Progressive Multi-Modality Learning for Inverse Protein Folding
Fuente:
arXiv
Enregistré dans:
| Auteurs principaux: | Zheng, Jiangbin, Li, Stan Z. |
|---|---|
| Format: | Preprint |
| Publié: |
2023
|
| Sujets: | |
| Accès en ligne: | |
| Tags: |
Ajouter un tag
Pas de tags, Soyez le premier à ajouter un tag!
|
Documents similaires
CCPL: Cross-modal Contrastive Protein Learning
par: Zheng, Jiangbin, et autres
Publié: (2023)
par: Zheng, Jiangbin, et autres
Publié: (2023)
Graph-level Protein Representation Learning by Structure Knowledge Refinement
par: Wang, Ge, et autres
Publié: (2024)
par: Wang, Ge, et autres
Publié: (2024)
Pan-protein Design Learning Enables Task-adaptive Generalization for Low-resource Enzyme Design
par: Zheng, Jiangbin, et autres
Publié: (2024)
par: Zheng, Jiangbin, et autres
Publié: (2024)
DapPep: Domain Adaptive Peptide-agnostic Learning for Universal T-cell Receptor-antigen Binding Affinity Prediction
par: Zheng, Jiangbin, et autres
Publié: (2024)
par: Zheng, Jiangbin, et autres
Publié: (2024)
Bridge-IF: Learning Inverse Protein Folding with Markov Bridges
par: Zhu, Yiheng, et autres
Publié: (2024)
par: Zhu, Yiheng, et autres
Publié: (2024)
MetaEnzyme: Meta Pan-Enzyme Learning for Task-Adaptive Redesign
par: Zheng, Jiangbin, et autres
Publié: (2024)
par: Zheng, Jiangbin, et autres
Publié: (2024)
FoldToken: Learning Protein Language via Vector Quantization and Beyond
par: Gao, Zhangyang, et autres
Publié: (2024)
par: Gao, Zhangyang, et autres
Publié: (2024)
UniIF: Unified Molecule Inverse Folding
par: Gao, Zhangyang, et autres
Publié: (2024)
par: Gao, Zhangyang, et autres
Publié: (2024)
FoldToken2: Learning compact, invariant and generative protein structure language
par: Gao, Zhangyang, et autres
Publié: (2024)
par: Gao, Zhangyang, et autres
Publié: (2024)
Property-driven Protein Inverse Folding With Multi-Objective Preference Alignment
par: Hou, Xiaoyang, et autres
Publié: (2026)
par: Hou, Xiaoyang, et autres
Publié: (2026)
VQDNA: Unleashing the Power of Vector Quantization for Multi-Species Genomic Sequence Modeling
par: Li, Siyuan, et autres
Publié: (2024)
par: Li, Siyuan, et autres
Publié: (2024)
Diffusion Model with Representation Alignment for Protein Inverse Folding
par: Wang, Chenglin, et autres
Publié: (2024)
par: Wang, Chenglin, et autres
Publié: (2024)
RadDiff: Retrieval-Augmented Denoising Diffusion for Protein Inverse Folding
par: Han, Jin, et autres
Publié: (2025)
par: Han, Jin, et autres
Publié: (2025)
Cross-Gate MLP with Protein Complex Invariant Embedding is A One-Shot Antibody Designer
par: Tan, Cheng, et autres
Publié: (2023)
par: Tan, Cheng, et autres
Publié: (2023)
EnerBridge-DPO: Energy-Guided Protein Inverse Folding with Markov Bridges and Direct Preference Optimization
par: Rong, Dingyi, et autres
Publié: (2025)
par: Rong, Dingyi, et autres
Publié: (2025)
Dynamics-inspired Structure Hallucination for Protein-protein Interaction Modeling
par: Wu, Fang, et autres
Publié: (2026)
par: Wu, Fang, et autres
Publié: (2026)
Learning Cell-Aware Hierarchical Multi-Modal Representations for Robust Molecular Modeling
par: Li, Mengran, et autres
Publié: (2025)
par: Li, Mengran, et autres
Publié: (2025)
MogaNet: Multi-order Gated Aggregation Network
par: Li, Siyuan, et autres
Publié: (2022)
par: Li, Siyuan, et autres
Publié: (2022)
ProtCLIP: Function-Informed Protein Multi-Modal Learning
par: Zhou, Hanjing, et autres
Publié: (2024)
par: Zhou, Hanjing, et autres
Publié: (2024)
Classifying Metamorphic versus Single-Fold Proteins with Statistical Learning and AlphaFold2
par: Chen, Yongkai, et autres
Publié: (2025)
par: Chen, Yongkai, et autres
Publié: (2025)
Boltzmann-Aligned Inverse Folding Model as a Predictor of Mutational Effects on Protein-Protein Interactions
par: Jiao, Xiaoran, et autres
Publié: (2024)
par: Jiao, Xiaoran, et autres
Publié: (2024)
