Sol-gel transition in heteroassociative RNA-protein solutions: A quantitative comparison of coarse-grained simulations and the Semenov-Rubinstein theory
Fuente:
arXiv
Salvato in:
| Autori principali: | Chen, Xinxiang, Vishnu, Jude Ann, Besenius, Pol, König, Julian, Schmid, Friederike |
|---|---|
| Natura: | Preprint |
| Pubblicazione: |
2025
|
| Soggetti: | |
| Accesso online: | |
| Tags: |
Aggiungi Tag
Nessun Tag, puoi essere il primo ad aggiungerne!!
|
Documenti analoghi
Dilute but Dense – Reversible Crosslinking Enables Water‐Rich (Bio)polymer Condensates
di: Xinxiang Chen, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Xinxiang Chen, et al.
Pubblicazione: (2026)
Structure and Dynamic Evolution of Interfaces between Polymer Solutions and Gels and Polymer Interdiffusion: A Molecular Dynamics Study
di: Vishnu, Jude Ann, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Vishnu, Jude Ann, et al.
Pubblicazione: (2024)
Flow dichroism of DNA can be quantitatively predicted via coarse-grained molecular simulations
di: Pincus, Isaac, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Pincus, Isaac, et al.
Pubblicazione: (2024)
Sol-gel transition by evaporation in porous media
di: Castell, Romane Le Dizès, et al.
Pubblicazione: (2023)
di: Castell, Romane Le Dizès, et al.
Pubblicazione: (2023)
Stochastic kinetic theory applied to coarse-grained polymer model
di: Zhu, Shangren, et al.
Pubblicazione: (2023)
di: Zhu, Shangren, et al.
Pubblicazione: (2023)
Strong stretching theory of polydisperse curved polymer brushes
di: Giannakou, Marios, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Giannakou, Marios, et al.
Pubblicazione: (2024)
Highly coarse-grained polarisable water models for mesoscopic simulations
di: Seaton, Michael A., et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Seaton, Michael A., et al.
Pubblicazione: (2026)
On the interfacial properties of hydroquinone: realistic and coarse-grained molecular models from computer simulation
di: Torrejón, M. J., et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Torrejón, M. J., et al.
Pubblicazione: (2025)
Martignac: Computational workflows for reproducible, traceable, and composable coarse-grained Martini simulations
di: Bereau, Tristan, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Bereau, Tristan, et al.
Pubblicazione: (2024)
A simple time coarse graining method for molecular dynamics simulations of liquids
di: Martin, Maxime, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Martin, Maxime, et al.
Pubblicazione: (2025)
Effective patchiness from critical points of a coarse-grained protein model with explicit shape and charge anisotropy
di: Weimar, Jens, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Weimar, Jens, et al.
Pubblicazione: (2024)
Dynamics of polymers in coarse-grained nematic solvents
di: Valei, Zahra, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Valei, Zahra, et al.
Pubblicazione: (2024)
Relaxation Dynamics of Entangled Linear Polymer Melts via Molecular Dynamics Simulations
di: Behbahani, Alireza F., et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Behbahani, Alireza F., et al.
Pubblicazione: (2024)
Mesoscopic modelling of bio-compatible PLGA polymers with coarse-grained molecular dynamics simulations
di: Bellussi, Francesco Maria, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Bellussi, Francesco Maria, et al.
Pubblicazione: (2024)
The oxDNA coarse-grained model as a tool to simulate DNA origami
di: Doye, Jonathan P. K., et al.
Pubblicazione: (2020)
di: Doye, Jonathan P. K., et al.
Pubblicazione: (2020)
Computer simulations of the bacterial ribosome using a general purpose coarse-grained model MARTINI
di: Cikhart, Josef, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Cikhart, Josef, et al.
Pubblicazione: (2025)
Passive particle in an active bath: How can we tell it is out of equilibrium?
di: Shea, Jeanine, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Shea, Jeanine, et al.
Pubblicazione: (2024)
Force renormalization for probes immersed in an active bath
di: Shea, Jeanine, et al.
Pubblicazione: (2023)
di: Shea, Jeanine, et al.
Pubblicazione: (2023)
From Heteropolymer Stiffness Distributions to Effective Homopolymers: A Conformational Analysis of Intrinsically Disordered Proteins
di: Witzky, Yannick, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Witzky, Yannick, et al.
Pubblicazione: (2025)
How boundary interactions dominate emergent driving of passive probes in active matter
di: Shea, Jeanine, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Shea, Jeanine, et al.
Pubblicazione: (2024)
The transition to collective motion in nonreciprocal active matter: coarse graining agent-based models into fluctuating hydrodynamics
di: Martin, David, et al.
