Buchumschlag

HODDI: A Dataset of High-Order Drug-Drug Interactions for Computational Pharmacovigilance

Fuente: arXiv

Gespeichert in:

Bibliographische Detailangaben
Hauptverfasser:	Wang, Zhaoying, Shi, Yingdan, Liu, Xiang, Chen, Can, Wen, Jun, Wang, Ren
Format:	Preprint
Veröffentlicht:	2025
Schlagworte:	Machine Learning Artificial Intelligence Molecular Networks
Online-Zugang:	Acceder al recurso
Tags:	Tag hinzufügen Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!

Ähnliche Einträge

Towards Interpretable Drug-Drug Interaction Prediction: A Graph-Based Approach with Molecular and Network-Level Explanations
von: Chen, Mengjie, et al.
Veröffentlicht: (2025)

CADGL: Context-Aware Deep Graph Learning for Predicting Drug-Drug Interactions
von: Wasi, Azmine Toushik, et al.
Veröffentlicht: (2024)

Regressor-free Molecule Generation to Support Drug Response Prediction
von: Li, Kun, et al.
Veröffentlicht: (2024)

Reading the Cell, Designing the Cure: Perturbation-Conditioned Molecular Diffusion for Function-Oriented Drug Design
von: Xu, Ziyu, et al.
Veröffentlicht: (2026)

GFlowNets for Learning Better Drug-Drug Interaction Representations
von: Wasi, Azmine Toushik
Veröffentlicht: (2025)

AdaptMol: Adaptive Fusion from Sequence String to Topological Structure for Few-shot Drug Discovery
von: Dai, Yifan, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Pin-Tuning: Parameter-Efficient In-Context Tuning for Few-Shot Molecular Property Prediction
von: Wang, Liang, et al.
Veröffentlicht: (2024)

PRING: Rethinking Protein-Protein Interaction Prediction from Pairs to Graphs
von: Zheng, Xinzhe, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Adaptive Data-Knowledge Alignment in Genetic Perturbation Prediction
von: Xiang, Yuanfang, et al.
Veröffentlicht: (2025)

ResMGCN: Residual Message Graph Convolution Network for Fast Biomedical Interactions Discovering
von: Yin, Zecheng
Veröffentlicht: (2023)

Boolean matrix logic programming for active learning of gene functions in genome-scale metabolic network models
von: Ai, Lun, et al.
Veröffentlicht: (2024)

Bidirectional Hierarchical Protein Multi-Modal Representation Learning
von: Liu, Xuefeng, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Complex Networks and the Drug Repositioning Problem
von: Haiek, Felipe Bivort
Veröffentlicht: (2026)

Learning to Align Molecules and Proteins: A Geometry-Aware Approach to Binding Affinity
von: Refahi, Mohammadsaleh, et al.
Veröffentlicht: (2025)

HiRes: Inspectable Precedent Memory for Reaction Condition Recommendation
von: Sathyanarayana, Shreyas Vinaya, et al.
Veröffentlicht: (2026)

RAG-GNN: Integrating Retrieved Knowledge with Graph Neural Networks for Precision Medicine
von: Hays, Hasi, et al.
Veröffentlicht: (2026)

Graph neural network explanations reveal a topological signature of disease-associated hubs in biological networks
von: Higgins, Kyle, et al.
Veröffentlicht: (2026)

Graph Neural Network-Based Reinforcement Learning for Controlling Biological Networks - the GATTACA Framework
von: Mizera, Andrzej, et al.
Veröffentlicht: (2025)

LLaMo: Large Language Model-based Molecular Graph Assistant
von: Park, Jinyoung, et al.
Veröffentlicht: (2024)

Active learning of digenic functions with boolean matrix logic programming
von: Ai, Lun, et al.
Veröffentlicht: (2024)

Pesti-Gen: Unleashing a Generative Molecule Approach for Toxicity Aware Pesticide Design
von: Kim, Taehan, et al.
Veröffentlicht: (2025)

A Multimodal Human Protein Embeddings Database: DeepDrug Protein Embeddings Bank (DPEB)
von: Sajol, Md Saiful Islam, et al.
Veröffentlicht: (2025)

drGT: Attention-Guided Gene Assessment of Drug Response Utilizing a Drug-Cell-Gene Heterogeneous Network
von: Inoue, Yoshitaka, et al.
Veröffentlicht: (2024)

Deep Reinforcement Learning for Controlled Traversing of the Attractor Landscape of Boolean Models in the Context of Cellular Reprogramming
von: Mizera, Andrzej, et al.
Veröffentlicht: (2024)

PACER: Acyclic Causal Discovery from Large-Scale Interventional Data
von: Torné, Ramon Viñas, et al.
Veröffentlicht: (2026)

Unveiling Molecular Moieties through Hierarchical Grad-CAM Graph Explainability
von: Contino, Salvatore, et al.
Veröffentlicht: (2024)

Investigating Knowledge Distillation Through Neural Networks for Protein Binding Affinity Prediction
von: Abbasi, Wajid Arshad, et al.
Veröffentlicht: (2026)

DiffSpectra: Molecular Structure Elucidation from Spectra using Diffusion Models
von: Wang, Liang, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Tackling Fake Forgetting through Uncertainty Quantification
von: Shi, Yingdan, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Merged ChemProt-DrugProt for Relation Extraction from Biomedical Literature
von: Nguyen, Mai H., et al.
Veröffentlicht: (2024)

GenAI-Net: A Generative AI Framework for Automated Biomolecular Network Design
von: Filo, Maurice, et al.
Veröffentlicht: (2026)

Inference of dynamical gene regulatory networks from single-cell data with physics informed neural networks
von: Mircea, Maria, et al.
Veröffentlicht: (2024)

PLANET v2.0: A comprehensive Protein-Ligand Affinity Prediction Model Based on Mixture Density Network
von: Gao, Haotian, et al.
Veröffentlicht: (2026)

The Signed Two-Space Proximity Model for Learning Representations in Protein-Protein Interaction Networks
von: Nakis, Nikolaos, et al.
Veröffentlicht: (2025)

ProLLM: Protein Chain-of-Thoughts Enhanced LLM for Protein-Protein Interaction Prediction
von: Jin, Mingyu, et al.
Veröffentlicht: (2024)

DeepRetro: Retrosynthetic Pathway Discovery using Iterative LLM Reasoning
von: Sathyanarayana, Shreyas Vinaya, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Graph Representation Learning Strategies for Omics Data: A Case Study on Parkinson's Disease
von: de Lope, Elisa Gómez, et al.
Veröffentlicht: (2024)

Benchmarking Constraint-Based Bayesian Structure Learning Algorithms: Role of Network Topology
von: Nagarajan, Radha, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Biological Regulatory Network Inference through Circular Causal Structure Learning
von: Jiang, Hongyang, et al.
Veröffentlicht: (2025)

ProtoMol: Enhancing Molecular Property Prediction via Prototype-Guided Multimodal Learning
von: Wang, Yingxu, et al.
Veröffentlicht: (2025)