AlphaFolding: 4D Diffusion for Dynamic Protein Structure Prediction with Reference and Motion Guidance
Fuente:
arXiv
Salvato in:
| Autori principali: | Cheng, Kaihui, Liu, Ce, Su, Qingkun, Wang, Jun, Zhang, Liwei, Tang, Yining, Yao, Yao, Zhu, Siyu, Qi, Yuan |
|---|---|
| Natura: | Preprint |
| Pubblicazione: |
2024
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