Fitting Coarse-Grained Models to Macroscopic Experimental Data via Automatic Differentiation
Fuente:
arXiv
Salvato in:
| Autori principali: | Krueger, Ryan K., Engel, Megan C., Hausen, Ryan, Brenner, Michael P. |
|---|---|
| Natura: | Preprint |
| Pubblicazione: |
2024
|
| Soggetti: | |
| Accesso online: | |
| Tags: |
Aggiungi Tag
Nessun Tag, puoi essere il primo ad aggiungerne!!
|
Documenti analoghi
Tuning Colloidal Reactions
di: Krueger, Ryan, et al.
Pubblicazione: (2023)
di: Krueger, Ryan, et al.
Pubblicazione: (2023)
Iterative improvement of free energy landscape reconstructions with optimal protocols derived from differentiable simulations
di: Cheng, Oliver, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Cheng, Oliver, et al.
Pubblicazione: (2025)
Emergent Detailed Balance in Human Mobility under Temporal Coarse-Graining
di: Dong, Lei
Pubblicazione: (2026)
di: Dong, Lei
Pubblicazione: (2026)
On Macroscopic Intricate States
di: Dubois, François
Pubblicazione: (2024)
di: Dubois, François
Pubblicazione: (2024)
Coarse-Graining via Lumping: Exact Calculations and Fundamental Limitations
di: Teza, Gianluca, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Teza, Gianluca, et al.
Pubblicazione: (2025)
Ionic transport through a protein nanopore: a Coarse-Grained Molecular Dynamics Study
di: Nathalie, Basdevant, et al.
Pubblicazione: (2018)
di: Nathalie, Basdevant, et al.
Pubblicazione: (2018)
Current rectification and ionic selectivity of alpha-hemolysin: Coarse-Grained Molecular Dynamics simulations
di: Dessaux, Delphine, et al.
Pubblicazione: (2022)
di: Dessaux, Delphine, et al.
Pubblicazione: (2022)
Coarse-grained modelling of DNA-RNA hybrids
di: Ratajczyk, Eryk J., et al.
Pubblicazione: (2023)
di: Ratajczyk, Eryk J., et al.
Pubblicazione: (2023)
Coarse-graining effect in axonal wiring databases confirms the exponential distance rule
di: Józsa, Máté, et al.
Pubblicazione: (2023)
di: Józsa, Máté, et al.
Pubblicazione: (2023)
Macroscopic fluctuation-response theory and its use for gene regulatory networks
di: Aslyamov, Timur, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Aslyamov, Timur, et al.
Pubblicazione: (2025)
Information processing driven by multicomponent surface condensates
di: Zentner, Aidan, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Zentner, Aidan, et al.
Pubblicazione: (2025)
Macroscopic bioinspired magnetic active matter and the physical limits of magnetotaxis
di: Sepúlveda, Néstor, et al.
Pubblicazione: (2021)
di: Sepúlveda, Néstor, et al.
Pubblicazione: (2021)
Microscopic Variability Alters Macroscopic Rotation Speed in Stochastic Spiral Waves
di: Kamphuis, Jolien, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Kamphuis, Jolien, et al.
Pubblicazione: (2025)
Neon tetra fish (Paracheirodon innesi) as farm-to-optical-table Bragg reflectors
di: Sheffield, D. Ryan, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Sheffield, D. Ryan, et al.
Pubblicazione: (2024)
Restoring information in aged gene regulatory networks by single knock-ins
di: LeFebre, Ryan, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: LeFebre, Ryan, et al.
Pubblicazione: (2026)
Coarse-graining dense, deformable active particles
di: Nejad, Mehrana R., et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Nejad, Mehrana R., et al.
Pubblicazione: (2025)
Fitness inference tested by in silico population genetics
di: Zeng, Hong-Li, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Zeng, Hong-Li, et al.
Pubblicazione: (2025)
Minority-Triggered Reorientations Yield Macroscopic Cascades and Enhanced Responsiveness in Swarms
di: Syga, Simon, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Syga, Simon, et al.
Pubblicazione: (2026)
ToSkA: Topological Skeleton Analysis for Network-Based Shape Representation and Evaluation of Objects from Cells to Death Stars
di: Ryan, Allyson Quinn, et al.
Pubblicazione: (2023)
di: Ryan, Allyson Quinn, et al.
Pubblicazione: (2023)
Structure-Based Experimental Datasets for Benchmarking Protein Simulation Force Fields
di: Cavender, Chapin E., et al.
Pubblicazione: (2023)
di: Cavender, Chapin E., et al.
