DiffMS: Diffusion Generation of Molecules Conditioned on Mass Spectra
Fuente:
arXiv
Gespeichert in:
| Hauptverfasser: | Bohde, Montgomery, Manjrekar, Mrunali, Wang, Runzhong, Ji, Shuiwang, Coley, Connor W. |
|---|---|
| Format: | Preprint |
| Veröffentlicht: |
2025
|
| Schlagworte: | |
| Online-Zugang: | |
| Tags: |
Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
|
Ähnliche Einträge
FRIGID: Scaling Diffusion-Based Molecular Generation from Mass Spectra at Training and Inference Time
von: Bohde, Montgomery, et al.
Veröffentlicht: (2026)
von: Bohde, Montgomery, et al.
Veröffentlicht: (2026)
Neural Graph Matching Improves Retrieval Augmented Generation in Molecular Machine Learning
von: Wang, Runzhong, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Wang, Runzhong, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Generative structural elucidation from mass spectra as an iterative optimization problem
von: Manjrekar, Mrunali, et al.
Veröffentlicht: (2026)
von: Manjrekar, Mrunali, et al.
Veröffentlicht: (2026)
A Genetic Algorithm for Navigating Synthesizable Molecular Spaces
von: Lo, Alston, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Lo, Alston, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Anticipating the Selectivity of Intramolecular Cyclization Reaction Pathways with Neural Network Potentials
von: Casetti, Nicholas, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Casetti, Nicholas, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Diff4VS: HIV-inhibiting Molecules Generation with Classifier Guidance Diffusion for Virtual Screening
von: Lyu, Jiaqing, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Lyu, Jiaqing, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Double-Ended Synthesis Planning with Goal-Constrained Bidirectional Search
von: Yu, Kevin, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Yu, Kevin, et al.
Veröffentlicht: (2024)
DiffPack: A Torsional Diffusion Model for Autoregressive Protein Side-Chain Packing
von: Zhang, Yangtian, et al.
Veröffentlicht: (2023)
von: Zhang, Yangtian, et al.
Veröffentlicht: (2023)
CAGenMol: Condition-Aware Diffusion Language Model for Goal-Directed Molecular Generation
von: Li, Yanting, et al.
Veröffentlicht: (2026)
von: Li, Yanting, et al.
Veröffentlicht: (2026)
RetroDiff: Retrosynthesis as Multi-stage Distribution Interpolation
von: Wang, Yiming, et al.
Veröffentlicht: (2023)
von: Wang, Yiming, et al.
Veröffentlicht: (2023)
Generating Molecular Fragmentation Graphs with Autoregressive Neural Networks
von: Goldman, Samuel, et al.
Veröffentlicht: (2023)
von: Goldman, Samuel, et al.
Veröffentlicht: (2023)
Improving Molecule Generation and Drug Discovery with a Knowledge-enhanced Generative Model
von: Malusare, Aditya, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Malusare, Aditya, et al.
Veröffentlicht: (2024)
NExT-Mol: 3D Diffusion Meets 1D Language Modeling for 3D Molecule Generation
von: Liu, Zhiyuan, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Liu, Zhiyuan, et al.
Veröffentlicht: (2025)
AI-driven Generation of MALDI-TOF MS for Microbial Characterization
von: Schmidt-Santiago, Lucía, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Schmidt-Santiago, Lucía, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Iterative Distillation for Reward-Guided Fine-Tuning of Diffusion Models in Biomolecular Design
von: Su, Xingyu, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Su, Xingyu, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Can LLMs Generate Diverse Molecules? Towards Alignment with Structural Diversity
von: Jang, Hyosoon, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Jang, Hyosoon, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Reward-Guided Discrete Diffusion via Clean-Sample Markov Chain for Molecule and Biological Sequence Design
von: Phunyaphibarn, Prin, et al.
Veröffentlicht: (2026)
von: Phunyaphibarn, Prin, et al.
Veröffentlicht: (2026)
An algorithmic framework for synthetic cost-aware decision making in molecular design
von: Fromer, Jenna C., et al.
Veröffentlicht: (2023)
von: Fromer, Jenna C., et al.
Veröffentlicht: (2023)
Regressor-guided Diffusion Model for De Novo Peptide Sequencing with Explicit Mass Control
von: Chen, Shaorong, et al.
Veröffentlicht: (2026)
von: Chen, Shaorong, et al.
