Spectroscopic approaches for studies of site-specific DNA base and backbone "breathing" using exciton-coupled dimer-labeled DNA
Fuente:
arXiv
Salvato in:
| Autori principali: | Marcus, Andrew H., Matsika, Spiridoula, Heussman, Dylan, Sorour, Mohammed I., Maurer, Jack, Albrecht, Claire S., Enkhbaatar, Lulu, Herbert, Patrick, Kistler, Kurt A., von Hippel, Peter H. |
|---|---|
| Natura: | Preprint |
| Pubblicazione: |
2024
|
| Soggetti: | |
| Accesso online: | |
| Tags: |
Aggiungi Tag
Nessun Tag, puoi essere il primo ad aggiungerne!!
|
Documenti analoghi
Cation-DNA outer sphere coordination in DNA polymorphism
di: Zubova, Elena A., et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Zubova, Elena A., et al.
Pubblicazione: (2025)
Model-based reinforcement learning for protein backbone design
di: Renard, Frederic, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Renard, Frederic, et al.
Pubblicazione: (2024)
Mechanisms of DNA-mediated allostery
di: Segers, Midas, et al.
Pubblicazione: (2023)
di: Segers, Midas, et al.
Pubblicazione: (2023)
DNA energy constraints shape biological evolutionary trajectories
di: Fariselli, Piero, et al.
Pubblicazione: (2019)
di: Fariselli, Piero, et al.
Pubblicazione: (2019)
A review of DNA restriction-free overlapping sequence cloning techniques for synthetic biology
di: Bomfiglio, Isabella Frighetto, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Bomfiglio, Isabella Frighetto, et al.
Pubblicazione: (2025)
Visualizing Poloidal Orientation in DNA Minicircles
di: Lemos, Tony, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Lemos, Tony, et al.
Pubblicazione: (2025)
Design of DNA Strand Displacement Reactions
di: Jurinović, Križan, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Jurinović, Križan, et al.
Pubblicazione: (2025)
Correlating fluorescence microscopy, optical and magnetic tweezers to study single chiral biopolymers such as DNA
di: Shepherd, Jack W, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Shepherd, Jack W, et al.
Pubblicazione: (2024)
Structural Flexibility of the TCF7L2-DNA Complex with the Type 2 Diabetes SNP rs7903146
di: Venuturimilli, Karthik, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Venuturimilli, Karthik, et al.
Pubblicazione: (2025)
CA-DEL: An Open Multi-Target, Multi-Modal Benchmark for Learning from DNA-Encoded Library Screens
di: He, Mutian, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: He, Mutian, et al.
Pubblicazione: (2026)
Lysine-Cysteine-Serine-Tryptophan Inserted into the DNA-Binding Domain of Human Mineralocorticoid Receptor Increases Transcriptional Activation by Aldosterone
di: Katsu, Yoshinao, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Katsu, Yoshinao, et al.
Pubblicazione: (2024)
Dirichlet Flow Matching with Applications to DNA Sequence Design
di: Stark, Hannes, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Stark, Hannes, et al.
Pubblicazione: (2024)
Preservation Constraints on aDNA Information Generation and the HSF Posterior Sourcing Framework: A First-Principles Critique of Conventional Methods
di: Zhao, Wan-Qian, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Zhao, Wan-Qian, et al.
Pubblicazione: (2026)
DNA Calorimetric Force Spectroscopy at Single Base Pair Resolution
di: Rissone, Paolo, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Rissone, Paolo, et al.
Pubblicazione: (2024)
Insights into elastic properties of coarse-grained DNA models: q-stiffness of cgDNA vs. cgDNA+
di: Laeremans, Wout, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Laeremans, Wout, et al.
Pubblicazione: (2024)
Double-Strand Break Clustering: An Economical and Effective Strategy for DNA Repair
di: Chen, Junyi, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Chen, Junyi, et al.
Pubblicazione: (2024)
Multiview Random Vector Functional Link Network for Predicting DNA-Binding Proteins
di: Quadir, A., et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Quadir, A., et al.
Pubblicazione: (2024)
Learning conformational ensembles of proteins based on backbone geometry
di: Wolf, Nicolas, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Wolf, Nicolas, et al.
Pubblicazione: (2025)
How to explain the sensitivity of DNA double-strand breaks yield to 125I position?
di: Ávila, Mario Enrique Alcocer, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Ávila, Mario Enrique Alcocer, et al.
Pubblicazione: (2024)
G4-Attention: Deep Learning Model with Attention for predicting DNA G-Quadruplexes
di: Mukherjee, Shrimon, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Mukherjee, Shrimon, et al.
