Automated Annotation of Scientific Texts for ML-based Keyphrase Extraction and Validation
Fuente:
arXiv
Salvato in:
| Autori principali: | Amusat, Oluwamayowa O., Hegde, Harshad, Mungall, Christopher J., Giannakou, Anna, Byers, Neil P., Gunter, Dan, Fagnan, Kjiersten, Ramakrishnan, Lavanya |
|---|---|
| Natura: | Preprint |
| Pubblicazione: |
2023
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