A multi-scale analysis of the CzrA transcription repressor highlights the allosteric changes induced by metal ion binding
Fuente:
arXiv
Salvato in:
| Autori principali: | Rigoli, Marta, Potestio, Raffaello, Menichetti, Roberto |
|---|---|
| Natura: | Preprint |
| Pubblicazione: |
2024
|
| Soggetti: | |
| Accesso online: | |
| Tags: |
Aggiungi Tag
Nessun Tag, puoi essere il primo ad aggiungerne!!
|
Documenti analoghi
The allosteric lever: towards a principle of specific allosteric response
di: Vossel, Maximilian, et al.
Pubblicazione: (2023)
di: Vossel, Maximilian, et al.
Pubblicazione: (2023)
Mechanosensitive ion channels: Old but new
di: Çetiner, Uğur
Pubblicazione: (2024)
di: Çetiner, Uğur
Pubblicazione: (2024)
In vitro binding energies capture Klf4 occupancy across the human genome
di: Schwager, Anne, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Schwager, Anne, et al.
Pubblicazione: (2026)
Multiple binding modes of AKT on PIP$_3$-containing membranes
di: Nakagaki, Yuki, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Nakagaki, Yuki, et al.
Pubblicazione: (2026)
The onset of molecule-spanning dynamics in a multi-domain protein
di: Sohmen, Benedikt, et al.
Pubblicazione: (2021)
di: Sohmen, Benedikt, et al.
Pubblicazione: (2021)
Molecular Determinants of Orthosteric-allosteric Dual Inhibition of PfHT1 by Computational Assessment
di: Kong, Decheng, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Kong, Decheng, et al.
Pubblicazione: (2025)
Monte Carlo simulation of SARS-CoV-2 radiation-induced inactivation for vaccine development
di: Francis, Ziad, et al.
Pubblicazione: (2020)
di: Francis, Ziad, et al.
Pubblicazione: (2020)
Insights into the role of dynamical features in protein complex formation: the case of SARS-CoV-2 spike binding with ACE2
di: Grassmann, Greta, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Grassmann, Greta, et al.
Pubblicazione: (2025)
Realistic Transition Paths for Large Biomolecular Systems: A Langevin Bridge Approach
di: Koehl, Patrice, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Koehl, Patrice, et al.
Pubblicazione: (2025)
Statistical Survey of Chemical and Geometric Patterns on Protein Surfaces as a Blueprint for Protein-mimicking Nanoparticles
di: McBride, John M., et al.
Pubblicazione: (2024)
di: McBride, John M., et al.
Pubblicazione: (2024)
Advancements in Programmable Lipid Nanoparticles: Exploring the Four-Domain Model for Targeted Drug Delivery
di: Liu, Zhaoyu, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Liu, Zhaoyu, et al.
Pubblicazione: (2024)
Double-Strand Break Clustering: An Economical and Effective Strategy for DNA Repair
di: Chen, Junyi, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Chen, Junyi, et al.
Pubblicazione: (2024)
Mapping the path to Cryogenic Atom Probe Tomography Analysis of biomolecules
di: Woods, Eric V., et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Woods, Eric V., et al.
Pubblicazione: (2024)
Correlating fluorescence microscopy, optical and magnetic tweezers to study single chiral biopolymers such as DNA
di: Shepherd, Jack W, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Shepherd, Jack W, et al.
Pubblicazione: (2024)
DNA Calorimetric Force Spectroscopy at Single Base Pair Resolution
di: Rissone, Paolo, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Rissone, Paolo, et al.
Pubblicazione: (2024)
Biological Insights from Integrative Modeling of Intrinsically Disordered Protein Systems
di: Liu, Zi Hao, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Liu, Zi Hao, et al.
Pubblicazione: (2024)
Isoleucine gate blocks K+ conduction in C-type inactivation
di: Treptow, Werner, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Treptow, Werner, et al.
Pubblicazione: (2024)
Identifying the minimal sets of distance restraints for FRET-assisted protein structural modeling
di: Liu, Zhuoyi, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Liu, Zhuoyi, et al.
Pubblicazione: (2024)
Computational Methods to Investigate Intrinsically Disordered Proteins and their Complexes
di: Liu, Zi Hao, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Liu, Zi Hao, et al.
Pubblicazione: (2024)
Spectroscopic approaches for studies of site-specific DNA base and backbone "breathing" using exciton-coupled dimer-labeled DNA
di: Marcus, Andrew H., et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Marcus, Andrew H., et al.
Pubblicazione: (2024)
Bistability in filamentous actin through monomer-sequestration of an effector species
di: Foteinopoulos, Panayiotis, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Foteinopoulos, Panayiotis, et al.
