Towards a robust approach to infer causality in molecular systems satisfying detailed balance
Fuente:
arXiv
Gespeichert in:
| Hauptverfasser: | Del Tatto, Vittorio, Banerjee, Debarshi, Hassanali, Ali, Laio, Alessandro |
|---|---|
| Format: | Preprint |
| Veröffentlicht: |
2025
|
| Schlagworte: | |
| Online-Zugang: | |
| Tags: |
Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
|
Ähnliche Einträge
Causality in Liquid Water as a Hallmark of Emergent Glassy Dynamics
von: Huet, Leon, et al.
Veröffentlicht: (2026)
von: Huet, Leon, et al.
Veröffentlicht: (2026)
Good rates from bad coordinates: the exponential average time-dependent rate approach
von: Mazzaferro, Nicodemo, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Mazzaferro, Nicodemo, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Arbitrage equilibria in active matter systems
von: Venkatasubramanian, Venkat, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Venkatasubramanian, Venkat, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Pattern stability in reaction-diffusion systems depends on path entropy
von: Heller, Eric R., et al.
Veröffentlicht: (2026)
von: Heller, Eric R., et al.
Veröffentlicht: (2026)
Continuous Gated First-Passage Processes
von: Scher, Yuval, et al.
Veröffentlicht: (2022)
von: Scher, Yuval, et al.
Veröffentlicht: (2022)
General Theory of Static Response for Markov Jump Processes
von: Aslyamov, Timur, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Aslyamov, Timur, et al.
Veröffentlicht: (2024)
The Interplay of Heterogeneity and Product Detachment in Templated Polymer Copying
von: Guntoro, Jeremy E. B., et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Guntoro, Jeremy E. B., et al.
Veröffentlicht: (2024)
Nonadiabatic force matching for alchemical free-energy estimation
von: Rosa-Raíces, Jorge L., et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Rosa-Raíces, Jorge L., et al.
Veröffentlicht: (2025)
Static vs dynamic rough energy landscapes: Where is diffusion faster?
von: Makarov, Dmitrii E., et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Makarov, Dmitrii E., et al.
Veröffentlicht: (2025)
Fastest first-passage time for multiple searchers with finite speed
von: Grebenkov, Denis S., et al.
Veröffentlicht: (2026)
von: Grebenkov, Denis S., et al.
Veröffentlicht: (2026)
Diffusion-controlled reactions: an overview
von: Grebenkov, Denis S.
Veröffentlicht: (2023)
von: Grebenkov, Denis S.
Veröffentlicht: (2023)
Entropy Production by Underdamped Langevin Dynamics
von: Lyu, Jinghao, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Lyu, Jinghao, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Non-Markovianity increases transition path probability
von: Brünig, Florian N., et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Brünig, Florian N., et al.
Veröffentlicht: (2025)
Inference of non-exponential kinetics through stochastic resetting
von: Blumer, Ofir, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Blumer, Ofir, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Thermodynamic and Stoichiometric Laws Ruling the Fates of Growing Systems
von: Kamimura, Atsushi, et al.
Veröffentlicht: (2023)
von: Kamimura, Atsushi, et al.
Veröffentlicht: (2023)
Fastest first-passage time statistics for time-dependent particle injection
von: Grebenkov, Denis S., et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Grebenkov, Denis S., et al.
Veröffentlicht: (2025)
Optimal information gain at the onset of habituation to repeated stimuli
von: Nicoletti, Giorgio, et al.
Veröffentlicht: (2023)
von: Nicoletti, Giorgio, et al.
Veröffentlicht: (2023)
Hierarchical Reconstruction of Time-arrow from Multi-time Correlations
von: Cheng, Yijia, et al.
Veröffentlicht: (2026)
von: Cheng, Yijia, et al.
Veröffentlicht: (2026)
Model-free inference of memory in conformational dynamics of a multi-domain protein
von: Vollmar, Leonie, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Vollmar, Leonie, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Thermodynamic inference in molecular motors: a Martingale approach
von: Nadal-Rosa, Adrián, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Nadal-Rosa, Adrián, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Gradient estimators for parameter inference in discrete stochastic kinetic models
von: Burger, Ludwig, et al.
Veröffentlicht: (2026)
von: Burger, Ludwig, et al.
Veröffentlicht: (2026)
Local detailed balance for active particle models
von: Khodabandehlou, Faezeh, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Khodabandehlou, Faezeh, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Phase transitions in chromatin: mesoscopic and mean-field approaches
von: Tiani, Reda, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Tiani, Reda, et al.
Veröffentlicht: (2024)
The need for statistical physics in Africa: perspective and an illustration in drug delivery problems
von: Sahini, Mtabazi G., et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Sahini, Mtabazi G., et al.
Veröffentlicht: (2025)
Birth, Death, and Replication at Surfaces: Universal Laws of Autocatalytic Dynamics
von: Grebenkov, Denis S.
Veröffentlicht: (2026)
von: Grebenkov, Denis S.
Veröffentlicht: (2026)
Key Issues Review: Useful autonomous quantum machines
von: Guzmán, José Antonio Marín, et al.
Veröffentlicht: (2023)
von: Guzmán, José Antonio Marín, et al.
Veröffentlicht: (2023)
Introduction to modelling radical pair quantum spin dynamics with tensor networks
von: Hino, Kentaro, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Hino, Kentaro, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Arrhenius law for interacting diffusive systems
von: Kumar, Vishwajeet, et al.
Veröffentlicht: (2023)
von: Kumar, Vishwajeet, et al.
Veröffentlicht: (2023)
On the emergence of memory in equilibrium versus non-equilibrium systems
von: Zhao, Xizhu, et al.
Veröffentlicht: (2023)
von: Zhao, Xizhu, et al.
Veröffentlicht: (2023)
Catalytic Coagulation
von: Krapivsky, P. L., et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Krapivsky, P. L., et al.
Veröffentlicht: (2024)
Stochastic Thermodynamics of Cooperative Biomolecular Machines: Fluctuation Relations and Hidden Detailed Balance Breaking
von: Piephoff, D. Evan, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Piephoff, D. Evan, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Latent Thermodynamic Flows: Unified Representation Learning and Generative Modeling of Temperature-Dependent Behaviors from Limited Data
von: Qiu, Yunrui, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Qiu, Yunrui, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Hamiltonian replica exchange augmented with diffusion-based generative models and importance sampling to assess biomolecular conformational basins and barriers
von: Benayad, Zakarya, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Benayad, Zakarya, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Julian Hirniak, an early proponent of periodic chemical reaction
von: Manz, Niklas, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Manz, Niklas, et al.
Veröffentlicht: (2024)
A probabilistic approach to system-environment coupling
von: Rahbar, