Buchumschlag

Deciphering Cell Systems: Machine Learning Perspectives And Approaches For The Analysis Of Single-Cell Data

Fuente: arXiv

Gespeichert in:

Bibliographische Detailangaben
1. Verfasser:	Yang, Yongjian
Format:	Preprint
Veröffentlicht:	2024
Schlagworte:	Quantitative Methods
Online-Zugang:	Acceder al recurso
Tags:	Tag hinzufügen Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!

Ähnliche Einträge

Neurosymbolic Learning for Predicting Cell Fate Decisions from Longitudinal Single Cell Transcriptomics in Paediatric Acute Myeloid Leukemia
von: Uthamacumaran, Abicumaran, et al.
Veröffentlicht: (2025)

GenoHoption: Bridging Gene Network Graphs and Single-Cell Foundation Models
von: Cheng, Jiabei, et al.
Veröffentlicht: (2024)

scSSL-Bench: Benchmarking Self-Supervised Learning for Single-Cell Data
von: Ovcharenko, Olga, et al.
Veröffentlicht: (2025)

HuBMAP Data Portal: A Resource for Multi-Modal Spatial and Single-Cell Data of Healthy Human Tissues
von: Turner, Morgan L., et al.
Veröffentlicht: (2025)

A Quasi-Regression Method for the Mediation Analysis of Zero-Inflated Single-Cell Data
von: Ahn, Seungjun, et al.
Veröffentlicht: (2026)

Robust Approximate Characterization of Single-Cell Heterogeneity in Microbial Growth
von: Paul, Richard D., et al.
Veröffentlicht: (2024)

Infrared Microscopy of Biochemistry and Metabolism in Single Living Eukaryotic Cells
von: Quaroni, Luca
Veröffentlicht: (2025)

Recovering Time-Varying Networks From Single-Cell Data
von: Hasanaj, Euxhen, et al.
Veröffentlicht: (2024)

scellop: A Scalable Redesign of Cell Population Plots for Single-Cell Data
von: Smits, Thomas C., et al.
Veröffentlicht: (2025)

StateXDiff: Cell State-Contextualized Multimodal Diffusion for Single-Cell Perturbation Prediction
von: Shi, Peiting, et al.
Veröffentlicht: (2026)

Single-Cell Proteomics Using Mass Spectrometry
von: Momenzadeh, Amanda, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Escaping Local Optima in the Waddington Landscape: A Two-Stage TRPO-PPO Approach for Single-Cell Perturbation Analysis
von: Boabang, Francis, et al.
Veröffentlicht: (2025)

MAT-Cell: A Multi-Agent Tree-Structured Reasoning Framework for Batch-Level Single-Cell Annotation
von: Yang, Yehui, et al.
Veröffentlicht: (2026)

Linearized Optimal Transport for Analysis of High-Dimensional Point-Cloud and Single-Cell Data
von: Wang, Tianxiang, et al.
Veröffentlicht: (2025)

CEP-IP: An Explainable Framework for Cell Subpopulation Identification in Single-cell Transcriptomics
von: Wong, Kah Keng
Veröffentlicht: (2025)

Benchmarking Preprocessing and Integration Methods in Single-Cell Genomics
von: Anaissi, Ali, et al.
Veröffentlicht: (2026)

PRESCRIBE: Predicting Single-Cell Responses with Bayesian Estimation
von: Cheng, Jiabei, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Virtual Cells: From Conceptual Frameworks to Biomedical Applications
von: Bhardwaj, Saurabh, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Trajectory Inference for Single Cell Omics
von: Hutton, Alexandre, et al.
Veröffentlicht: (2025)

SpikGPT: A High-Accuracy and Interpretable Spiking Attention Framework for Single-Cell Annotation
von: Huang, Min, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Ferrohydrodynamic Microfluidics for Bioparticle Separation and Single-Cell Phenotyping: Principles, Applications, and Emerging Directions
von: Zhang, Yuhao, et al.
Veröffentlicht: (2025)

SynCell: Contextualized Drug Synergy Prediction
von: Peng, Keqin, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Dynamical Inference of Cell Size Regulation Parameters
von: Nieto, Cesar, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Deep Clustering for Blood Cell Classification and Quantification
von: Macarie-Ancau, Mihaela, et al.
Veröffentlicht: (2025)

TEDDY: A Family Of Foundation Models For Understanding Single Cell Biology
von: Chevalier, Alexis, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Enforcing Latent Euclidean Geometry in Single-Cell VAEs for Manifold Interpolation
von: Palma, Alessandro, et al.
Veröffentlicht: (2025)

A Statistical Framework for Co-Mediators of Zero-Inflated Single-Cell RNA-Seq Data
von: Ahn, Seungjun, et al.
Veröffentlicht: (2025)

CellFluxRL: Biologically-Constrained Virtual Cell Modeling via Reinforcement Learning
von: Wu, Dongxia, et al.
Veröffentlicht: (2026)

Subspace Tensor Orthogonal Rotation Model (STORM) for Batch Alignment, Cell Type Deconvolution, and Gene Imputation in Spatial Transcriptomic Data
von: Cottrell, Sean, et al.
Veröffentlicht: (2026)

Learning Molecular Representation in a Cell
von: Liu, Gang, et al.
Veröffentlicht: (2024)

Flat Cell Imaging
von: Nasirimarekani, Vahid, et al.
Veröffentlicht: (2024)

scPPDM: A Diffusion Model for Single-Cell Drug-Response Prediction
von: Liang, Zhaokang, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Departures: Distributional Transport for Single-Cell Perturbation Prediction with Neural Schrödinger Bridges
von: Chi, Changxi, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Single-Cell Proteomic Technologies: Tools in the quest for principles
von: Slavov, Nikolai
Veröffentlicht: (2025)

Cell Painting Gallery: an open resource for image-based profiling
von: Weisbart, Erin, et al.
Veröffentlicht: (2024)

Information-Theoretical Measures for Developmental Cell-Fate Proportioning Processes
von: Ramirez-Sierra, Michael A., et al.
Veröffentlicht: (2025)

scDFM: Distributional Flow Matching Model for Robust Single-Cell Perturbation Prediction
von: Yu, Chenglei, et al.
Veröffentlicht: (2026)

A model of tuberculosis progression using CompuCell3D
von: Doran, James W. G., et al.
Veröffentlicht: (2026)

Multi-Modal and Multi-Attribute Generation of Single Cells with CFGen
von: Palma, Alessandro, et al.
Veröffentlicht: (2024)

Integrating Mechanistic Modeling and Machine Learning to Study CD4+/CD8+ CAR-T Cell Dynamics with Tumor Antigen Regulation
von: Varakunan, Saranya, et al.
Veröffentlicht: (2025)