Pubblicazione: (2024)
Twist dominates bending in the liquid crystal organization of bacteriophage DNA
di: Liu, Pei, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Liu, Pei, et al.
Pubblicazione: (2025)
POSERS: Steganography-Driven Molecular Tagging Using Randomized DNA Sequences
di: Yazdi, Ali Tafazoli, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Yazdi, Ali Tafazoli, et al.
Pubblicazione: (2025)
Cooperation and competition of basepairing and electrostatic interactions in mixtures of DNA nanostars and polylysine
di: Abraham, Gabrielle R., et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Abraham, Gabrielle R., et al.
Pubblicazione: (2025)
Knotted DNA Configurations in Bacteriophage Capsids: A Liquid Crystal Theory Approach
di: Liu, Pei, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Liu, Pei, et al.
Pubblicazione: (2025)
On the comparison of models and experiments in the study of DNA open states: the problem of degrees of freedom
di: Shigaev, Alexey S., et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Shigaev, Alexey S., et al.
Pubblicazione: (2025)
Statistical Mechanics of Multiplectoneme Phases in DNA
di: Segers, Midas, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Segers, Midas, et al.
Pubblicazione: (2024)
Structural barriers of the discrete Hasimoto map applied to protein backbone geometry
di: Wang, Yiquan
Pubblicazione: (2026)
di: Wang, Yiquan
Pubblicazione: (2026)
cgNA+min: computation of sequence-dependent dsDNA energy-minimising minicircle configurations
di: Singh, Raushan, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Singh, Raushan, et al.
Pubblicazione: (2024)
Coarse-grained modelling of DNA-RNA hybrids
di: Ratajczyk, Eryk J., et al.
Pubblicazione: (2023)
di: Ratajczyk, Eryk J., et al.
Pubblicazione: (2023)
Unzipping of knotted DNA via nanopore translocation
di: Suma, Antonio, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Suma, Antonio, et al.
Pubblicazione: (2024)
High nucleotide skew palindromic DNA sequences function as replication origins due to their unzipping propensity
di: Sahu, Parthasarathi, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Sahu, Parthasarathi, et al.
Pubblicazione: (2024)
Target search on DNA -- effect of coiling
di: Lomholt, Michael A., et al.
Pubblicazione: (2023)
di: Lomholt, Michael A., et al.
Pubblicazione: (2023)
Modular DNA origami-based electrochemical detection of DNA and proteins
di: Jeon, Byoung-jin, et al.
Pubblicazione: (2023)
di: Jeon, Byoung-jin, et al.
Pubblicazione: (2023)
QuantumDNA: A Python Package for Analyzing Quantum Charge Dynamics in DNA and Exploring Its Biological Relevance
di: Herb, Dennis, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Herb, Dennis, et al.
Pubblicazione: (2025)
Resolving structural dynamics in situ through cryogenic electron tomography
di: Carrion, Jackson, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Carrion, Jackson, et al.
Pubblicazione: (2025)
Platelet plug microstructure and flow modulate fibrin gelation dynamics: Insights from computational simulations
di: Cruts, Janneke M. H., et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Cruts, Janneke M. H., et al.
Pubblicazione: (2026)
Electrodynamic forces driving DNA-protein interactions at large distances
di: Faraji, E., et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Faraji, E., et al.
Pubblicazione: (2024)
Fast and Versatile RNA Design via Motif-level Divide-and-Conquer and Structure-level Rival Search
di: Zhou, Tianshuo, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Zhou, Tianshuo, et al.
Pubblicazione: (2026)
Liapunov exponent distributions and maps for multiple parameter logistic equation. Application to DNA and RNA sequences
di: Martin-Landrove, Miguel, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Martin-Landrove, Miguel, et al.
Pubblicazione: (2025)
DEL-Ranking: Ranking-Correction Denoising Framework for Elucidating Molecular Affinities in DNA-Encoded Libraries
di: Cao, Hanqun, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Cao, Hanqun, et al.
Pubblicazione: (2024)
Documenti analoghi
-
Cation-DNA outer sphere coordination in DNA polymorphism
di: Zubova, Elena A., et al.
Pubblicazione: (2025) -
Model-based reinforcement learning for protein backbone design
di: Renard, Frederic, et al.
Pubblicazione: (2024) -
Mechanisms of DNA-mediated allostery
di: Segers, Midas, et al.
Pubblicazione: (2023) -
DNA energy constraints shape biological evolutionary trajectories
di: Fariselli, Piero, et al.
Pubblicazione: (2019) -
A review of DNA restriction-free overlapping sequence cloning techniques for synthetic biology
di: Bomfiglio, Isabella Frighetto, et al.
Pubblicazione: (2025)