |
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