Effect Size-Driven Pathway Meta-Analysis for Gene Expression Data
Fuente:
arXiv
Enregistré dans:
| Auteurs principaux: | Villatoro-García, Juan Antonio, Jurado-Bascón, Pablo Pedro, Carmona-Sáez, Pedro |
|---|---|
| Format: | Preprint |
| Publié: |
2025
|
| Sujets: | |
| Accès en ligne: | |
| Tags: |
Ajouter un tag
Pas de tags, Soyez le premier à ajouter un tag!
|
Documents similaires
Causal Discovery on Dependent Mixed Data with Applications to Gene Regulatory Network Inference
par: Chen, Alex, et autres
Publié: (2026)
par: Chen, Alex, et autres
Publié: (2026)
HR-VILAGE-3K3M: A Human Respiratory Viral Immunization Longitudinal Gene Expression Dataset for Systems Immunity
par: Sun, Xuejun, et autres
Publié: (2025)
par: Sun, Xuejun, et autres
Publié: (2025)
Tutorial on survival modeling with applications to omics data
par: Zhao, Zhi, et autres
Publié: (2023)
par: Zhao, Zhi, et autres
Publié: (2023)
MitoFREQ: A Novel Approach for Mitogenome Frequency Estimation from Top-level Haplogroups and Single Nucleotide Variants
par: Andersen, Mikkel Meyer, et autres
Publié: (2026)
par: Andersen, Mikkel Meyer, et autres
Publié: (2026)
Shotgun DNA sequencing for human identification: Dynamic SNP selection and likelihood ratio calculations accounting for errors
par: Andersen, Mikkel Meyer, et autres
Publié: (2024)
par: Andersen, Mikkel Meyer, et autres
Publié: (2024)
BioKlustering: a web app for semi-supervised learning of maximally imbalanced genomic data
par: Ozminkowski, Samuel, et autres
Publié: (2022)
par: Ozminkowski, Samuel, et autres
Publié: (2022)
Scalable Amortized GPLVMs for Single Cell Transcriptomics Data
par: Zhao, Sarah, et autres
Publié: (2024)
par: Zhao, Sarah, et autres
Publié: (2024)
Detecting and Correcting Sample-by-Sample Scale Distortion in RNA Sequencing Data
par: Thron, Christopher, et autres
Publié: (2026)
par: Thron, Christopher, et autres
Publié: (2026)
TransST: Transfer Learning Embedded Spatial Factor Modeling of Spatial Transcriptomics Data
par: Liu, Shuo Shuo, et autres
Publié: (2025)
par: Liu, Shuo Shuo, et autres
Publié: (2025)
CoMMiT: Co-informed inference of microbiome-metabolome interactions via transfer learning
par: Li, Leiyue, et autres
Publié: (2025)
par: Li, Leiyue, et autres
Publié: (2025)
Nullstrap-DE: A General Framework for Calibrating FDR and Preserving Power in DE Methods, with Applications to DESeq2 and edgeR
par: Jiang, Chenxin, et autres
Publié: (2025)
par: Jiang, Chenxin, et autres
Publié: (2025)
Controlling the joint local false discovery rate is more powerful than meta-analysis methods in joint analysis of summary statistics from multiple genome-wide association studies
par: Jiang, Wei, et autres
Publié: (2016)
par: Jiang, Wei, et autres
Publié: (2016)
Second-order group knockoffs with applications to GWAS
par: Chu, Benjamin B, et autres
Publié: (2023)
par: Chu, Benjamin B, et autres
Publié: (2023)
Estimating Reproducibility in Genome-Wide Association Studies
par: Jiang, Wei, et autres
Publié: (2015)
par: Jiang, Wei, et autres
Publié: (2015)
Robust Genomic Prediction and Heritability Estimation using Density Power Divergence
par: Chowdhury, Upama Paul, et autres
Publié: (2024)
par: Chowdhury, Upama Paul, et autres
Publié: (2024)
Controlled Variable Selection from Summary Statistics Only? A Solution via GhostKnockoffs and Penalized Regression
par: Chen, Zhaomeng, et autres
Publié: (2024)
par: Chen, Zhaomeng, et autres
Publié: (2024)
A Statistical Framework for Co-Mediators of Zero-Inflated Single-Cell RNA-Seq Data
par: Ahn, Seungjun, et autres
Publié: (2025)
par: Ahn, Seungjun, et autres
Publié: (2025)
The Multivariate SEM-PGS Model: Using Polygenic Scores to Investigate Cross-Trait Genetic Nurture and Assortative Mating
par: Lyu, Xuanyu, et autres
Publié: (2025)
par: Lyu, Xuanyu, et autres
Publié: (2025)
Incorporating LLM Embeddings for Variation Across the Human Genome
par: Niu, Hongqian, et autres
Publié: (2025)
par: Niu, Hongqian, et autres
Publié: (2025)
Uncovering smooth structures in single-cell data with PCS-guided neighbor embeddings
par: Ma, Rong, et autres
Publié: (2025)
par: Ma, Rong, et autres
Publié: (2025)
Longitudinal prediction of DNA methylation to forecast epigenetic outcomes
par: Leroy, Arthur, et autres
Publié: (2023)
par: Leroy, Arthur, et autres
Publié: (2023)