Veröffentlicht: (2026)
Aligning Target-Aware Molecule Diffusion Models with Exact Energy Optimization
von: Gu, Siyi, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Gu, Siyi, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Batched Bayesian optimization by maximizing the probability of including the optimum
von: Fromer, Jenna, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Fromer, Jenna, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Data Augmentation Scheme for Raman Spectra with Highly Correlated Annotations
von: Lange, Christoph, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Lange, Christoph, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Molecule-dynamic-based Aging Clock and Aging Roadmap Forecast with Sundial
von: Wu, Wei, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Wu, Wei, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Q-MRS: A Deep Learning Framework for Quantitative Magnetic Resonance Spectra Analysis
von: Wu, Christopher J., et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Wu, Christopher J., et al.
Veröffentlicht: (2024)
Bootstrapped Training of Score-Conditioned Generator for Offline Design of Biological Sequences
von: Kim, Minsu, et al.
Veröffentlicht: (2023)
von: Kim, Minsu, et al.
Veröffentlicht: (2023)
Evaluating Molecule Synthesizability via Retrosynthetic Planning and Reaction Prediction
von: Liu, Songtao, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Liu, Songtao, et al.
Veröffentlicht: (2024)
MolGuidance: Advanced Guidance Strategies for Conditional Molecular Generation with Flow Matching
von: Jin, Jirui, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Jin, Jirui, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Predicting Side Effect of Drug Molecules using Recurrent Neural Networks
von: Beaudoin, Collin, et al.
Veröffentlicht: (2023)
von: Beaudoin, Collin, et al.
Veröffentlicht: (2023)
How Molecules Impact Cells: Unlocking Contrastive PhenoMolecular Retrieval
von: Fradkin, Philip, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Fradkin, Philip, et al.
Veröffentlicht: (2024)
PhenDiff: Revealing Subtle Phenotypes with Diffusion Models in Real Images
von: Bourou, Anis, et al.
Veröffentlicht: (2023)
von: Bourou, Anis, et al.
Veröffentlicht: (2023)
Diffusion Models at the Drug Discovery Frontier: A Review on Generating Small Molecules versus Therapeutic Peptides
von: Wang, Yiquan, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Wang, Yiquan, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Denoising Diffusion Variational Inference: Diffusion Models as Expressive Variational Posteriors
von: Piriyakulkij, Wasu Top, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Piriyakulkij, Wasu Top, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Breaking the Bottlenecks: Scalable Diffusion Models for 3D Molecular Generation
von: Das, Adrita, et al.
Veröffentlicht: (2026)
von: Das, Adrita, et al.
Veröffentlicht: (2026)
Exploring the Utility of MALDI-TOF Mass Spectrometry and Antimicrobial Resistance in Hospital Outbreak Detection
von: Liu, Chang, et al.
Veröffentlicht: (2026)
von: Liu, Chang, et al.
Veröffentlicht: (2026)
ProteinZero: Self-Improving Protein Generation via Online Reinforcement Learning
von: Wang, Ziwen, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Wang, Ziwen, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Transfer Learning Bayesian Optimization to Design Competitor DNA Molecules for Use in Diagnostic Assays
von: Sedgwick, Ruby, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Sedgwick, Ruby, et al.
Veröffentlicht: (2024)
MassSpecGym: A benchmark for the discovery and identification of molecules
von: Bushuiev, Roman, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Bushuiev, Roman, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Accelerating the Generation of Molecular Conformations with Progressive Distillation of Equivariant Latent Diffusion Models
von: Lacombe, Romain, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Lacombe, Romain, et al.
Veröffentlicht: (2024)
MS2MetGAN: Latent-space adversarial training for metabolite-spectrum matching in MS/MS database search
von: Tsai, Meng, et al.
Veröffentlicht: (2026)
von: Tsai, Meng, et al.
Veröffentlicht: (2026)
Transcriptome-Conditioned Personalized De Novo Drug Generation for AML Using Metaheuristic Assembly and Target-Driven Filtering
von: Elafifi, Abdullah G., et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Elafifi, Abdullah G., et al.
Veröffentlicht: (2025)
Ähnliche Einträge
-
FRIGID: Scaling Diffusion-Based Molecular Generation from Mass Spectra at Training and Inference Time
von: Bohde, Montgomery, et al.
Veröffentlicht: (2026) -
Neural Graph Matching Improves Retrieval Augmented Generation in Molecular Machine Learning
von: Wang, Runzhong, et al.
Veröffentlicht: (2025) -
Generative structural elucidation from mass spectra as an iterative optimization problem
von: Manjrekar, Mrunali, et al.
Veröffentlicht: (2026) -
A Genetic Algorithm for Navigating Synthesizable Molecular Spaces
von: Lo, Alston, et al.
Veröffentlicht: (2025) -
Anticipating the Selectivity of Intramolecular Cyclization Reaction Pathways with Neural Network Potentials
von: Casetti, Nicholas, et al.
Veröffentlicht: (2025)