Buchumschlag

Thermodynamic limits on general far-from-equilibrium molecular templating networks

Fuente: arXiv

Gespeichert in:

Bibliographische Detailangaben
Hauptverfasser:	Qureshi, Benjamin, Poulton, Jenny M., Ouldridge, Thomas E.
Format:	Preprint
Veröffentlicht:	2024
Schlagworte:	Biological Physics Statistical Mechanics Information Theory Molecular Networks
Online-Zugang:	Acceder al recurso
Tags:	Tag hinzufügen Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!

Ähnliche Einträge

Intuitive dissection of the Gaussian information bottleneck method with an application to optimal prediction
von: Galstyan, Vahe, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Local imperfect feedback control in non-equilibrium biophysical systems enabled by thermodynamic constraints
von: Floyd, Carlos, et al.
Veröffentlicht: (2025)

The generic temperature response of large biochemical networks
von: Voits, Julian B., et al.
Veröffentlicht: (2024)

Emergence of generic first-passage time distributions for large Markovian networks
von: Voits, Julian B., et al.
Veröffentlicht: (2026)

Exact computation of Transfer Entropy with Path Weight Sampling
von: Das, Avishek, et al.
Veröffentlicht: (2024)

Shortcuts in stochastic systems and control of biophysical processes
von: Ilker, Efe, et al.
Veröffentlicht: (2021)

Stochastic Thermodynamics of Cooperative Biomolecular Machines: Fluctuation Relations and Hidden Detailed Balance Breaking
von: Piephoff, D. Evan, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Time-reversal symmetry breaking in the chemosensory array reveals mechanisms for dissipation-enhanced cooperative sensing
von: Hathcock, David, et al.
Veröffentlicht: (2023)

Maximum entropy models for patterns of gene expression
von: Sarra, Camilla, et al.
Veröffentlicht: (2024)

The Interplay of Heterogeneity and Product Detachment in Templated Polymer Copying
von: Guntoro, Jeremy E. B., et al.
Veröffentlicht: (2024)

A general mechanism for enhancer-insulator pairing reveals heterogeneous dynamics in long-distant 3D gene regulation
von: Hedström, Lucas, et al.
Veröffentlicht: (2024)

Algebraic and diagrammatic methods for the rule-based modeling of multi-particle complexes
von: Rousseau, Rebecca J., et al.
Veröffentlicht: (2024)

Critical Dynamics and Cyclic Memory Retrieval in Non-reciprocal Hopfield Networks
von: Xue, Shuyue, et al.
Veröffentlicht: (2025)

A generalized work theorem for stopped stochastic chemical reaction networks
von: Li, Xiangting, et al.
Veröffentlicht: (2026)

Thermodynamic Space of Chemical Reaction Networks
von: Liang, Shiling, et al.
Veröffentlicht: (2024)

Thermodynamics of Growth in Open Chemical Reaction Networks
von: Srinivas, Shesha Gopal Marehalli, et al.
Veröffentlicht: (2023)

Stable developmental patterns of gene expression without morphogen gradients
von: Majka, Maciej, et al.
Veröffentlicht: (2023)

Nonequilibrium Thermodynamics of Non-Ideal Reaction-Diffusion Systems: Implications for Active Self-Organization
von: Avanzini, Francesco, et al.
Veröffentlicht: (2024)

Mutual Information Rate -- Linear Noise Approximation and Exact Computation
von: Reinhardt, Manuel, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Thermodynamic ranking of pathways in reaction networks
von: Gagrani, Praful, et al.
Veröffentlicht: (2025)

A minimal scenario for the origin of non-equilibrium order
von: Ravasio, Riccardo, et al.
Veröffentlicht: (2024)

What is a chemostat? Insights from hybrid dynamics and stochastic thermodynamics
von: Remlein, Benedikt, et al.
Veröffentlicht: (2025)

The Demon Hidden Behind Life's Ultra-Energy-Efficient Information Processing -- Demonstrated by Biological Molecular Motors
von: Yanagida, Toshio, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Thermodynamic inference in molecular motors: a Martingale approach
von: Nadal-Rosa, Adrián, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Invariant non-equilibrium dynamics of transcriptional regulation optimize information flow
von: Zoller, Benjamin, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Limits on the computational expressivity of non-equilibrium biophysical processes
von: Floyd, Carlos, et al.
Veröffentlicht: (2024)

Understanding the temperature response of biological systems: Part II -- Network-level mechanisms and emergent dynamics
von: Jacobs, Simen, et al.
Veröffentlicht: (2026)

Hypergraph-Based Models of Random Chemical Reaction Networks: Conservation Laws, Connectivity, and Percolation
von: Srinivas, Shesha Gopal Marehalli, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Energy Transduction in Complex Networks with Multiple Resources: The Chemistry Paradigm
von: Bilancioni, Massimo, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Non-Markovian gene expression
von: Vilk, Ohad, et al.
Veröffentlicht: (2023)

Universal scaling relation and criticality in metabolism and growth of Escherichia coli
von: Guan, Shaohua, et al.
Veröffentlicht: (2023)

Characterizing the Conditions for Indefinite Growth in Open Chemical Reaction Networks
von: Srinivas, Shesha Gopal Marehalli, et al.
Veröffentlicht: (2023)

Gears in Chemical Reaction Networks: Optimizing Energy Transduction Efficiency
von: Bilancioni, Massimo, et al.
Veröffentlicht: (2024)

Test of the formal basis of Arrhenius law with heat capacities
von: Michel, Denis
Veröffentlicht: (2024)

Nonparametric inference of higher order interaction patterns in networks
von: Wegner, Anatol E., et al.
Veröffentlicht: (2024)

Thermodynamic limit under Partial Observability
von: Sudo, Akihito
Veröffentlicht: (2021)

Thermodynamics of Darwinian selection in molecular replicators
von: Kolchinsky, Artemy
Veröffentlicht: (2021)

Ising Models of Cooperativity in Muscle Contraction
von: Saadat, Elaheh, et al.
Veröffentlicht: (2026)

Temporal Contrastive Learning through implicit non-equilibrium memory
von: Falk, Martin J., et al.
Veröffentlicht: (2023)

Recurrent neural chemical reaction networks that approximate arbitrary dynamics
von: Dack, Alexander, et al.
Veröffentlicht: (2024)