Impact of the RNA Binding Domain Localization of the Protein Shell on Virus Particle Stability
Fuente:
arXiv
Salvato in:
| Autori principali: | Safdari, Mohammadamin, Li, Siyu, Panahandeh, Sanaz, van der Schoot, Paul, Zandi, Roya |
|---|---|
| Natura: | Preprint |
| Pubblicazione: |
2025
|
| Soggetti: | |
| Accesso online: | |
| Tags: |
Aggiungi Tag
Nessun Tag, puoi essere il primo ad aggiungerne!!
|
Documenti analoghi
Dynamics of elongation of nematic tactoids in an electric field
di: Safdari, Mohammadamin, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Safdari, Mohammadamin, et al.
Pubblicazione: (2024)
Effects of Rim Fluctuations in Classical Nucleation Theory of Virus Capsids
di: Clark, Alexander Bryan, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Clark, Alexander Bryan, et al.
Pubblicazione: (2026)
Switchable Conformation in Protein Subunits: Unveiling Assembly Dynamics of Icosahedral Viruses
di: Li, Siyu, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Li, Siyu, et al.
Pubblicazione: (2024)
Thermodynamic stability and kinetic control of capsid morphologies in hepatitis B virus
di: Yang, Kevin, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Yang, Kevin, et al.
Pubblicazione: (2026)
General Solution for Elastic Networks on Arbitrary Curved Surfaces in the Absence of Rotational Symmetry
di: Liu, Yankang, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Liu, Yankang, et al.
Pubblicazione: (2025)
Learning Parameterized Nonlinear Elasticity on Curved Surfaces
di: Liu, Yankang, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Liu, Yankang, et al.
Pubblicazione: (2026)
An Assembly-Line Mechanism for In-Vitro Encapsulation of Fragmented Cargo in Virus-Like Particles
di: Amjad, Ayesha, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Amjad, Ayesha, et al.
Pubblicazione: (2025)
Orientation-Dependent Protein Binding at Nanoparticle Interfaces
di: Annapoorani, Vigneshwari Karunakaran, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Annapoorani, Vigneshwari Karunakaran, et al.
Pubblicazione: (2026)
Unraveling the Allosteric Mechanism and Mechanical Stability of Partial and Complete Loss-of-Function Mutations in p53 DNA-Binding Domain
di: Zhou, Han, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Zhou, Han, et al.
Pubblicazione: (2026)
Leak Proof PDBBind: A Reorganized Dataset of Protein-Ligand Complexes for More Generalizable Binding Affinity Prediction
di: Li, Jie, et al.
Pubblicazione: (2023)
di: Li, Jie, et al.
Pubblicazione: (2023)
A Workflow to Create a High-Quality Protein-Ligand Binding Dataset for Training, Validation, and Prediction Tasks
di: Wang, Yingze, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Wang, Yingze, et al.
Pubblicazione: (2024)
Transcribing RNA polymerases: Dynamics of Twin Supercoiled Domains
di: Joyeux, Marc
Pubblicazione: (2024)
di: Joyeux, Marc
Pubblicazione: (2024)
Local Volume Concentration, Packing Domains and Scaling Properties of Chromatin
di: Carignano, Marcelo, et al.
Pubblicazione: (2023)
di: Carignano, Marcelo, et al.
Pubblicazione: (2023)
Iterative Annealing Mechanism for Protein and RNA Chaperones
di: Hyeon, Changbong, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Hyeon, Changbong, et al.
Pubblicazione: (2025)
Unraveling the Mechanism of Drug Binding to SARS-CoV-2 RNA Pseudoknot with Thermodynamics-Driven Machine Learning
di: Ivonina, Mariia, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Ivonina, Mariia, et al.
Pubblicazione: (2026)
Local Ridge Formation and Domain Delimitation in Aggregation-Diffusion Equations
di: Nishihara, Shin, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Nishihara, Shin, et al.
Pubblicazione: (2025)
Open-System Virus Particle Physics: A Path-Integral Viral Lattice Theory Using Non-Self Adjoint Stochastic PDEs and Fock-Space Formalism
di: Kleess, Lillian St.
Pubblicazione: (2025)
di: Kleess, Lillian St.
Pubblicazione: (2025)
Quantum-Accurate Conformational Stabilities and Vibrational Dynamics in Molecules and Proteins with Machine-Learned Force Fields
di: Suárez-Dou, Sergio, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Suárez-Dou, Sergio, et al.
Pubblicazione: (2026)
Protein overabundance is driven by growth robustness
di: Choi, H. James, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Choi, H. James, et al.
Pubblicazione: (2024)
Programmable Persistent Random Walks in Active Brownian Particles Govern Emergent Dynamics
di: Raghavendra, Tarun Sunkesula, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Raghavendra, Tarun Sunkesula, et al.