Pubblicazione: (2024)
RNA Dynamics from Experimental and Computational Approaches
di: Bussi, Giovanni, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Bussi, Giovanni, et al.
Pubblicazione: (2024)
Visualizing Poloidal Orientation in DNA Minicircles
di: Lemos, Tony, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Lemos, Tony, et al.
Pubblicazione: (2025)
Contact-Dependent Ion Gating Explains Directional Asymmetry in the Bacterial Flagellar Motor
di: Zhu, Jiading, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Zhu, Jiading, et al.
Pubblicazione: (2026)
Single-molecule biophysics
di: Leake, Mark C
Pubblicazione: (2025)
di: Leake, Mark C
Pubblicazione: (2025)
MERGE-RNA: a physics-based model to predict RNA secondary structure ensembles with chemical probing
di: Sacco, Giuseppe, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Sacco, Giuseppe, et al.
Pubblicazione: (2025)
Integrative dynamic structural biology unveils conformers essential for the oligomerization of a large GTPase
di: Peulen, Thomas-Otavio, et al.
Pubblicazione: (2020)
di: Peulen, Thomas-Otavio, et al.
Pubblicazione: (2020)
Integrating experimental data with molecular simulations to investigate RNA structural dynamics
di: Bernetti, Mattia, et al.
Pubblicazione: (2022)
di: Bernetti, Mattia, et al.
Pubblicazione: (2022)
Effects of 2.45 GHz radiofrequency upon Leuconostoc mesenteroides Glucose-6-phosphate dehydrogenase enzymatic activity
di: Miño-Galaz, G., et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Miño-Galaz, G., et al.
Pubblicazione: (2026)
Joint Geometric-Chemical Distance for Protein Surfaces
di: Swami, Himanshu, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Swami, Himanshu, et al.
Pubblicazione: (2026)
Exploration of the potential energy surface for the conformational interconversion of the amyloid $β$ peptide at the fibril end
di: Oishi, Yasuhiro, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Oishi, Yasuhiro, et al.
Pubblicazione: (2025)
Modelling Statistics of Polypeptides in Emissions from Smokers Near Ocean Ridges
di: Intoy, Ben, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Intoy, Ben, et al.
Pubblicazione: (2025)
Experimental Collapse in Virophysics: Protocol-Resolved Observation, Inference, and Plaque-Assay Blindness
di: Kleess, Lillian St.
Pubblicazione: (2026)
di: Kleess, Lillian St.
Pubblicazione: (2026)
Applied causality to infer protein dynamics and kinetics
di: Aranganathan, Akashnathan, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Aranganathan, Akashnathan, et al.
Pubblicazione: (2025)
From quantitative modeling of fluorescence experiments on biomolecules to the prediction of spectroscopic dye properties
di: Peulen, Thomas-Otavio, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Peulen, Thomas-Otavio, et al.
Pubblicazione: (2026)
High throughput interactome determination via sulfur anomalous scattering
di: Miotto, Mattia, et al.
Pubblicazione: (2023)
di: Miotto, Mattia, et al.
Pubblicazione: (2023)
A unified framework for coarse grained molecular dynamics of proteins with high-fidelity reconstruction
di: Zhu, Jinzhen
Pubblicazione: (2024)
di: Zhu, Jinzhen
Pubblicazione: (2024)
Determining the optimal structural resolution of proteins through an information-theoretic analysis of their conformational ensemble
di: Mele, Margherita, et al.
Pubblicazione: (2023)
di: Mele, Margherita, et al.
Pubblicazione: (2023)
EXCOGITO, an extensible coarse-graining toolbox for the investigation of biomolecules by means of low-resolution representation
di: Giulini, Marco, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Giulini, Marco, et al.
Pubblicazione: (2024)
Competition for binding targets results in paradoxical effects for simultaneous activator and repressor action -- Extended Version
di: Al-Radhawi, M. Ali, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Al-Radhawi, M. Ali, et al.
Pubblicazione: (2024)
Documenti analoghi
-
The allosteric lever: towards a principle of specific allosteric response
di: Vossel, Maximilian, et al.
Pubblicazione: (2023) -
Mechanosensitive ion channels: Old but new
di: Çetiner, Uğur
Pubblicazione: (2024) -
In vitro binding energies capture Klf4 occupancy across the human genome
di: Schwager, Anne, et al.
Pubblicazione: (2026) -
Multiple binding modes of AKT on PIP$_3$-containing membranes
di: Nakagaki, Yuki, et al.
Pubblicazione: (2026) -
The onset of molecule-spanning dynamics in a multi-domain protein
di: Sohmen, Benedikt, et al.
Pubblicazione: (2021)