Salvato in:
| Autori principali: | Qasim, Luckman, Alisaraie, Laleh |
|---|---|
| Natura: | Preprint |
| Pubblicazione: |
2024
|
| Soggetti: | |
| Accesso online: | https://arxiv.org/abs/2408.03436 |
| Tags: |
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