Peptide Sequencing Via Protein Language Models
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arXiv
Gespeichert in:
| Hauptverfasser: | Pham, Thuong Le Hoai, Saurav, Jillur Rahman, Omere, Aisosa A., Heyl, Calvin J., Nasr, Mohammad Sadegh, Reynolds, Cody Tyler, Veerla, Jai Prakash Yadav, Shang, Helen H, Jaworski, Justyn, Ravenscraft, Alison, Buonomo, Joseph Anthony, Luber, Jacob M. |
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| Format: | Preprint |
| Veröffentlicht: |
2024
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