Moment-based metrics for molecules computable from cryo-EM images
Fuente:
arXiv
Enregistré dans:
| Auteurs principaux: | Zhang, Andy, Mickelin, Oscar, Kileel, Joe, Verbeke, Eric J., Marshall, Nicholas F., Gilles, Marc Aurèle, Singer, Amit |
|---|---|
| Format: | Preprint |
| Publié: |
2024
|
| Sujets: | |
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