Pubblicazione: (2023)
di: Martin, David, et al.
Pubblicazione: (2023)
Dissipative particle dynamics for coarse-grained models
di: Curk, Tine
Pubblicazione: (2024)
di: Curk, Tine
Pubblicazione: (2024)
Multiscale theory, modelling, and simulation of hemicellulose and lignin in solution
di: Kovalenko, A.
Pubblicazione: (2026)
di: Kovalenko, A.
Pubblicazione: (2026)
Distinguishing noisy crystal symmetries in coarse-grained computer simulations: New procedures for noise reduction and lattice reconstruction
di: Filimonova, Evgeniia, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Filimonova, Evgeniia, et al.
Pubblicazione: (2024)
Stability of branched tubular membrane structures
di: Jung, Maike, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Jung, Maike, et al.
Pubblicazione: (2024)
Contact-based molecular dynamics of structured and disordered proteins in a coarse-grained model: fixed contacts, switchable contacts and those described by pseudo-improper-dihedral angles
di: Mioduszewski, Łukasz, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Mioduszewski, Łukasz, et al.
Pubblicazione: (2024)
Self-averaging parameter estimation for coarse-grained particle models
di: Monago, Carlos, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Monago, Carlos, et al.
Pubblicazione: (2026)
A kinetic model to simulate charge flow through an electrochemical half cell
di: Veloza-Diaz, Diego, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Veloza-Diaz, Diego, et al.
Pubblicazione: (2025)
Forces from coarse-graining nonequilibrium degrees of freedom: exact results
di: Santra, Ion, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Santra, Ion, et al.
Pubblicazione: (2024)
Decoupling elasticity and electrical conductivity of carbon black gels filled with insulating non-Brownian grains
di: Larsen, Thomas, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Larsen, Thomas, et al.
Pubblicazione: (2024)
Accurate coarse-graining of small organic molecules in melts and thin films using density-dependent potentials
di: Dutta, Sayan, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Dutta, Sayan, et al.
Pubblicazione: (2025)
Dynamics of Droplets Moving on Lubricated Polymer Brushes
di: Badr, Rodrique G. M., et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Badr, Rodrique G. M., et al.
Pubblicazione: (2024)
Cloaking Transition of Droplets on Lubricated Brushes
di: Badr, Rodrique G. M., et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Badr, Rodrique G. M., et al.
Pubblicazione: (2024)
Active Transport as a Mechanism of Microphase Selection in Biomolecular Condensates
di: Qiao, Le, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Qiao, Le, et al.
Pubblicazione: (2026)
Developing an unfolding-incorporated coarse-grained polymer model for fibrinogen to study the mechanical behaviour
di: Sharma, Vivek, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Sharma, Vivek, et al.
Pubblicazione: (2025)
Modelling of thermosensitive stereoregular polymers within MARTINI coarse-grained force-field: poly(N-isopropylacrylamide) as a benchmark case
di: Muratov, Alexander D., et al.
Pubblicazione: (2021)
di: Muratov, Alexander D., et al.
Pubblicazione: (2021)
Stability and Elasticity of Ultrathin Sphere-Patterned Block Copolymer Films
di: Qiao, Le, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Qiao, Le, et al.
Pubblicazione: (2024)
A general model for frictional contacts in colloidal systems
di: Hofmann, Kay, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Hofmann, Kay, et al.
Pubblicazione: (2025)
Diffusive dynamics of a model protein chain in solution
di: Colberg, Margarita, et al.
Pubblicazione: (2023)
di: Colberg, Margarita, et al.
Pubblicazione: (2023)
ANNaMo: Coarse-grained modelling for folding and assembly of RNA and DNA systems
di: Guerra, F. Tosti, et al.
Pubblicazione: (2023)
di: Guerra, F. Tosti, et al.
Pubblicazione: (2023)
Documenti analoghi
-
Dilute but Dense – Reversible Crosslinking Enables Water‐Rich (Bio)polymer Condensates
di: Xinxiang Chen, et al.
Pubblicazione: (2026) -
Structure and Dynamic Evolution of Interfaces between Polymer Solutions and Gels and Polymer Interdiffusion: A Molecular Dynamics Study
di: Vishnu, Jude Ann, et al.
Pubblicazione: (2024) -
Flow dichroism of DNA can be quantitatively predicted via coarse-grained molecular simulations
di: Pincus, Isaac, et al.
Pubblicazione: (2024) -
Sol-gel transition by evaporation in porous media
di: Castell, Romane Le Dizès, et al.
Pubblicazione: (2023) -
Stochastic kinetic theory applied to coarse-grained polymer model
di: Zhu, Shangren, et al.
Pubblicazione: (2023)