Buchumschlag

Multi-Modal Representation Learning for Molecular Property Prediction: Sequence, Graph, Geometry

Fuente: arXiv

Gespeichert in:

Bibliographische Detailangaben
Hauptverfasser:	Wang, Zeyu, Jiang, Tianyi, Wang, Jinhuan, Xuan, Qi
Format:	Preprint
Veröffentlicht:	2024
Schlagworte:	Molecular Networks Machine Learning Biomolecules
Online-Zugang:	Acceder al recurso
Tags:	Tag hinzufügen Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!

Ähnliche Einträge

When Does Context Help? A Systematic Study of Target-Conditional Molecular Property Prediction
von: Cheng, Bryan, et al.
Veröffentlicht: (2026)

GFlowNets for Learning Better Drug-Drug Interaction Representations
von: Wasi, Azmine Toushik
Veröffentlicht: (2025)

ProLLM: Protein Chain-of-Thoughts Enhanced LLM for Protein-Protein Interaction Prediction
von: Jin, Mingyu, et al.
Veröffentlicht: (2024)

Graph Representation Learning in Biomedicine
von: Li, Michelle M., et al.
Veröffentlicht: (2021)

PRING: Rethinking Protein-Protein Interaction Prediction from Pairs to Graphs
von: Zheng, Xinzhe, et al.
Veröffentlicht: (2025)

CADGL: Context-Aware Deep Graph Learning for Predicting Drug-Drug Interactions
von: Wasi, Azmine Toushik, et al.
Veröffentlicht: (2024)

Reading the Cell, Designing the Cure: Perturbation-Conditioned Molecular Diffusion for Function-Oriented Drug Design
von: Xu, Ziyu, et al.
Veröffentlicht: (2026)

The Protective Effects of the Ethyl Acetate Part of Er Miao San on Adjuvant Arthritis Rats by Regulating the Function of Bone Marrow-Derived Dendritic Cells
von: Ding, Jie-Min, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Graph Representation Learning Strategies for Omics Data: A Case Study on Parkinson's Disease
von: de Lope, Elisa Gómez, et al.
Veröffentlicht: (2024)

Pesti-Gen: Unleashing a Generative Molecule Approach for Toxicity Aware Pesticide Design
von: Kim, Taehan, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Multi-variable control to mitigate loads in CRISPRa networks: Extended Version
von: Manoj, Krishna, et al.
Veröffentlicht: (2024)

Investigating Knowledge Distillation Through Neural Networks for Protein Binding Affinity Prediction
von: Abbasi, Wajid Arshad, et al.
Veröffentlicht: (2026)

Relief of EGFR/FOS-downregulated miR-103a by loganin alleviates NF-kappaB-triggered inflammation and gut barrier disruption in colitis
von: Li, Yan, et al.
Veröffentlicht: (2025)

MetaboKG: An Analysis-centric Knowledge Graph Framework for Untargeted Metabolomics
von: Féraud, Matthieu, et al.
Veröffentlicht: (2026)

Learning Hierarchical Interaction for Accurate Molecular Property Prediction
von: Hong, Huiyang, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Competition for binding targets results in paradoxical effects for simultaneous activator and repressor action -- Extended Version
von: Al-Radhawi, M. Ali, et al.
Veröffentlicht: (2024)

Design of DNA Strand Displacement Reactions
von: Jurinović, Križan, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Variant effects on protein-protein interactions: methods, models and diseases
von: Larsen-Ledet, Sven, et al.
Veröffentlicht: (2025)

ProCaliper: functional and structural analysis, visualization, and annotation of proteins
von: Rozum, Jordan C., et al.
Veröffentlicht: (2025)

MultiModal-Learning for Predicting Molecular Properties: A Framework Based on Image and Graph Structures
von: Wang, Zhuoyuan, et al.
Veröffentlicht: (2023)

The optimization of crop response to climatic stress through modulation of plant stress response mechanisms. Opportunities for biostimulants and plant hormones to meet climate challenges
von: Li, Jing, et al.
Veröffentlicht: (2025)

MoRSAIK: Sequence Motif Reactor Simulation, Analysis and Inference Kit in Python
von: Harth-Kitzerow, Johannes, et al.
Veröffentlicht: (2025)

DeepRetro: Retrosynthetic Pathway Discovery using Iterative LLM Reasoning
von: Sathyanarayana, Shreyas Vinaya, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Selective advantage of aerobic glycolysis over oxidative phosphorylation
von: Vazquez, Alexei
Veröffentlicht: (2024)

Single-Cell Proteomic Technologies: Tools in the quest for principles
von: Slavov, Nikolai
Veröffentlicht: (2025)

DeepAutoPIN: An automorphism orbits based deep neural network for characterizing the organizational diversity of protein interactomes across the tree of life
von: Singh, Vikram, et al.
Veröffentlicht: (2022)

Thermodynamic free energy map for the non-oxidative glycolysis pathways
von: Pal, Adittya
Veröffentlicht: (2025)

Graph Diffusion Transformers for Multi-Conditional Molecular Generation
von: Liu, Gang, et al.
Veröffentlicht: (2024)

ZeroDDI: A Zero-Shot Drug-Drug Interaction Event Prediction Method with Semantic Enhanced Learning and Dual-Modal Uniform Alignment
von: Wang, Ziyan, et al.
Veröffentlicht: (2024)

Learning Multi-view Molecular Representations with Structured and Unstructured Knowledge
von: Luo, Yizhen, et al.
Veröffentlicht: (2024)

Uncertainty Quantification for Molecular Property Predictions with Graph Neural Architecture Search
von: Jiang, Shengli, et al.
Veröffentlicht: (2023)

Ligandformer: A Graph Neural Network for Predicting Compound Property with Robust Interpretation
von: Guo, Jinjiang, et al.
Veröffentlicht: (2022)

Multi-Scale Representation Learning for Protein Fitness Prediction
von: Zhang, Zuobai, et al.
Veröffentlicht: (2024)

Investigating Graph Neural Networks and Classical Feature-Extraction Techniques in Activity-Cliff and Molecular Property Prediction
von: Dablander, Markus
Veröffentlicht: (2024)

Global Human-guided Counterfactual Explanations for Molecular Properties via Reinforcement Learning
von: Wang, Danqing, et al.
Veröffentlicht: (2024)

Improving Paratope and Epitope Prediction by Multi-Modal Contrastive Learning and Interaction Informativeness Estimation
von: Wang, Zhiwei, et al.
Veröffentlicht: (2024)

Curriculum Learning for Biological Sequence Prediction: The Case of De Novo Peptide Sequencing
von: Zhang, Xiang, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Towards Efficient Molecular Property Optimization with Graph Energy Based Models
von: Miglior, Luca, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Elemental Stoichiometry as an Ecological Biosignature with Applications to Life Detection
von: Vergeli, Pilar C., et al.
Veröffentlicht: (2026)

Integrating Chemical Language and Molecular Graph in Multimodal Fused Deep Learning for Drug Property Prediction
von: Lu, Xiaohua, et al.
Veröffentlicht: (2023)