Counterions in RNA structure: Structural bioinformatics analysis to identify the role of Mg2+ ions in base pair formation
Fuente:
arXiv
Salvato in:
| Autori principali: | Adhikari, Swati, Bhattacharyya, Dhananjay, Roy, Parthajit |
|---|---|
| Natura: | Preprint |
| Pubblicazione: |
2024
|
| Soggetti: | |
| Accesso online: | |
| Tags: |
Aggiungi Tag
Nessun Tag, puoi essere il primo ad aggiungerne!!
|
Documenti analoghi
CavDetect: A DBSCAN Algorithm based Novel Cavity Detection Model on Protein Structure
di: Adhikari, Swati, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Adhikari, Swati, et al.
Pubblicazione: (2024)
Improving RNA secondary structure prediction via state inference with deep recurrent neural networks
di: Willmott, Devin, et al.
Pubblicazione: (2019)
di: Willmott, Devin, et al.
Pubblicazione: (2019)
Can geometric combinatorics improve RNA branching predictions?
di: Poznanović, Svetlana, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Poznanović, Svetlana, et al.
Pubblicazione: (2025)
Connectivity of Parameter Regions of Multistationarity for Multisite Phosphorylation Networks
di: Kaihnsa, Nidhi, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Kaihnsa, Nidhi, et al.
Pubblicazione: (2024)
Modelling ion channels with a view towards identifiability
di: Siekmann, Ivo
Pubblicazione: (2025)
di: Siekmann, Ivo
Pubblicazione: (2025)
Vector Traits Shape Disease Persistence: A Predator Prey Approach to Dengue
di: Chathurangika, Piyumi, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Chathurangika, Piyumi, et al.
Pubblicazione: (2025)
Corrected Hill Function in Stochastic Gene Regulatory Networks
di: Hernández-García, Manuel Eduardo, et al.
Pubblicazione: (2023)
di: Hernández-García, Manuel Eduardo, et al.
Pubblicazione: (2023)
Predicting the stability of profiling signals of small RNAs
di: Li, Qiuyun, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Li, Qiuyun, et al.
Pubblicazione: (2024)
Computation of Minimum Numbers of Tile and Bond-Edge Types for DNA Self-Assembly of Select Archimedean Graphs
di: Merrithew, Tabitha, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Merrithew, Tabitha, et al.
Pubblicazione: (2025)
Compound Mutations in the Abl1 Kinase Cause Inhibitor Resistance by Shifting DFG Flip Mechanisms and Relative State Populations
di: da Silva, Gabriel Monteiro, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: da Silva, Gabriel Monteiro, et al.
Pubblicazione: (2024)
A Standardized Benchmark for Machine-Learned Molecular Dynamics using Weighted Ensemble Sampling
di: Aghili, Alexander, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Aghili, Alexander, et al.
Pubblicazione: (2025)
Optimal Strategy for Stabilizing Protein Folding Intermediates
di: Wang, Mengshou, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Wang, Mengshou, et al.
Pubblicazione: (2024)
Methods for Analyzing RNA Pseudoknots via Chord Diagrams and Intersection Graphs
di: Ibrahim, Rayan, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Ibrahim, Rayan, et al.
Pubblicazione: (2025)
OTMol: Robust Molecular Structure Comparison via Optimal Transport
di: Wei, Xiaoqi, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Wei, Xiaoqi, et al.
Pubblicazione: (2025)
A Nonlocal size modified Poisson-Boltzmann Model and Its Finite Element Solver for Protein in Multi-Species Ionic Solution
di: Xie, Dexuan, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Xie, Dexuan, et al.
Pubblicazione: (2025)
Dynamic optimization of volatile fatty acids to enrich biohydrogen production using a deep learning neural network
di: Mahmoodi-Eshkaftaki, Mahmood, et al.
Pubblicazione: (2022)
di: Mahmoodi-Eshkaftaki, Mahmood, et al.
Pubblicazione: (2022)
Engineering Supercomputing Platforms for Biomolecular Applications
di: Welch, Robert, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Welch, Robert, et al.
Pubblicazione: (2025)
Sheaf-theoretic representation of the proteolipid code
di: Kervin, Troy A.
Pubblicazione: (2025)
di: Kervin, Troy A.
Pubblicazione: (2025)
Multiscale Jones Polynomial and Persistent Jones Polynomial for Knot Data Analysis
di: Song, Ruzhi, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Song, Ruzhi, et al.
Pubblicazione: (2024)
On Machine Learning Approaches for Protein-Ligand Binding Affinity Prediction
di: Schapin, Nikolai, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Schapin, Nikolai, et al.
