D3MES: Diffusion Transformer with multihead equivariant self-attention for 3D molecule generation
Fuente:
arXiv
Gespeichert in:
| Hauptverfasser: | Zhang, Zhejun, Chen, Yuanping, Chu, Shibing |
|---|---|
| Format: | Preprint |
| Veröffentlicht: |
2025
|
| Schlagworte: | |
| Online-Zugang: | |
| Tags: |
Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
|
Ähnliche Einträge
Discovery of 2D Materials via Symmetry-Constrained Diffusion Model
von: Xu, Shihang, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Xu, Shihang, et al.
Veröffentlicht: (2024)
E(3)-equivariant models cannot learn chirality: Field-based molecular generation
von: Dumitrescu, Alexandru, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Dumitrescu, Alexandru, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Using GNN property predictors as molecule generators
von: Therrien, Félix, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Therrien, Félix, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Latent Diffusion-Based 3D Molecular Recovery from Vibrational Spectra
von: Wu, Wenjin, et al.
Veröffentlicht: (2026)
von: Wu, Wenjin, et al.
Veröffentlicht: (2026)
An Equivariant Pretrained Transformer for Unified 3D Molecular Representation Learning
von: Jiao, Rui, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Jiao, Rui, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Distributional Priors Guided Diffusion for Generating 3D Molecules in Low Data Regimes
von: Hong, Haokai, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Hong, Haokai, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Physics-informed generative model for drug-like molecule conformers
von: Williams, David C., et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Williams, David C., et al.
Veröffentlicht: (2024)
Enhancing molecular dynamics with equivariant machine-learned densities
von: Bogojeski, Mihail, et al.
Veröffentlicht: (2026)
von: Bogojeski, Mihail, et al.
Veröffentlicht: (2026)
Scalable Autoregressive 3D Molecule Generation
von: Cheng, Austin H., et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Cheng, Austin H., et al.
Veröffentlicht: (2025)
Text-guided Diffusion Model for 3D Molecule Generation
von: Luo, Yanchen, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Luo, Yanchen, et al.
Veröffentlicht: (2024)
A novel molecule generative model of VAE combined with Transformer for unseen structure generation
von: Yoshikai, Yasuhiro, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Yoshikai, Yasuhiro, et al.
Veröffentlicht: (2024)
High-performance training and inference for deep equivariant interatomic potentials
von: Tan, Chuin Wei, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Tan, Chuin Wei, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Deconstructing equivariant representations in molecular systems
von: Lee, Kin Long Kelvin, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Lee, Kin Long Kelvin, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Computing excited states of molecules using normalizing flows
von: Saleh, Yahya, et al.
Veröffentlicht: (2023)
von: Saleh, Yahya, et al.
Veröffentlicht: (2023)
Reflection-Equivariant Diffusion for 3D Structure Determination from Isotopologue Rotational Spectra in Natural Abundance
von: Cheng, Austin, et al.
Veröffentlicht: (2023)
von: Cheng, Austin, et al.
Veröffentlicht: (2023)
Complete and Efficient Covariants for 3D Point Configurations with Application to Learning Molecular Quantum Properties
von: Maennel, Hartmut, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Maennel, Hartmut, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Diagnosing and fixing common problems in Bayesian optimization for molecule design
von: Tripp, Austin, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Tripp, Austin, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Predicting performance-related properties of refrigerant based on tailored small-molecule functional group contribution
von: Cao, Peilin, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Cao, Peilin, et al.
Veröffentlicht: (2025)
TraceGrad: a Framework Learning Expressive SO(3)-equivariant Non-linear Representations for Electronic-Structure Hamiltonian Prediction
von: Yin, Shi, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Yin, Shi, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Sculpting Molecules in Text-3D Space: A Flexible Substructure Aware Framework for Text-Oriented Molecular Optimization
von: Zhang, Kaiwei, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Zhang, Kaiwei, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Machine learning Hubbard parameters with equivariant neural networks
von: Uhrin, Martin, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Uhrin, Martin, et al.
