Buchumschlag

DP-HLS: A High-Level Synthesis Framework for Accelerating Dynamic Programming Algorithms in Bioinformatics

Fuente: arXiv

Gespeichert in:

Bibliographische Detailangaben
Hauptverfasser:	Cao, Yingqi, Gupta, Anshu, Liang, Jason, Turakhia, Yatish
Format:	Preprint
Veröffentlicht:	2024
Schlagworte:	Hardware Architecture Distributed, Parallel, and Cluster Computing
Online-Zugang:	Acceder al recurso
Tags:	Tag hinzufügen Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!

Ähnliche Einträge

TAPA: A Scalable Task-Parallel Dataflow Programming Framework for Modern FPGAs with Co-Optimization of HLS and Physical Design
von: Guo, Licheng, et al.
Veröffentlicht: (2022)

PUDTune: Multi-Level Charging for High-Precision Calibration in Processing-Using-DRAM
von: Kubo, Tatsuya, et al.
Veröffentlicht: (2025)

TAPA-CS: Enabling Scalable Accelerator Design on Distributed HBM-FPGAs
von: Prakriya, Neha, et al.
Veröffentlicht: (2023)

Accelerating MoE with Dynamic In-Switch Computing on Multi-GPUs
von: Zhang, Qijun, et al.
Veröffentlicht: (2026)

HLS4PC: A Parametrizable Framework For Accelerating Point-Based 3D Point Cloud Models on FPGA
von: Pal, Amur Saqib, et al.
Veröffentlicht: (2025)

A Lightweight High-Throughput Collective-Capable NoC for Large-Scale ML Accelerators
von: Colagrande, Luca, et al.
Veröffentlicht: (2026)

MVDRAM: Enabling GeMV Execution in Unmodified DRAM for Low-Bit LLM Acceleration
von: Kubo, Tatsuya, et al.
Veröffentlicht: (2025)

FLEX: Leveraging FPGA-CPU Synergy for Mixed-Cell-Height Legalization Acceleration
von: Liu, Xingyu, et al.
Veröffentlicht: (2025)

RAPID-Graph: Recursive All-Pairs Shortest Paths Using Processing-in-Memory for Dynamic Programming on Graphs
von: Chen, Yanru, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Sparse MTTKRP Acceleration for Tensor Decomposition on GPU
von: Wijeratne, Sasindu, et al.
Veröffentlicht: (2024)

Leveraging SIMD for Accelerating Large-number Arithmetic
von: Das, Subhrajit, et al.
Veröffentlicht: (2026)

DeepStack: Scalable and Accurate Design Space Exploration for Distributed 3D-Stacked AI Accelerators
von: Mo, Zhiwen, et al.
Veröffentlicht: (2026)

Accelerating Triangle Counting with Real Processing-in-Memory Systems
von: Asquini, Lorenzo, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Balanced Data Placement for GEMV Acceleration with Processing-In-Memory
von: Ibrahim, Mohamed Assem, et al.
Veröffentlicht: (2024)

Accelerating Data Chunking in Deduplication Systems using Vector Instructions
von: Udayashankar, Sreeharsha, et al.
Veröffentlicht: (2025)

RapidStream IR: Infrastructure for FPGA High-Level Physical Synthesis
von: Lau, Jason, et al.
Veröffentlicht: (2024)

A Heterogeneous Chiplet Architecture for Accelerating End-to-End Transformer Models
von: Sharma, Harsh, et al.
Veröffentlicht: (2023)

Application Experiences on a GPU-Accelerated Arm-based HPC Testbed
von: Elwasif, Wael, et al.
Veröffentlicht: (2022)

Workload-Aware Hardware Accelerator Mining for Distributed Deep Learning Training
von: Adnan, Muhammad, et al.
Veröffentlicht: (2024)

Proteus: Enabling High-Performance Processing-Using-DRAM with Dynamic Bit-Precision, Adaptive Data Representation, and Flexible Arithmetic
von: Oliveira, Geraldo F., et al.
Veröffentlicht: (2025)

Design in Tiles: Automating GEMM Deployment on Tile-Based Many-PE Accelerators
von: Shen, Aofeng, et al.
Veröffentlicht: (2025)

An Evaluation and Comparison of GPU Hardware and Solver Libraries for Accelerating the OPM Flow Reservoir Simulator
von: Qiu, Tong Dong, et al.
Veröffentlicht: (2023)

CMDS: Cross-layer Dataflow Optimization for DNN Accelerators Exploiting Multi-bank Memories
von: Shi, Man, et al.
Veröffentlicht: (2024)

DiP: A Scalable, Energy-Efficient Systolic Array for Matrix Multiplication Acceleration
von: Abdelmaksoud, Ahmed J., et al.
Veröffentlicht: (2024)

EDEA: Efficient Dual-Engine Accelerator for Depthwise Separable Convolution with Direct Data Transfer
von: Chen, Yi, et al.
Veröffentlicht: (2025)

MLDSE: Scaling Design Space Exploration Infrastructure for Multi-Level Hardware
von: Qu, Huanyu, et al.
Veröffentlicht: (2025)

A Survey on Graph Neural Network Acceleration: Algorithms, Systems, and Customized Hardware
von: Zhang, Shichang, et al.
Veröffentlicht: (2023)

CCSS: Hardware-Accelerated RTL Simulation with Fast Combinational Logic Computing and Sequential Logic Synchronization
von: Feng, Weigang, et al.
Veröffentlicht: (2025)

A Survey of Real-time Scheduling on Accelerator-based Heterogeneous Architecture for Time Critical Applications
von: Zou, An, et al.
Veröffentlicht: (2025)

New Tools, Programming Models, and System Support for Processing-in-Memory Architectures
von: Oliveira, Geraldo F.
Veröffentlicht: (2025)

SLIM: A Heterogeneous Accelerator for Edge Inference of Sparse Large Language Model via Adaptive Thresholding
von: Xu, Weihong, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Efficient Batch Search Algorithm for B+ Tree Index Structures with Level-Wise Traversal on FPGAs
von: Tzschoppe, Max, et al.
Veröffentlicht: (2026)

MANOJAVAM: A Scalable, Unified FPGA Accelerator for Matrix Multiplication and Singular Value Decomposition in Principal Component Analysis
von: Ramasubramanian, Srivaths, et al.
Veröffentlicht: (2026)

Chopper: A Multi-Level GPU Characterization Tool & Derived Insights Into LLM Training Inefficiency
von: Kurzynski, Marco, et al.
Veröffentlicht: (2025)

XDMA: A Distributed, Extensible DMA Architecture for Layout-Flexible Data Movements in Heterogeneous Multi-Accelerator SoCs
von: Kong, Fanchen, et al.
Veröffentlicht: (2025)

DeFiNES: Enabling Fast Exploration of the Depth-first Scheduling Space for DNN Accelerators through Analytical Modeling
von: Mei, Linyan, et al.
Veröffentlicht: (2022)

MoE-Hub: Taming Software Complexity for Seamless MoE Overlap with Hardware-Accelerated Communication on Multi-GPU Systems
von: Zhou, Zhuoshan, et al.
Veröffentlicht: (2026)

Simopt-Power: Leveraging Simulation Metadata for Low-Power Design Synthesis
von: Wadhwa, Eashan, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Dynamic Simultaneous Multithreaded Architecture
von: Ortiz-Arroyo, Daniel, et al.
Veröffentlicht: (2024)

Implementation and Evaluation of GBDI Memory Compression Algorithm Using C/C++ on a Broader Range of Workloads
von: Aina, Adeyemi
Veröffentlicht: (2025)