A Regressor-Guided Graph Diffusion Model for Predicting Enzyme Mutations to Enhance Turnover Number
Fuente:
arXiv
Gespeichert in:
| Hauptverfasser: | Yu, Xiaozhu, Yi, Kai, Wang, Yu Guang, Shen, Yiqing |
|---|---|
| Format: | Preprint |
| Veröffentlicht: |
2024
|
| Schlagworte: | |
| Online-Zugang: | |
| Tags: |
Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
|
Ähnliche Einträge
LaGDif: Latent Graph Diffusion Model for Efficient Protein Inverse Folding with Self-Ensemble
von: Wu, Taoyu, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Wu, Taoyu, et al.
Veröffentlicht: (2024)
AutoProteinEngine: A Large Language Model Driven Agent Framework for Multimodal AutoML in Protein Engineering
von: Liu, Yungeng, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Liu, Yungeng, et al.
Veröffentlicht: (2024)
TourSynbio-Search: A Large Language Model Driven Agent Framework for Unified Search Method for Protein Engineering
von: Liu, Yungeng, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Liu, Yungeng, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Validation of an LLM-based Multi-Agent Framework for Protein Engineering in Dry Lab and Wet Lab
von: Chen, Zan, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Chen, Zan, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Regressor-guided Diffusion Model for De Novo Peptide Sequencing with Explicit Mass Control
von: Chen, Shaorong, et al.
Veröffentlicht: (2026)
von: Chen, Shaorong, et al.
Veröffentlicht: (2026)
Leveraging Protein Language Model Embeddings for Catalytic Turnover Prediction of Adenylate Kinase Orthologs in a Low-Data Regime
von: Muir, Duncan F., et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Muir, Duncan F., et al.
Veröffentlicht: (2025)
Improving Antibody Design with Force-Guided Sampling in Diffusion Models
von: Kulytė, Paulina, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Kulytė, Paulina, et al.
Veröffentlicht: (2024)
CryoNet.Refine: A One-step Diffusion Model for Rapid Refinement of Structural Models with Cryo-EM Density Map Restraints
von: Huang, Fuyao, et al.
Veröffentlicht: (2026)
von: Huang, Fuyao, et al.
Veröffentlicht: (2026)
An Active Learning Framework for Data-Efficient, Human-in-the-Loop Enzyme Function Prediction
von: Babjac, Ashley, et al.
Veröffentlicht: (2026)
von: Babjac, Ashley, et al.
Veröffentlicht: (2026)
DREAM-B3P: Dual-Stream Transformer Network Enhanced by Feedback Diffusion Model for Blood-Brain Barrier Penetrating Peptide Prediction
von: Wang, Kaijie, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Wang, Kaijie, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Retrieval-Enhanced Mutation Mastery: Augmenting Zero-Shot Prediction of Protein Language Model
von: Tan, Yang, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Tan, Yang, et al.
Veröffentlicht: (2024)
From Mutation to Degradation: Predicting Nonsense-Mediated Decay with NMDEP
von: Saadat, Ali, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Saadat, Ali, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Substrate Prediction for RiPP Biosynthetic Enzymes via Masked Language Modeling and Transfer Learning
von: Clark, Joseph D., et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Clark, Joseph D., et al.
Veröffentlicht: (2024)
SubGDiff: A Subgraph Diffusion Model to Improve Molecular Representation Learning
von: Zhang, Jiying, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Zhang, Jiying, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Twin Peaks: Dual-Head Architecture for Structure-Free Prediction of Protein-Protein Binding Affinity and Mutation Effects
von: Dey, Supantha, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Dey, Supantha, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Quantifying AI-to-Clinical Translation: The Algorithm-to-Outcome Concordance (AOC) Framework
von: Yu, Xiyao, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Yu, Xiyao, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Molecular Odor Prediction Based on Multi-Feature Graph Attention Networks
von: Xie, HongXin, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Xie, HongXin, et al.
Veröffentlicht: (2025)
scPPDM: A Diffusion Model for Single-Cell Drug-Response Prediction
von: Liang, Zhaokang, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Liang, Zhaokang, et al.
Veröffentlicht: (2025)
CLIPZyme: Reaction-Conditioned Virtual Screening of Enzymes
von: Mikhael, Peter G., et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Mikhael, Peter G., et al.
Veröffentlicht: (2024)
ALPHAGMUT: A Rationale-Guided Alpha Shape Graph Neural Network to Evaluate Mutation Effects
von: Wang, Boshen, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Wang, Boshen, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Sequential Model for Predicting Patient Adherence in Subcutaneous Immunotherapy for Allergic Rhinitis
von: Li, Yin, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Li, Yin, et al.
Veröffentlicht: (2024)
TemPL: A Novel Deep Learning Model for Zero-Shot Prediction of Protein Stability and Activity Based on Temperature-Guided Language Modeling
von: Tan, Pan, et al.
Veröffentlicht: (2023)
von: Tan, Pan, et al.
Veröffentlicht: (2023)
GenoHoption: Bridging Gene Network Graphs and Single-Cell Foundation Models
von: Cheng, Jiabei, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Cheng, Jiabei, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Bayesian Non-Negative Matrix Factorization with Correlated Mutation Type Probabilities for Mutational Signatures
von: Lang, Iris, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Lang, Iris, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Radical-mediated Electrical Enzyme Assay For At-home Clinical Test
von: Jang, Hyun-June, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Jang, Hyun-June, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Pharmacometrics Modeling via Physics-Informed Neural Networks: Integrating Time-Variant Absorption Rates and Fractional Calculus for Enhancing Prediction Accuracy
von: Ahmadi, Nazanin, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Ahmadi, Nazanin, et al.
Veröffentlicht: (2024)
VIGIL: Vision-Language Guided Multiple Instance Learning Framework for Ulcerative Colitis Histological Healing Prediction
von: Qiu, Zhengxuan, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Qiu, Zhengxuan, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Hyperbolic Graph Diffusion Model
von: Wen, Lingfeng, et al.
Veröffentlicht: (2023)
von: Wen, Lingfeng, et al.
Veröffentlicht: (2023)
A Fine-tuning Dataset and Benchmark for Large Language Models for Protein Understanding
von: Shen, Yiqing, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Shen, Yiqing, et al.
Veröffentlicht: (2024)
KinForm: Kinetics Informed Feature Optimised Representation Models for Enzyme $k_{cat}$ and $K_{M}$ Prediction
von: Alwer, Saleh, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Alwer, Saleh, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Topological Machine Learning for Protein-Nucleic Acid Binding Affinity Changes Upon Mutation
von: Liu, Xiang, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Liu, Xiang, et al.
Veröffentlicht: (2025)
A Graph Completion Method that Jointly Predicts Geometry and Topology Enables Effective Molecule Assembly
von: Koodli, Rohan V., et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Koodli, Rohan V., et al.
Veröffentlicht: (2025)
Equivariant Denoisers Cannot Copy Graphs: Align Your Graph Diffusion Models
von: Laabid, Najwa, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Laabid, Najwa, et al.
Veröffentlicht: (2024)
NaNa and MiGu: Semantic Data Augmentation Techniques to Enhance Protein Classification in Graph Neural Networks
von: Lan, Yi-Shan, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Lan, Yi-Shan, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Graph-Theoretic Models for the Prediction of Molecular Measurements
von: Niane, Anna, et al.
Veröffentlicht: (2026)
von: Niane, Anna, et al.
Veröffentlicht: (2026)
VARIANT: Web Server for Decoding and Analyzing Viral Mutations at Genome and Protein Levels
von: Wang, Rui, et al.
Veröffentlicht: (2026)
von: Wang, Rui, et al.
Veröffentlicht: (2026)
BlastDiffusion: A Latent Diffusion Model for Generating Synthetic Embryo Images to Address Data Scarcity in In Vitro Fertilization
von: Golfe, Alejandro, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Golfe, Alejandro, et al.
Veröffentlicht: (2025)
scDFM: Distributional Flow Matching Model for Robust Single-Cell Perturbation Prediction
von: Yu, Chenglei, et al.
Veröffentlicht: (2026)
von: Yu, Chenglei, et al.
Veröffentlicht: (2026)
Rank-and-Reason: Multi-Agent Collaboration Accelerates Zero-Shot Protein Mutation Prediction
von: Tan, Yang, et al.
Veröffentlicht: (2026)
von: Tan, Yang, et al.
Veröffentlicht: (2026)
ProT-GFDM: A Generative Fractional Diffusion Model for Protein Generation
von: Liang, Xiao, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Liang, Xiao, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Ähnliche Einträge
-
LaGDif: Latent Graph Diffusion Model for Efficient Protein Inverse Folding with Self-Ensemble
von: Wu, Taoyu, et al.
Veröffentlicht: (2024) -
AutoProteinEngine: A Large Language Model Driven Agent Framework for Multimodal AutoML in Protein Engineering
von: Liu, Yungeng, et al.
Veröffentlicht: (2024) -
TourSynbio-Search: A Large Language Model Driven Agent Framework for Unified Search Method for Protein Engineering
von: Liu, Yungeng, et al.
Veröffentlicht: (2024) -
Validation of an LLM-based Multi-Agent Framework for Protein Engineering in Dry Lab and Wet Lab
von: Chen, Zan, et al.
Veröffentlicht: (2024) -
Regressor-guided Diffusion Model for De Novo Peptide Sequencing with Explicit Mass Control
von: Chen, Shaorong, et al.
Veröffentlicht: (2026)