Flow Matching for Optimal Reaction Coordinates of Biomolecular System
Fuente:
arXiv
Enregistré dans:
| Auteurs principaux: | Zhang, Mingyuan, Zhang, Zhicheng, Wu, Hao, Wang, Yong |
|---|---|
| Format: | Preprint |
| Publié: |
2024
|
| Sujets: | |
| Accès en ligne: | |
| Tags: |
Ajouter un tag
Pas de tags, Soyez le premier à ajouter un tag!
|
Documents similaires
BioScore: A Foundational Scoring Function For Diverse Biomolecular Complexes
par: Zhu, Yuchen, et autres
Publié: (2025)
par: Zhu, Yuchen, et autres
Publié: (2025)
A Scalable and Quantum-Accurate Foundation Model for Biomolecular Force Field via Linearly Tensorized Quadrangle Attention
par: Su, Qun, et autres
Publié: (2025)
par: Su, Qun, et autres
Publié: (2025)
Generalized Flow Matching for Transition Dynamics Modeling
par: Wang, Haibo, et autres
Publié: (2024)
par: Wang, Haibo, et autres
Publié: (2024)
P2DFlow: A Protein Ensemble Generative Model with SE(3) Flow Matching
par: Jin, Yaowei, et autres
Publié: (2024)
par: Jin, Yaowei, et autres
Publié: (2024)
Reaction Coordinates are Optimal Channels of Energy Flow
par: Ma, Ao, et autres
Publié: (2024)
par: Ma, Ao, et autres
Publié: (2024)
$π$-Girsanov: A Generalized Method to Construct Markov State Models from Non-Equilibrium and Multiensemble Biased Simulations
par: Zhang, Mingyuan, et autres
Publié: (2026)
par: Zhang, Mingyuan, et autres
Publié: (2026)
Optimal navigation of magnetic artificial microswimmers in blood capillaries with deep reinforcement learning
par: Amoudruz, Lucas, et autres
Publié: (2024)
par: Amoudruz, Lucas, et autres
Publié: (2024)
Large Scale Training of Graph Neural Networks for Optimal Markov-Chain Partitioning Using the Kemeny Constant
par: Martino, Sam Alexander, et autres
Publié: (2023)
par: Martino, Sam Alexander, et autres
Publié: (2023)
SynLlama: Generating Synthesizable Molecules and Their Analogs with Large Language Models
par: Sun, Kunyang, et autres
Publié: (2025)
par: Sun, Kunyang, et autres
Publié: (2025)
Integrating Dynamical Systems Modeling with Spatiotemporal scRNA-seq Data Analysis
par: Zhang, Zhenyi, et autres
Publié: (2025)
par: Zhang, Zhenyi, et autres
Publié: (2025)
TICA-Based Free Energy Matching for Machine-Learned Molecular Dynamics
par: Aghili, Alexander, et autres
Publié: (2025)
par: Aghili, Alexander, et autres
Publié: (2025)
Physics Informed Constrained Learning of Dynamics from Static Data
par: Dang, Pengtao, et autres
Publié: (2025)
par: Dang, Pengtao, et autres
Publié: (2025)
Uni-Mol Docking V2: Towards Realistic and Accurate Binding Pose Prediction
par: Alcaide, Eric, et autres
Publié: (2024)
par: Alcaide, Eric, et autres
Publié: (2024)
Data-Driven Discovery and Formulation Refines the Quasi-Steady Model of Flapping-Wing Aerodynamics
par: Kamimizu, Yu, et autres
Publié: (2025)
par: Kamimizu, Yu, et autres
Publié: (2025)
Latent Thermodynamic Flows: Unified Representation Learning and Generative Modeling of Temperature-Dependent Behaviors from Limited Data
par: Qiu, Yunrui, et autres
Publié: (2025)
par: Qiu, Yunrui, et autres
Publié: (2025)
Q-learning with temporal memory to navigate turbulence
par: Rando, Marco, et autres
Publié: (2024)
par: Rando, Marco, et autres
Publié: (2024)
Clock-state olfactory search in turbulent flows using Q-learning: The geometry of plume recovery
par: Rando, Marco, et autres
Publié: (2026)
par: Rando, Marco, et autres
Publié: (2026)
Unraveling the Mechanism of Drug Binding to SARS-CoV-2 RNA Pseudoknot with Thermodynamics-Driven Machine Learning
par: Ivonina, Mariia, et autres
Publié: (2026)
par: Ivonina, Mariia, et autres
Publié: (2026)
BoltzNCE: Learning Likelihoods for Boltzmann Generation with Stochastic Interpolants and Noise Contrastive Estimation
par: Aggarwal, Rishal, et autres
Publié: (2025)
par: Aggarwal, Rishal, et autres
Publié: (2025)
One scale to rule them all: interpretable multi-scale Deep Learning for predicting cell survival after proton and carbon ion irradiation
par: Bordieri, Giulio, et autres
Publié: (2026)
par: Bordieri, Giulio, et autres
Publié: (2026)
Protein Language Model Embeddings Improve Generalization of Implicit Transfer Operators
par: Antoniadis, Panagiotis, et autres
