MADGEN: Mass-Spec attends to De Novo Molecular generation
Fuente:
arXiv
Salvato in:
| Autori principali: | Wang, Yinkai, Chen, Xiaohui, Liu, Liping, Hassoun, Soha |
|---|---|
| Natura: | Preprint |
| Pubblicazione: |
2025
|
| Soggetti: | |
| Accesso online: | |
| Tags: |
Aggiungi Tag
Nessun Tag, puoi essere il primo ad aggiungerne!!
|
Documenti analoghi
SpecBridge: Bridging Mass Spectrometry and Molecular Representations via Cross-Modal Alignment
di: Wang, Yinkai, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Wang, Yinkai, et al.
Pubblicazione: (2026)
Graph Generative Pre-trained Transformer
di: Chen, Xiaohui, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Chen, Xiaohui, et al.
Pubblicazione: (2025)
Large Language Model is Secretly a Protein Sequence Optimizer
di: Wang, Yinkai, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Wang, Yinkai, et al.
Pubblicazione: (2025)
JESTR: Joint Embedding Space Technique for Ranking Candidate Molecules for the Annotation of Untargeted Metabolomics Data
di: Kalia, Apurva, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Kalia, Apurva, et al.
Pubblicazione: (2024)
De Novo Molecular Generation from Mass Spectra via Many-Body Enhanced Diffusion
di: Sun, Xichen, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Sun, Xichen, et al.
Pubblicazione: (2026)
Molecular De Novo Design through Transformer-based Reinforcement Learning
di: Xu, Pengcheng, et al.
Pubblicazione: (2023)
di: Xu, Pengcheng, et al.
Pubblicazione: (2023)
MetaMolGen: A Neural Graph Motif Generation Model for De Novo Molecular Design
di: Yan, Zimo, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Yan, Zimo, et al.
Pubblicazione: (2025)
PepSpecBench: A Unified Evaluation Benchmark for Peptide Tandem Mass Spectrometry Prediction
di: Yang, Zhiwen, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Yang, Zhiwen, et al.
Pubblicazione: (2026)
t-SMILES: A Scalable Fragment-based Molecular Representation Framework for De Novo Molecule Generation
di: Wu, Juan-Ni, et al.
Pubblicazione: (2023)
di: Wu, Juan-Ni, et al.
Pubblicazione: (2023)
Uncertainty-Aware Multi-Objective Reinforcement Learning-Guided Diffusion Models for 3D De Novo Molecular Design
di: Chen, Lianghong, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Chen, Lianghong, et al.
Pubblicazione: (2025)
MolRGen: A Training and Evaluation Setting for De Novo Molecular Generation with Reasonning Models
di: Formont, Philippe, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Formont, Philippe, et al.
Pubblicazione: (2026)
General Intelligence-based Fragmentation (GIF): A framework for peak-labeled spectra simulation
di: Martin, Margaret R., et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Martin, Margaret R., et al.
Pubblicazione: (2025)
SpecQuant: Spectral Decomposition and Adaptive Truncation for Ultra-Low-Bit LLMs Quantization
di: Zhao, Zhixiong, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Zhao, Zhixiong, et al.
Pubblicazione: (2025)
Test-Time Tuned Language Models Enable End-to-end De Novo Molecular Structure Generation from MS/MS Spectra
di: Mismetti, Laura, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Mismetti, Laura, et al.
Pubblicazione: (2025)
Universal Biological Sequence Reranking for Improved De Novo Peptide Sequencing
di: Qiu, Zijie, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Qiu, Zijie, et al.
Pubblicazione: (2025)
ProSpec RL: Plan Ahead, then Execute
di: Liu, Liangliang, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Liu, Liangliang, et al.
Pubblicazione: (2024)
Spec-VLA: Speculative Decoding for Vision-Language-Action Models with Relaxed Acceptance
di: Wang, Songsheng, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Wang, Songsheng, et al.
Pubblicazione: (2025)
BubbleSpec: Turning Long-Tail Bubbles into Speculative Rollout Drafts for Synchronous Reinforcement Learning
di: Xu, Yuhang, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Xu, Yuhang, et al.
Pubblicazione: (2026)
Scalable and Cost-Efficient de Novo Template-Based Molecular Generation
di: Gaiński, Piotr, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Gaiński, Piotr, et al.
Pubblicazione: (2025)
BanditSpec: Adaptive Speculative Decoding via Bandit Algorithms
di: Hou, Yunlong, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Hou, Yunlong, et al.
Pubblicazione: (2025)
SpecMD: A Comprehensive Study On Speculative Expert Prefetching
di: Hoang, Duc, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Hoang, Duc, et al.