Pubblicazione: (2023)
Modelling floral and arthropod electrostatics using a two-domain AAA-least squares algorithm
di: Harris, Samuel J., et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Harris, Samuel J., et al.
Pubblicazione: (2024)
Peptide Classification from Statistical Analysis of Nanopore Translocation Experiments
di: Hoßbach, Julian, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Hoßbach, Julian, et al.
Pubblicazione: (2024)
Chesapeake Bay Food Web: Robustness Analysis via Energy Cutoff in Complex Networks
di: Souza, Eduardo M. K., et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Souza, Eduardo M. K., et al.
Pubblicazione: (2026)
Physics-Informed Machine Learning for Microscale Drying of Plant-Based Foods: A Systematic Review of Computational Models and Experimental Insights
di: Batuwatta-Gamage, C. P., et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Batuwatta-Gamage, C. P., et al.
Pubblicazione: (2025)
Coarse-graining nonequilibrium diffusions with Markov chains
di: Nartallo-Kaluarachchi, Ramón, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Nartallo-Kaluarachchi, Ramón, et al.
Pubblicazione: (2025)
Protein overabundance is driven by growth robustness
di: Choi, H. James, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Choi, H. James, et al.
Pubblicazione: (2024)
Noise-Driven Differentiation via Gene Frustration and Epigenetic Fixation
di: Plugers, Davey, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Plugers, Davey, et al.
Pubblicazione: (2026)
BoltzNCE: Learning Likelihoods for Boltzmann Generation with Stochastic Interpolants and Noise Contrastive Estimation
di: Aggarwal, Rishal, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Aggarwal, Rishal, et al.
Pubblicazione: (2025)
Coarse-graining dynamics to maximize irreversibility
di: Yu, Qiwei, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Yu, Qiwei, et al.
Pubblicazione: (2025)
Applying an electrostatic cross-correlation to the CFTR-ATP interaction
di: Saad-Falcon, Alex, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Saad-Falcon, Alex, et al.
Pubblicazione: (2024)
RNA Dynamics from Experimental and Computational Approaches
di: Bussi, Giovanni, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Bussi, Giovanni, et al.
Pubblicazione: (2024)
General Purpose Inverse Design of Heterogeneous Finite-Sized Assemblies
di: Guttieres, Livia A. J., et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Guttieres, Livia A. J., et al.
Pubblicazione: (2025)
Optimizing information transmission in optogenetic Wnt signaling
di: Witteveen, Olivier, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Witteveen, Olivier, et al.
Pubblicazione: (2025)
Automatic Forward Model Parameterization with Bayesian Inference of Conformational Populations
di: Raddi, Robert M., et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Raddi, Robert M., et al.
Pubblicazione: (2024)
A Macroscopically Consistent Reactive Langevin Dynamics Model
di: Isaacson, Samuel A., et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Isaacson, Samuel A., et al.
Pubblicazione: (2025)
Active Darcy's Law
di: Keogh, Ryan R., et al.
Pubblicazione: (2023)
di: Keogh, Ryan R., et al.
Pubblicazione: (2023)
Social Physics of Bacteria: Avoidance of an Information Black Hole
di: Phan, Trung V., et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Phan, Trung V., et al.
Pubblicazione: (2024)
Haematocrit and Shear Rate Modulate Local Cell-free Layer Thickness and Platelet Margination in Blood Flow Along a Sinusoidal Wall
di: Pero, Eleonora, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Pero, Eleonora, et al.
Pubblicazione: (2026)
A Lip Vibration Model Using Mechanical Properties of Flesh
di: Strauss, Michael
Pubblicazione: (2024)
di: Strauss, Michael
Pubblicazione: (2024)
Temporal Coarse-Graining as the Origin of Macroscopic Friction in Quantum Spin Chains via Data-Driven Liouvillian Extraction
di: Saito, Seiki
Pubblicazione: (2026)
di: Saito, Seiki
Pubblicazione: (2026)
Documenti analoghi
-
Tuning Colloidal Reactions
di: Krueger, Ryan, et al.
Pubblicazione: (2023) -
Iterative improvement of free energy landscape reconstructions with optimal protocols derived from differentiable simulations
di: Cheng, Oliver, et al.
Pubblicazione: (2025) -
Emergent Detailed Balance in Human Mobility under Temporal Coarse-Graining
di: Dong, Lei
Pubblicazione: (2026) -
On Macroscopic Intricate States
di: Dubois, François
Pubblicazione: (2024) -
Coarse-Graining via Lumping: Exact Calculations and Fundamental Limitations
di: Teza, Gianluca, et al.
Pubblicazione: (2025)