Publié: (2026)
par: Antoniadis, Panagiotis, et autres
Publié: (2026)
Inferring Optical Tissue Properties from Photoplethysmography using Hybrid Amortized Inference
par: Behrmann, Jens, et autres
Publié: (2025)
par: Behrmann, Jens, et autres
Publié: (2025)
Inferring stochastic dynamics with growth from cross-sectional data
par: Zhang, Stephen, et autres
Publié: (2025)
par: Zhang, Stephen, et autres
Publié: (2025)
Tracking large chemical reaction networks and rare events by neural networks
par: Weng, Jiayu, et autres
Publié: (2025)
par: Weng, Jiayu, et autres
Publié: (2025)
Multiscale Biomolecular Simulations in the Exascale Era
par: Carrasco-Busturia, David, et autres
Publié: (2024)
par: Carrasco-Busturia, David, et autres
Publié: (2024)
Deep learning-enhanced dual-mode multiplexed optical sensor for point-of-care diagnostics of cardiovascular diseases
par: Han, Gyeo-Re, et autres
Publié: (2025)
par: Han, Gyeo-Re, et autres
Publié: (2025)
Generating Cyclic Conformers with Flow Matching in Cremer-Pople Coordinates
par: Schaufelberger, Luca, et autres
Publié: (2026)
par: Schaufelberger, Luca, et autres
Publié: (2026)
Label-free SERS Discrimination of Proline from Hydroxylated Proline at Single-molecule Level Assisted by a Deep Learning Model
par: Zhao, Yingqi, et autres
Publié: (2024)
par: Zhao, Yingqi, et autres
Publié: (2024)
A Note on Spectral Map
par: Gökdemir, Tuğçe, et autres
Publié: (2024)
par: Gökdemir, Tuğçe, et autres
Publié: (2024)
Physics-Informed Machine Learning for Microscale Drying of Plant-Based Foods: A Systematic Review of Computational Models and Experimental Insights
par: Batuwatta-Gamage, C. P., et autres
Publié: (2025)
par: Batuwatta-Gamage, C. P., et autres
Publié: (2025)
Searching for Quantum Effects in the Brain: A Bell-Type Test for Nonclassical Latent Representations in Autoencoders
par: Kominis, I. K., et autres
Publié: (2026)
par: Kominis, I. K., et autres
Publié: (2026)
Predictive Free Energy Simulations Through Hierarchical Distillation of Quantum Hamiltonians
par: Li, Chenghan, et autres
Publié: (2025)
par: Li, Chenghan, et autres
Publié: (2025)
Realistic Transition Paths for Large Biomolecular Systems: A Langevin Bridge Approach
par: Koehl, Patrice, et autres
Publié: (2025)
par: Koehl, Patrice, et autres
Publié: (2025)
JAMUN: Bridging Smoothed Molecular Dynamics and Score-Based Learning for Conformational Ensembles
par: Daigavane, Ameya, et autres
Publié: (2024)
par: Daigavane, Ameya, et autres
Publié: (2024)
Data-driven Discovery of Biophysical T Cell Receptor Co-specificity Rules
par: Pyo, Andrew G. T., et autres
Publié: (2024)
par: Pyo, Andrew G. T., et autres
Publié: (2024)
BInD: Bond and Interaction-generating Diffusion Model for Multi-objective Structure-based Drug Design
par: Lee, Joongwon, et autres
Publié: (2024)
par: Lee, Joongwon, et autres
Publié: (2024)
MoDyGAN: Combining Molecular Dynamics With GANs to Investigate Protein Conformational Space
par: Liang, Jingbo, et autres
Publié: (2025)
par: Liang, Jingbo, et autres
Publié: (2025)
Integrating Chemical Language and Molecular Graph in Multimodal Fused Deep Learning for Drug Property Prediction
par: Lu, Xiaohua, et autres
Publié: (2023)
par: Lu, Xiaohua, et autres
Publié: (2023)
AI-based Methods for Simulating, Sampling, and Predicting Protein Ensembles
par: Jing, Bowen, et autres
Publié: (2025)
par: Jing, Bowen, et autres
Publié: (2025)
Reinforcement Learning for Active Matter
par: Cai, Wenjie, et autres
Publié: (2025)
par: Cai, Wenjie, et autres
Publié: (2025)
Documents similaires
-
BioScore: A Foundational Scoring Function For Diverse Biomolecular Complexes
par: Zhu, Yuchen, et autres
Publié: (2025) -
A Scalable and Quantum-Accurate Foundation Model for Biomolecular Force Field via Linearly Tensorized Quadrangle Attention
par: Su, Qun, et autres
Publié: (2025) -
Generalized Flow Matching for Transition Dynamics Modeling
par: Wang, Haibo, et autres
Publié: (2024) -
P2DFlow: A Protein Ensemble Generative Model with SE(3) Flow Matching
par: Jin, Yaowei, et autres
Publié: (2024) -
Reaction Coordinates are Optimal Channels of Energy Flow
par: Ma, Ao, et autres
Publié: (2024)