Buchumschlag

Theoretical Models for Tension-Dependent DNA Looping Time

Fuente: arXiv

Gespeichert in:

Bibliographische Detailangaben
Hauptverfasser:	Laeremans, Wout, Ellenbroek, Wouter G
Format:	Preprint
Veröffentlicht:	2025
Schlagworte:	Statistical Mechanics Biological Physics
Online-Zugang:	Acceder al recurso
Tags:	Tag hinzufügen Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!

Ähnliche Einträge

Polymer dynamics under tension: mean first passage time for looping
von: Laeremans, Wout, et al.
Veröffentlicht: (2024)

Synthetic design of force-responsive hydrogels with ring-forming catch bonds
von: Laeremans, Wout, et al.
Veröffentlicht: (2026)

ATP-Dependent Mismatch Recognition in DNA Replication Mismatch Repair
von: Zhang, Nianqin, et al.
Veröffentlicht: (2022)

Insights into elastic properties of coarse-grained DNA models: q-stiffness of cgDNA vs. cgDNA+
von: Laeremans, Wout, et al.
Veröffentlicht: (2024)

Exploring the benefits of DNA-target search with antenna
von: Hedström, Lucas, et al.
Veröffentlicht: (2023)

Decomposing Non-Markovian History Dependence
von: Leighton, Matthew P., et al.
Veröffentlicht: (2025)

Thermodynamic Optimization of Sensory Adaptation via Game-Theoretic Path Integrals
von: Kim, Gunn
Veröffentlicht: (2026)

Probing the statistics of sequence-dependent DNA conformations in solution using SAXS
von: Koning, Heidar J., et al.
Veröffentlicht: (2025)

Identifying Influential and Vulnerable Nodes in Interaction Networks through Estimation of Transfer Entropy Between Univariate and Multivariate Time Series
von: Lee, Julian
Veröffentlicht: (2024)

Protein-DNA Co-condensation is Prewetting to a Collapsed Polymer
von: Rouches, Mason N., et al.
Veröffentlicht: (2024)

A statistical mechanics investigation of Unfolded Protein Response across organisms
von: Luchetti, Nicole, et al.
Veröffentlicht: (2024)

Hierarchical Reconstruction of Time-arrow from Multi-time Correlations
von: Cheng, Yijia, et al.
Veröffentlicht: (2026)

Target search on DNA -- effect of coiling
von: Lomholt, Michael A., et al.
Veröffentlicht: (2023)

Nonlocal Structural Effects of Water on DNA Homology Recognition
von: Haimov, Ehud, et al.
Veröffentlicht: (2024)

Thermodynamic inference in molecular motors: a Martingale approach
von: Nadal-Rosa, Adrián, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Repulsive particle interactions enable selective information processing at cellular interfaces
von: Elliott, Jenna, et al.
Veröffentlicht: (2025)

An altruistic resource-sharing mechanism for synchronization: The energy-speed-accuracy tradeoff
von: Zhang, Dongliang, et al.
Veröffentlicht: (2025)

On the thermodynamic analogy of intracellular diffusivity fluctuations
von: Itto, Yuichi
Veröffentlicht: (2025)

Macroscopic fluctuation-response theory and its use for gene regulatory networks
von: Aslyamov, Timur, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Membrane-Associated Self-Assembly for Cellular Decision Making
von: Foley, Samuel L., et al.
Veröffentlicht: (2025)

Acceleration of enzymatic reactions due to nearby inactive binding sites
von: Katznelson, Hila, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Fractional Brownian motion with mean-density interaction: a myopic self-avoiding fractional stochastic process
von: House, Jonathan, et al.
Veröffentlicht: (2025)

A Single--Index Theory of Optimal Branching: Murray Laws, Gilbert Networks, and Young--Herring Junctions
von: Bennett, Justin
Veröffentlicht: (2025)

Emergent memory in cell-like active systems
von: Besse, Marc, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Efficiently driving F$_1$ molecular motor in experiment by suppressing nonequilibrium variation
von: Mishima, Takahide, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Random motility regulation drives the fragmentation of microbial ecosystems
von: Dinelli, Alberto, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Analog of the Carnot engine for fluctuating diffusivity in living cells
von: Itto, Yuichi
Veröffentlicht: (2025)

Physical Constraints on the Rhythmicity of the Biological Clock
von: Lee, YeongKyu, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Experimental demonstration of kinetic proofreading inherited in ligation-based information replication
von: Aoyanagi, Hiroyuki, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Identifying nonequilibrium degrees of freedom in high-dimensional stochastic systems
von: Ji, Catherine, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Acceleration of enzymatic reaction-diffusion kinetics by intermediate state
von: Fukuda, Akihiro, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Hunting for Maxwell's Demon in the Wild
von: Buisson, Johan du, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Unified Linear Fluctuation-Response Theory Arbitrarily Far from Equilibrium
von: Zheng, Jiming, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Dissimilarity measures for generalized Lotka-Volterra systems on networks
von: Márquez, Nicolás A., et al.
Veröffentlicht: (2025)

Surface Optimisation Governs the Local Design of Physical Networks
von: Meng, Xiangyi, et al.
Veröffentlicht: (2025)

First passage time properties of diffusion with a broad class of stochastic diffusion coefficients
von: Uchida, Go, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Information thermodynamics of cellular ion pumps
von: Jiménez-Paz, Julian D., et al.
Veröffentlicht: (2025)

Will a Large Complex System be a Maxwell Demon?
von: Leighton, Matthew P
Veröffentlicht: (2026)

Network-based drug repurposing for MYH9-related nephritis
von: Ali, Muhammad, et al.
Veröffentlicht: (2026)

Nonequilibrium relaxation inequality on short timescales
von: Auconi, Andrea
Veröffentlicht: (2024)