Pubblicazione: (2026)
SpecTM: Spectral Targeted Masking for Trustworthy Foundation Models
di: Imtiaz, Syed Usama, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Imtiaz, Syed Usama, et al.
Pubblicazione: (2026)
SpecExit: Accelerating Large Reasoning Model via Speculative Exit
di: Yang, Rubing, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Yang, Rubing, et al.
Pubblicazione: (2025)
QuantSpec: Self-Speculative Decoding with Hierarchical Quantized KV Cache
di: Tiwari, Rishabh, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Tiwari, Rishabh, et al.
Pubblicazione: (2025)
SpecReason: Fast and Accurate Inference-Time Compute via Speculative Reasoning
di: Pan, Rui, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Pan, Rui, et al.
Pubblicazione: (2025)
Graph Pruning for Enumeration of Minimal Unsatisfiable Subsets
di: Lymperopoulos, Panagiotis, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Lymperopoulos, Panagiotis, et al.
Pubblicazione: (2024)
Transformers trained on proteins can learn to attend to Euclidean distance
di: Ellmen, Isaac, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Ellmen, Isaac, et al.
Pubblicazione: (2025)
HiSpec: Hierarchical Speculative Decoding for LLMs
di: Kumar, Avinash, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Kumar, Avinash, et al.
Pubblicazione: (2025)
SpecMemo: Speculative Decoding is in Your Pocket
di: Yildirim, Selin, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Yildirim, Selin, et al.
Pubblicazione: (2025)
SpecDec++: Boosting Speculative Decoding via Adaptive Candidate Lengths
di: Huang, Kaixuan, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Huang, Kaixuan, et al.
Pubblicazione: (2024)
De Novo Generation of Hit-like Molecules from Gene Expression Profiles via Deep Learning
di: Li, Chen, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Li, Chen, et al.
Pubblicazione: (2024)
SpecForge: A Flexible and Efficient Open-Source Training Framework for Speculative Decoding
di: Li, Shenggui, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Li, Shenggui, et al.
Pubblicazione: (2026)
CAS-Spec: Cascade Adaptive Self-Speculative Decoding for On-the-Fly Lossless Inference Acceleration of LLMs
di: Ning, Zhiyuan, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Ning, Zhiyuan, et al.
Pubblicazione: (2025)
KnapSpec: Self-Speculative Decoding via Adaptive Layer Selection as a Knapsack Problem
di: Cha, Seongjin, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Cha, Seongjin, et al.
Pubblicazione: (2026)
SpecReX: Explainable AI for Raman Spectroscopy
di: Blake, Nathan, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Blake, Nathan, et al.
Pubblicazione: (2025)
LongSpec: Long-Context Lossless Speculative Decoding with Efficient Drafting and Verification
di: Yang, Penghui, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Yang, Penghui, et al.
Pubblicazione: (2025)
ActivityDiff: A diffusion model with Positive and Negative Activity Guidance for De Novo Drug Design
di: Zhou, Renyi, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Zhou, Renyi, et al.
Pubblicazione: (2025)
SpecMoE: A Fast and Efficient Mixture-of-Experts Inference via Self-Assisted Speculative Decoding
di: Bang, Jehyeon, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Bang, Jehyeon, et al.
Pubblicazione: (2026)
DistillSpec: Improving Speculative Decoding via Knowledge Distillation
di: Zhou, Yongchao, et al.
Pubblicazione: (2023)
di: Zhou, Yongchao, et al.
Pubblicazione: (2023)
FR-Spec: Accelerating Large-Vocabulary Language Models via Frequency-Ranked Speculative Sampling
di: Zhao, Weilin, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Zhao, Weilin, et al.
Pubblicazione: (2025)
Documenti analoghi
-
SpecBridge: Bridging Mass Spectrometry and Molecular Representations via Cross-Modal Alignment
di: Wang, Yinkai, et al.
Pubblicazione: (2026) -
Graph Generative Pre-trained Transformer
di: Chen, Xiaohui, et al.
Pubblicazione: (2025) -
Large Language Model is Secretly a Protein Sequence Optimizer
di: Wang, Yinkai, et al.
Pubblicazione: (2025) -
JESTR: Joint Embedding Space Technique for Ranking Candidate Molecules for the Annotation of Untargeted Metabolomics Data
di: Kalia, Apurva, et al.
Pubblicazione: (2024) -
De Novo Molecular Generation from Mass Spectra via Many-Body Enhanced Diffusion
di: Sun, Xichen, et al.
Pubblicazione: (2026)