Learning to Predict Mutation Effects of Protein-Protein Interactions by Microenvironment-aware Hierarchical Prompt Learning
par: Wu, Lirong, et autres
Publié: (2024)
par: Wu, Lirong, et autres
Publié: (2024)
A Novel Framework for Multi-Modal Protein Representation Learning
par: Zheng, Runjie, et autres
Publié: (2025)
par: Zheng, Runjie, et autres
Publié: (2025)
PSC-CPI: Multi-Scale Protein Sequence-Structure Contrasting for Efficient and Generalizable Compound-Protein Interaction Prediction
par: Wu, Lirong, et autres
Publié: (2024)
par: Wu, Lirong, et autres
Publié: (2024)
Multi-Modal CLIP-Informed Protein Editing
par: Yin, Mingze, et autres
Publié: (2024)
par: Yin, Mingze, et autres
Publié: (2024)
Learning Progressive Adaptation for Multi-Modal Tracking
par: Wang, He, et autres
Publié: (2026)
par: Wang, He, et autres
Publié: (2026)
Deciphering RNA Secondary Structure Prediction: A Probabilistic K-Rook Matching Perspective
par: Tan, Cheng, et autres
Publié: (2022)
par: Tan, Cheng, et autres
Publié: (2022)
Enhancing Protein Predictive Models via Proteins Data Augmentation: A Benchmark and New Directions
par: Sun, Rui, et autres
Publié: (2024)
par: Sun, Rui, et autres
Publié: (2024)
Omni-DNA: A Unified Genomic Foundation Model for Cross-Modal and Multi-Task Learning
par: Li, Zehui, et autres
Publié: (2025)
par: Li, Zehui, et autres
Publié: (2025)
Cross-Modal Bayesian Low-Rank Adaptation for Uncertainty-Aware Multimodal Learning
par: Naderi, Habibeh, et autres
Publié: (2026)
par: Naderi, Habibeh, et autres
Publié: (2026)
Bidirectional Hierarchical Protein Multi-Modal Representation Learning
par: Liu, Xuefeng, et autres
Publié: (2025)
par: Liu, Xuefeng, et autres
Publié: (2025)
dyAb: Flow Matching for Flexible Antibody Design with AlphaFold-driven Pre-binding Antigen
par: Tan, Cheng, et autres
Publié: (2025)
par: Tan, Cheng, et autres
Publié: (2025)
Quantifying the Role of OpenFold Components in Protein Structure Prediction
par: Hayes, Tyler L., et autres
Publié: (2025)
par: Hayes, Tyler L., et autres
Publié: (2025)
A Multi-Modal Non-Invasive Deep Learning Framework for Progressive Prediction of Seizures
par: Saeizadeh, Ali, et autres
Publié: (2024)
par: Saeizadeh, Ali, et autres
Publié: (2024)
Discovering the Representation Bottleneck of Graph Neural Networks
par: Wu, Fang, et autres
Publié: (2022)
par: Wu, Fang, et autres
Publié: (2022)
PRING: Rethinking Protein-Protein Interaction Prediction from Pairs to Graphs
par: Zheng, Xinzhe, et autres
Publié: (2025)
par: Zheng, Xinzhe, et autres
Publié: (2025)
PFMBench: Protein Foundation Model Benchmark
par: Gao, Zhangyang, et autres
Publié: (2025)
par: Gao, Zhangyang, et autres
Publié: (2025)
Improving Inverse Folding for Peptide Design with Diversity-regularized Direct Preference Optimization
par: Park, Ryan, et autres
Publié: (2024)
par: Park, Ryan, et autres
Publié: (2024)
HelixFold-Multimer: Elevating Protein Complex Structure Prediction to New Heights
par: Fang, Xiaomin, et autres
Publié: (2024)
par: Fang, Xiaomin, et autres
Publié: (2024)
Lattice Protein Folding with Variational Annealing
par: Khandoker, Shoummo Ahsan, et autres
Publié: (2025)
par: Khandoker, Shoummo Ahsan, et autres
Publié: (2025)
Documents similaires
-
CCPL: Cross-modal Contrastive Protein Learning
par: Zheng, Jiangbin, et autres
Publié: (2023) -
Graph-level Protein Representation Learning by Structure Knowledge Refinement
par: Wang, Ge, et autres
Publié: (2024) -
Pan-protein Design Learning Enables Task-adaptive Generalization for Low-resource Enzyme Design
par: Zheng, Jiangbin, et autres
Publié: (2024) -
DapPep: Domain Adaptive Peptide-agnostic Learning for Universal T-cell Receptor-antigen Binding Affinity Prediction
par: Zheng, Jiangbin, et autres
Publié: (2024) -
Bridge-IF: Learning Inverse Protein Folding with Markov Bridges
par: Zhu, Yiheng, et autres
Publié: (2024)