Diffusion-Driven Generative Framework for Molecular Conformation Prediction
Fuente:
arXiv
Gespeichert in:
| Hauptverfasser: | Yang, Bobin, Deng, Jie, Chen, Zhenghan, Wu, Ruoxue |
|---|---|
| Format: | Preprint |
| Veröffentlicht: |
2023
|
| Schlagworte: | |
| Online-Zugang: | |
| Tags: |
Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
|
Ähnliche Einträge
Equivariant Blurring Diffusion for Hierarchical Molecular Conformer Generation
von: Park, Jiwoong, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Park, Jiwoong, et al.
Veröffentlicht: (2024)
WGFormer: An SE(3)-Transformer Driven by Wasserstein Gradient Flows for Molecular Ground-State Conformation Prediction
von: Wang, Fanmeng, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Wang, Fanmeng, et al.
Veröffentlicht: (2024)
MultiModal-Learning for Predicting Molecular Properties: A Framework Based on Image and Graph Structures
von: Wang, Zhuoyuan, et al.
Veröffentlicht: (2023)
von: Wang, Zhuoyuan, et al.
Veröffentlicht: (2023)
Re-Dock: Towards Flexible and Realistic Molecular Docking with Diffusion Bridge
von: Huang, Yufei, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Huang, Yufei, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Two-Stage Pretraining for Molecular Property Prediction in the Wild
von: Wijaya, Kevin Tirta, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Wijaya, Kevin Tirta, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Text-guided Diffusion Model for 3D Molecule Generation
von: Luo, Yanchen, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Luo, Yanchen, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Tokenization for Molecular Foundation Models
von: Wadell, Alexius, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Wadell, Alexius, et al.
Veröffentlicht: (2024)
EquiBoost: An Equivariant Boosting Approach to Molecular Conformation Generation
von: Yang, Yixuan, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Yang, Yixuan, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Superior Molecular Representations from Intermediate Encoder Layers
von: Pinto, Luis
Veröffentlicht: (2025)
von: Pinto, Luis
Veröffentlicht: (2025)
GraphBPE: Molecular Graphs Meet Byte-Pair Encoding
von: Shen, Yuchen, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Shen, Yuchen, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Pre-trained Molecular Language Models with Random Functional Group Masking
von: Peng, Tianhao, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Peng, Tianhao, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Mol-LLM: Multimodal Generalist Molecular LLM with Improved Graph Utilization
von: Lee, Chanhui, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Lee, Chanhui, et al.
Veröffentlicht: (2025)
General Binding Affinity Guidance for Diffusion Models in Structure-Based Drug Design
von: Jian, Yue, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Jian, Yue, et al.
Veröffentlicht: (2024)
ControlMol: Adding Substructure Control To Molecule Diffusion Models
von: Zhengyang, Qi, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Zhengyang, Qi, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Instruction-Based Molecular Graph Generation with Unified Text-Graph Diffusion Model
von: Xiang, Yuran, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Xiang, Yuran, et al.
Veröffentlicht: (2024)
EquiFlow: Equivariant Conditional Flow Matching with Optimal Transport for 3D Molecular Conformation Prediction
von: Tian, Qingwen, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Tian, Qingwen, et al.
Veröffentlicht: (2024)
ToxBench: A Binding Affinity Prediction Benchmark with AB-FEP-Calculated Labels for Human Estrogen Receptor Alpha
von: Liu, Meng, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Liu, Meng, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Generative Artificial Intelligence for Navigating Synthesizable Chemical Space
von: Gao, Wenhao, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Gao, Wenhao, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Unified Generative Modeling of 3D Molecules via Bayesian Flow Networks
von: Song, Yuxuan, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Song, Yuxuan, et al.
Veröffentlicht: (2024)
REBIND: Enhancing ground-state molecular conformation via force-based graph rewiring
von: Kim, Taewon, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Kim, Taewon, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Multi-objective fluorescent molecule design with a data-physics dual-driven generative framework
von: Li, Yanheng, et al.
Veröffentlicht: (2026)
von: Li, Yanheng, et al.
Veröffentlicht: (2026)
Training-Free Guidance for Discrete Diffusion Models for Molecular Generation
von: Kerby, Thomas J., et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Kerby, Thomas J., et al.