Predicting loss-of-function impact of genetic mutations: a machine learning approach
par: Kaur, Arshmeet, et autres
Publié: (2024)
par: Kaur, Arshmeet, et autres
Publié: (2024)
GRAMEP: an alignment-free method based on the Maximum Entropy Principle for identifying SNPs
par: Pimenta-Zanon, Matheus Henrique, et autres
Publié: (2024)
par: Pimenta-Zanon, Matheus Henrique, et autres
Publié: (2024)
VAE-MS: An Asymmetric Variational Autoencoder for Mutational Signature Extraction
par: Egendal, Ida, et autres
Publié: (2026)
par: Egendal, Ida, et autres
Publié: (2026)
Machine learning applied to omics data
par: Calviño, Aida, et autres
Publié: (2024)
par: Calviño, Aida, et autres
Publié: (2024)
Hypergraph Representations of scRNA-seq Data for Improved Clustering with Random Walks
par: He, Wan, et autres
Publié: (2025)
par: He, Wan, et autres
Publié: (2025)
Optimizing Prognostic Biomarker Discovery in Pancreatic Cancer Through Hybrid Ensemble Feature Selection and Multi-Omics Data
par: Zobolas, John, et autres
Publié: (2025)
par: Zobolas, John, et autres
Publié: (2025)
A Large-Scale Benchmark of Cross-Modal Learning for Histology and Gene Expression in Spatial Transcriptomics
par: Gindra, Rushin H., et autres
Publié: (2025)
par: Gindra, Rushin H., et autres
Publié: (2025)
Bayesian Cox model with graph-structured variable selection priors for multi-omics biomarker identification
par: Hermansen, Tobias Østmo, et autres
Publié: (2025)
par: Hermansen, Tobias Østmo, et autres
Publié: (2025)
Detecting gene-environment interactions to guide personalized intervention: boosting distributional regression for polygenic scores
par: Wu, Qiong, et autres
Publié: (2025)
par: Wu, Qiong, et autres
Publié: (2025)
Selecting ChIP-seq Normalization Methods from the Perspective of their Technical Conditions
par: Colando, Sara, et autres
Publié: (2025)
par: Colando, Sara, et autres
Publié: (2025)
Assumption-Lean Post-Integrated Inference with Surrogate Control Outcomes
par: Du, Jin-Hong, et autres
Publié: (2024)
par: Du, Jin-Hong, et autres
Publié: (2024)
Combining Bayesian and Frequentist Inference for Laboratory-Specific Performance Guarantees in Copy Number Variation Detection
par: Talbot, Austin, et autres
Publié: (2026)
par: Talbot, Austin, et autres
Publié: (2026)
High-dimensional Many-to-many-to-many Mediation Analysis
par: Nguyen, Tien Dat, et autres
Publié: (2026)
par: Nguyen, Tien Dat, et autres
Publié: (2026)
Multi-View Variational Autoencoder for Missing Value Imputation in Untargeted Metabolomics
par: Zhao, Chen, et autres
Publié: (2023)
par: Zhao, Chen, et autres
Publié: (2023)
Geometric coherence of single-cell CRISPR perturbations reveals regulatory architecture and predicts cellular stress
par: Raju, Prashant C.
Publié: (2026)
par: Raju, Prashant C.
Publié: (2026)
MIXALIME: MIXture models for ALlelic IMbalance Estimation in high-throughput sequencing data
par: Meshcheryakov, Georgy, et autres
Publié: (2023)
par: Meshcheryakov, Georgy, et autres
Publié: (2023)
Mixed Models with Multiple Instance Learning
par: Engelmann, Jan P., et autres
Publié: (2023)
par: Engelmann, Jan P., et autres
Publié: (2023)
Penalized Principal Component Analysis Using Smoothing
par: Hurwitz, Rebecca M., et autres
Publié: (2023)
par: Hurwitz, Rebecca M., et autres
Publié: (2023)
Hierarchical Classification for Predicting Metastasis Using Elastic-Net Regularization on Gene Expression Data
par: Agyare, Benjamin Osafo, et autres
Publié: (2024)
par: Agyare, Benjamin Osafo, et autres
Publié: (2024)
Documents similaires
-
Causal Discovery on Dependent Mixed Data with Applications to Gene Regulatory Network Inference
par: Chen, Alex, et autres
Publié: (2026) -
HR-VILAGE-3K3M: A Human Respiratory Viral Immunization Longitudinal Gene Expression Dataset for Systems Immunity
par: Sun, Xuejun, et autres
Publié: (2025) -
Tutorial on survival modeling with applications to omics data
par: Zhao, Zhi, et autres
Publié: (2023) -
MitoFREQ: A Novel Approach for Mitogenome Frequency Estimation from Top-level Haplogroups and Single Nucleotide Variants
par: Andersen, Mikkel Meyer, et autres
Publié: (2026) -
Shotgun DNA sequencing for human identification: Dynamic SNP selection and likelihood ratio calculations accounting for errors
par: Andersen, Mikkel Meyer, et autres
Publié: (2024)