OneProt: Towards Multi-Modal Protein Foundation Models
Fuente:
arXiv
Gespeichert in:
| Hauptverfasser: | Flöge, Klemens, Udayakumar, Srisruthi, Sommer, Johanna, Piraud, Marie, Kesselheim, Stefan, Fortuin, Vincent, Günneman, Stephan, van der Weg, Karel J, Gohlke, Holger, Merdivan, Erinc, Bazarova, Alina |
|---|---|
| Format: | Preprint |
| Veröffentlicht: |
2024
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