Veröffentlicht: (2024)
Models Matter: The Impact of Single-Step Retrosynthesis on Synthesis Planning
von: Torren-Peraire, Paula, et al.
Veröffentlicht: (2023)
von: Torren-Peraire, Paula, et al.
Veröffentlicht: (2023)
Revealing the Relationship Between Publication Bias and Chemical Reactivity with Contrastive Learning
von: Gao, Wenhao, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Gao, Wenhao, et al.
Veröffentlicht: (2024)
LICO: Large Language Models for In-Context Molecular Optimization
von: Nguyen, Tung, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Nguyen, Tung, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Distributional Priors Guided Diffusion for Generating 3D Molecules in Low Data Regimes
von: Hong, Haokai, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Hong, Haokai, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Molecular Graph Representation Learning Integrating Large Language Models with Domain-specific Small Models
von: Zhang, Tianyu, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Zhang, Tianyu, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Multimodal Large Language Models for Inverse Molecular Design with Retrosynthetic Planning
von: Liu, Gang, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Liu, Gang, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Deep Geometry Handling and Fragment-wise Molecular 3D Graph Generation
von: Zhang, Odin, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Zhang, Odin, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Uncertainty Quantification for Molecular Property Predictions with Graph Neural Architecture Search
von: Jiang, Shengli, et al.
Veröffentlicht: (2023)
von: Jiang, Shengli, et al.
Veröffentlicht: (2023)
Sculpting Molecules in Text-3D Space: A Flexible Substructure Aware Framework for Text-Oriented Molecular Optimization
von: Zhang, Kaiwei, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Zhang, Kaiwei, et al.
Veröffentlicht: (2024)
RGFN: Synthesizable Molecular Generation Using GFlowNets
von: Koziarski, Michał, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Koziarski, Michał, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Pre-training of Molecular GNNs via Conditional Boltzmann Generator
von: Koge, Daiki, et al.
Veröffentlicht: (2023)
von: Koge, Daiki, et al.
Veröffentlicht: (2023)
GP-MoLFormer: A Foundation Model For Molecular Generation
von: Ross, Jerret, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Ross, Jerret, et al.
Veröffentlicht: (2024)
E3STO: Orbital Inspired SE(3)-Equivariant Molecular Representation for Electron Density Prediction
von: Mitnikov, Ilan, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Mitnikov, Ilan, et al.
Veröffentlicht: (2024)
CREMP: Conformer-rotamer ensembles of macrocyclic peptides for machine learning
von: Grambow, Colin A., et al.
Veröffentlicht: (2023)
von: Grambow, Colin A., et al.
Veröffentlicht: (2023)
ChemEval: A Comprehensive Multi-Level Chemical Evaluation for Large Language Models
von: Huang, Yuqing, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Huang, Yuqing, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Language models in molecular discovery
von: Janakarajan, Nikita, et al.
Veröffentlicht: (2023)
von: Janakarajan, Nikita, et al.
Veröffentlicht: (2023)
MOL-Mamba: Enhancing Molecular Representation with Structural & Electronic Insights
von: Hu, Jingjing, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Hu, Jingjing, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Mitigating Exposure Bias in Score-Based Generation of Molecular Conformations
von: Wang, Sijia, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Wang, Sijia, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Ähnliche Einträge
-
Equivariant Blurring Diffusion for Hierarchical Molecular Conformer Generation
von: Park, Jiwoong, et al.
Veröffentlicht: (2024) -
WGFormer: An SE(3)-Transformer Driven by Wasserstein Gradient Flows for Molecular Ground-State Conformation Prediction
von: Wang, Fanmeng, et al.
Veröffentlicht: (2024) -
MultiModal-Learning for Predicting Molecular Properties: A Framework Based on Image and Graph Structures
von: Wang, Zhuoyuan, et al.
Veröffentlicht: (2023) -
Re-Dock: Towards Flexible and Realistic Molecular Docking with Diffusion Bridge
von: Huang, Yufei, et al.
Veröffentlicht: (2024) -
Two-Stage Pretraining for Molecular Property Prediction in the Wild
von: Wijaya, Kevin Tirta, et al.
Veröffentlicht: (2024)