Pubblicazione: (2026)
Deep Learning-Driven Protein Structure Prediction and Design: Key Model Developments by Nobel Laureates and Multi-Domain Applications
di: Yang, Wanqing, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Yang, Wanqing, et al.
Pubblicazione: (2025)
Quantitative Prediction of Protein-Polyelectrolyte Binding Thermodynamics: Adsorption of Heparin-Analog Polysulfates to the SARS-CoV-2 Spike Protein RBD
di: Neander, Lenard, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Neander, Lenard, et al.
Pubblicazione: (2024)
Decoding Binding Pathways of Ligands in Prolyl Oligopeptidase
di: Walczewska-Szewc, Katarzyna, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Walczewska-Szewc, Katarzyna, et al.
Pubblicazione: (2025)
Evolution of protein$-$RNA interactions
di: Kolář, Michal H., et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Kolář, Michal H., et al.
Pubblicazione: (2025)
MERGE-RNA: a physics-based model to predict RNA secondary structure ensembles with chemical probing
di: Sacco, Giuseppe, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Sacco, Giuseppe, et al.
Pubblicazione: (2025)
Amino Acids and Their Biological Derivatives Modulate Protein-Protein Interactions In an Additive Way
di: Xu, Xufeng, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Xu, Xufeng, et al.
Pubblicazione: (2024)
Mechanical Softening of Vero Cells Induced by an Attenuated Measles Vaccine Virus
di: Lopez, Alexander Einschuetz, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Lopez, Alexander Einschuetz, et al.
Pubblicazione: (2026)
Illuminating Protein Dynamics: A Review of Computational Methods for Studying Photoactive Proteins
di: Czach, Sylwia, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Czach, Sylwia, et al.
Pubblicazione: (2025)
An Update on Theoretical and Metrological Aspects of the Surface Hydrophobicity of Virus and Virus‐Like Particles
di: Guillaume Sautrey
Pubblicazione: (2024)
di: Guillaume Sautrey
Pubblicazione: (2024)
Deciphering the chemical grammar of protein-RNA condensates
di: Grassmann, Greta, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Grassmann, Greta, et al.
Pubblicazione: (2026)
Binding memory of liquid molecules
di: Qin, Shiyi, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Qin, Shiyi, et al.
Pubblicazione: (2024)
Binding of $TMPyP^{3+}$ porphyrin to poly(A)-poly(U) polynucleotide: a spectroscopic study
di: Ryazanova, Olga A., et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Ryazanova, Olga A., et al.
Pubblicazione: (2024)
FRET-guided selection of RNA 3D structures
di: Weber, Mirko, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Weber, Mirko, et al.
Pubblicazione: (2025)
Link Node: A Method to Characterize the Chain Topology of Intrinsically Disordered Proteins
di: Lang, Danqi, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Lang, Danqi, et al.
Pubblicazione: (2024)
Interaction Dynamics of Borrelia Surface Proteins with Fibronectin
di: Hewage, Kavindi Madduma, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Hewage, Kavindi Madduma, et al.
Pubblicazione: (2025)
Binding of native DNA to MoS$_{2}$ nanoflakes: the role of defects and edge atoms of MoS$_{2}$ nanostructures in their biofunctionalization
di: Glamazda, Alexander, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Glamazda, Alexander, et al.
Pubblicazione: (2025)
Real-Time Analysis of Nanoscale Dynamics in Membrane Protein Insertion via Single-Molecule Imaging
di: Yang, C., et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Yang, C., et al.
Pubblicazione: (2024)
Particle-based simulation of non-elementary bimolecular kinetics
di: Kearney, Taylor, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Kearney, Taylor, et al.
Pubblicazione: (2025)
An exactly solvable model for RNA polymerase during the elongation stage
di: Ngoc, Ngo Phuoc Nguyen, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Ngoc, Ngo Phuoc Nguyen, et al.
Pubblicazione: (2024)
Emergence of homochirality via template-directed ligation in an RNA reactor
di: Laurent, Gabin, et al.
Pubblicazione: (2023)
di: Laurent, Gabin, et al.
Pubblicazione: (2023)
Documenti analoghi
-
Dynamics of elongation of nematic tactoids in an electric field
di: Safdari, Mohammadamin, et al.
Pubblicazione: (2024) -
Effects of Rim Fluctuations in Classical Nucleation Theory of Virus Capsids
di: Clark, Alexander Bryan, et al.
Pubblicazione: (2026) -
Switchable Conformation in Protein Subunits: Unveiling Assembly Dynamics of Icosahedral Viruses
di: Li, Siyu, et al.
Pubblicazione: (2024) -
Thermodynamic stability and kinetic control of capsid morphologies in hepatitis B virus
di: Yang, Kevin, et al.
Pubblicazione: (2026) -
General Solution for Elastic Networks on Arbitrary Curved Surfaces in the Absence of Rotational Symmetry
di: Liu, Yankang, et al.
Pubblicazione: (2025)