Pubblicazione: (2024)
Combinatorial and Additive Number Theory Problem Sessions: '09--'25
di: Miller, Steven J.
Pubblicazione: (2014)
di: Miller, Steven J.
Pubblicazione: (2014)
Pairing interacting protein sequences using masked language modeling
di: Lupo, Umberto, et al.
Pubblicazione: (2023)
di: Lupo, Umberto, et al.
Pubblicazione: (2023)
Odd magical triples and maximal Higgs bundles
di: Hsiao, Enya
Pubblicazione: (2026)
di: Hsiao, Enya
Pubblicazione: (2026)
Random Measures, ANOVA Models and Quantifying Uncertainty in Randomized Controlled Trials
di: Bastian, Caleb Deen, et al.
Pubblicazione: (2023)
di: Bastian, Caleb Deen, et al.
Pubblicazione: (2023)
Generalized Measures of Population Synchrony
di: Motta, Francis C., et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Motta, Francis C., et al.
Pubblicazione: (2024)
Rigidity of self-maps of $V_{n,2}$ and classification of manifolds tangentially homotopy equivalent to $V_{n,2} \times S^k$
di: Biswas, Sagnik
Pubblicazione: (2026)
di: Biswas, Sagnik
Pubblicazione: (2026)
ApisTox: a new benchmark dataset for the classification of small molecules toxicity on honey bees
di: Adamczyk, Jakub, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Adamczyk, Jakub, et al.
Pubblicazione: (2024)
Unveiling Biological Models Through Turing Patterns
di: Li, Yuhan, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Li, Yuhan, et al.
Pubblicazione: (2025)
Exact enumeration of fullerenes
di: Engel, Philip, et al.
Pubblicazione: (2023)
di: Engel, Philip, et al.
Pubblicazione: (2023)
Pattern formation within phenotype-structured chemotactic populations
di: Lorenzi, Tommaso, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Lorenzi, Tommaso, et al.
Pubblicazione: (2025)
A nanopore-gated sub-attoliter silicon nanocavity for single-molecule trapping and analysis
di: Liu, Funing, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Liu, Funing, et al.
Pubblicazione: (2025)
Fast-Slow Analysis of a Model For the Stimulation of Enzymatic Activity by a Competitive Inhibitor
di: Young, Garrett, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Young, Garrett, et al.
Pubblicazione: (2025)
A $p$-adic Reaction--Diffusion Model of Branching Coral Growth and Calcification Dynamics
di: Fuquen-Tibatá, Angela, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Fuquen-Tibatá, Angela, et al.
Pubblicazione: (2025)
A Novel Mathematical Model of Protein Interactions from the Perspective of Electron Delocalization
di: Morikawa, Naoto
Pubblicazione: (2025)
di: Morikawa, Naoto
Pubblicazione: (2025)
Size and shape of terrestrial animals
di: Sharma, Neelima, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Sharma, Neelima, et al.
Pubblicazione: (2026)
A model for contractile stress fibers embedded in bulk actomyosin networks
di: Savinov, Mariya, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Savinov, Mariya, et al.
Pubblicazione: (2024)
Physical oceanography in the shallow water during Hakurei-Maru cruise NH92-2
di: JODC
Pubblicazione: (2013)
di: JODC
Pubblicazione: (2013)
DLCM: a versatile multi-level solver for heterogeneous multicellular systems
di: Blom, Erik, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Blom, Erik, et al.
Pubblicazione: (2025)
Prediction of Binding Affinity for ErbB Inhibitors Using Deep Neural Network Model with Morgan Fingerprints as Features
di: Aman, La Ode
Pubblicazione: (2025)
di: Aman, La Ode
Pubblicazione: (2025)
Multi-scale species richness estimation with deep learning
di: Boussange, Victor, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Boussange, Victor, et al.
Pubblicazione: (2025)
Documenti analoghi
-
CavDetect: A DBSCAN Algorithm based Novel Cavity Detection Model on Protein Structure
di: Adhikari, Swati, et al.
Pubblicazione: (2024) -
Improving RNA secondary structure prediction via state inference with deep recurrent neural networks
di: Willmott, Devin, et al.
Pubblicazione: (2019) -
Can geometric combinatorics improve RNA branching predictions?
di: Poznanović, Svetlana, et al.
Pubblicazione: (2025) -
Connectivity of Parameter Regions of Multistationarity for Multisite Phosphorylation Networks
di: Kaihnsa, Nidhi, et al.
Pubblicazione: (2024) -
Modelling ion channels with a view towards identifiability
di: Siekmann, Ivo
Pubblicazione: (2025)