Buchumschlag

When are quarnets sufficient to reconstruct semi-directed phylogenetic networks?

Fuente: arXiv

Gespeichert in:

Bibliographische Detailangaben
Hauptverfasser:	Huber, Katharina T., van Iersel, Leo, Jones, Mark, Moulton, Vincent, Nipius, Leonie Veenema -
Format:	Preprint
Veröffentlicht:	2024
Schlagworte:	Populations and Evolution Data Structures and Algorithms Combinatorics
Online-Zugang:	Acceder al recurso
Tags:	Tag hinzufügen Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!

Ähnliche Einträge

Reconstructing semi-directed level-1 networks using few quarnets
von: Frohn, Martin, et al.
Veröffentlicht: (2024)

Characterizing semi-directed phylogenetic networks and their multi-rootable variants
von: Holtgrefe, Niels, et al.
Veröffentlicht: (2025)

A Class of Unrooted Phylogenetic Networks Inspired by the Properties of Rooted Tree-Child Networks
von: van Iersel, Leo, et al.
Veröffentlicht: (2026)

Bounds on the sequence length sufficient to reconstruct binary level-$1$ phylogenetic networks under the CFN model
von: Frohn, Martin, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Metrics for classes of semi-binary phylogenetic networks using $μ$-representations
von: Reichling, Christopher, et al.
Veröffentlicht: (2024)

Cherry picking in forests: A new characterization for the unrooted hybrid number of two phylogenetic trees
von: Huber, Katharina T., et al.
Veröffentlicht: (2022)

A kernel for the maximum agreement forest problem on multiple binary phylogenetic trees
von: Kelk, Steven, et al.
Veröffentlicht: (2026)

Snakes and Ladders: a Treewidth Story
von: Chaplick, Steven, et al.
Veröffentlicht: (2023)

Tree Containment Parameterized by Scanwidth
von: van Iersel, Leo, et al.
Veröffentlicht: (2026)

Distinguishing Phylogenetic Level-2 Networks with Quartets and Inter-Taxon Quartet Distances
von: Holtgrefe, Niels, et al.
Veröffentlicht: (2025)

phylo2vec: a library for vector-based phylogenetic tree manipulation
von: Scheidwasser, Neil, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Coconvex characters on collections of phylogenetic trees
von: Czabarka, Eva, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Embedding phylogenetic trees in networks of low treewidth
von: van Iersel, Leo, et al.
Veröffentlicht: (2022)

On the existence of funneled orientations for classes of rooted phylogenetic networks
von: Döcker, Janosch, et al.
Veröffentlicht: (2024)

A Wild Sheep Chase Through an Orchard
von: Dempsey, Jordan, et al.
Veröffentlicht: (2024)

When is local search both effective and efficient?
von: Kaznatcheev, Artem, et al.
Veröffentlicht: (2024)

Graph-based method for constructing consensus trees
von: Torquet, Elio, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Analysis of Phylogeny Tracking Algorithms for Serial and Multiprocess Applications
von: Moreno, Matthew Andres, et al.
Veröffentlicht: (2024)

Split-or-decompose: Improved FPT branching algorithms for maximum agreement forests
von: Mestel, David, et al.
Veröffentlicht: (2024)

Meeting times on graphs in near-cubic time
von: McAvoy, Alex
Veröffentlicht: (2026)

LvD: A New Algorithm for Computing the Likelihood of a Phylogeny
von: Bryant, David, et al.
Veröffentlicht: (2026)

Bayesian Credible Sets for Phylogenetic Tree Topologies with Applications to Coverage Analysis and Cross-Model Comparison
von: Klawitter, Jonathan, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Computational support for case-heavy proofs in mathematical phylogenetics
von: Forte, Luca, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Bounding the softwired parsimony score of a phylogenetic network
von: Döcker, Janosch, et al.
Veröffentlicht: (2024)

A $μ$-distance for semidirected orchard phylogenetic networks
von: Ribas, Gerard, et al.
Veröffentlicht: (2026)

Fence decompositions and cherry covers in non-binary phylogenetic networks
von: Pons, Joan Carles, et al.
Veröffentlicht: (2024)

Exponential Steepest Ascent from Valued Constraint Graphs of Pathwidth Four
von: Kaznatcheev, Artem, et al.
Veröffentlicht: (2024)

0-1 laws for pattern occurrences in phylogenetic trees and networks
von: Bienvenu, François, et al.
Veröffentlicht: (2024)

Taxonomic classification with maximal exact matches in KATKA kernels and minimizer digests
von: Draesslerová, Dominika, et al.
Veröffentlicht: (2024)

The weighted total cophenetic index: A novel balance index for phylogenetic networks
von: Knüver, Linda, et al.
Veröffentlicht: (2023)

Exact and Heuristic Computation of the Scanwidth of Directed Acyclic Graphs
von: Holtgrefe, Niels, et al.
Veröffentlicht: (2024)

A sharp lower bound for the number of phylogenetic trees displayed by a tree-child network
von: Semple, Charles, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Galled Perfect Transfer Networks
von: Sánchez, Alitzel López, et al.
Veröffentlicht: (2024)

A branch-&-price approach to the unrooted maximum agreement forest problem
von: Frohn, Martin, et al.
Veröffentlicht: (2024)

Phylogenetic Inference under the Balanced Minimum Evolution Criterion via Semidefinite Programming
von: Skums, P.
Veröffentlicht: (2026)

Invariants for level-1 phylogenetic networks under the random walk 4-state Markov model
von: Frohn, M., et al.
Veröffentlicht: (2024)

Binary normal networks without near reticulations can be reconstructed from their rooted triples
von: Francis, Andrew, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Counting spinal phylogenetic networks
von: Francis, Andrew, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Defining a phylogenetic tree with the minimum number of small-state characters
von: Long, Yangjing, et al.
Veröffentlicht: (2025)

A complete characterization of pairs of binary phylogenetic trees with identical $A_k$-alignments
von: Wilde, Mirko, et al.
Veröffentlicht: (2024)