Veröffentlicht: (2024)
A 3D pocket-aware and evolutionary conserved interaction guided diffusion model for molecular optimization
von: Qiao, Anjie, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Qiao, Anjie, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Predicting small molecules solubilities on endpoint devices using deep ensemble neural networks
von: Ramos, Mayk Caldas, et al.
Veröffentlicht: (2023)
von: Ramos, Mayk Caldas, et al.
Veröffentlicht: (2023)
Twins in rotational spectroscopy: Does a rotational spectrum uniquely identify a molecule?
von: Schwarting, Marcus, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Schwarting, Marcus, et al.
Veröffentlicht: (2024)
ELECTRA: A Cartesian Network for 3D Charge Density Prediction with Floating Orbitals
von: Elsborg, Jonas, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Elsborg, Jonas, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Multi-objective fluorescent molecule design with a data-physics dual-driven generative framework
von: Li, Yanheng, et al.
Veröffentlicht: (2026)
von: Li, Yanheng, et al.
Veröffentlicht: (2026)
Fractional Denoising for 3D Molecular Pre-training
von: Feng, Shikun, et al.
Veröffentlicht: (2023)
von: Feng, Shikun, et al.
Veröffentlicht: (2023)
onepot CORE -- an enumerated chemical space to streamline drug discovery, enabled by automated small molecule synthesis and AI
von: Tyrin, Andrei S., et al.
Veröffentlicht: (2026)
von: Tyrin, Andrei S., et al.
Veröffentlicht: (2026)
EquiFlow: Equivariant Conditional Flow Matching with Optimal Transport for 3D Molecular Conformation Prediction
von: Tian, Qingwen, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Tian, Qingwen, et al.
Veröffentlicht: (2024)
HEroBM: a deep equivariant graph neural network for universal backmapping from coarse-grained to all-atom representations
von: Angioletti, Daniele, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Angioletti, Daniele, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Label-free SERS Discrimination of Proline from Hydroxylated Proline at Single-molecule Level Assisted by a Deep Learning Model
von: Zhao, Yingqi, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Zhao, Yingqi, et al.
Veröffentlicht: (2024)
DiffNMR: Diffusion Models for Nuclear Magnetic Resonance Spectra Elucidation
von: Yang, Qingsong, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Yang, Qingsong, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Building-Block Aware Generative Modeling for 3D Crystals of Metal Organic Frameworks
von: Duan, Chenru, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Duan, Chenru, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Machine learning topological energy braiding of non-Bloch bands
von: Shi, Shuwei, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Shi, Shuwei, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Learning from the electronic structure of molecules across the periodic table
von: Kaniselvan, Manasa, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Kaniselvan, Manasa, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Chemistry-Enhanced Diffusion-Based Framework for Small-to-Large Molecular Conformation Generation
von: Zhu, Yifei, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Zhu, Yifei, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Atomic Diffusion Models for Small Molecule Structure Elucidation from NMR Spectra
von: Xiong, Ziyu, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Xiong, Ziyu, et al.
Veröffentlicht: (2025)
HybridLinker: Topology-Guided Posterior Sampling for Enhanced Diversity and Validity in 3D Molecular Linker Generation
von: Hwang, Minyeong, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Hwang, Minyeong, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Solvaformer: an SE(3)-equivariant graph transformer for small molecule solubility prediction
von: Broadbent, Jonathan, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Broadbent, Jonathan, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Unified Generative Modeling of 3D Molecules via Bayesian Flow Networks
von: Song, Yuxuan, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Song, Yuxuan, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Ähnliche Einträge
-
Discovery of 2D Materials via Symmetry-Constrained Diffusion Model
von: Xu, Shihang, et al.
Veröffentlicht: (2024) -
E(3)-equivariant models cannot learn chirality: Field-based molecular generation
von: Dumitrescu, Alexandru, et al.
Veröffentlicht: (2024) -
Using GNN property predictors as molecule generators
von: Therrien, Félix, et al.
Veröffentlicht: (2024) -
Latent Diffusion-Based 3D Molecular Recovery from Vibrational Spectra
von: Wu, Wenjin, et al.
Veröffentlicht: (2026) -
An Equivariant Pretrained Transformer for Unified 3D Molecular Representation Learning
von: Jiao, Rui, et al.
Veröffentlicht: (2024)