Spatially Resolved Gene Expression Prediction from Histology via Multi-view Graph Contrastive Learning with HSIC-bottleneck Regularization
Fuente:
arXiv
Gespeichert in:
| Hauptverfasser: | Chi, Changxi, Shi, Hang, Zhu, Qi, Zhang, Daoqiang, Shao, Wei |
|---|---|
| Format: | Preprint |
| Veröffentlicht: |
2024
|
| Schlagworte: | |
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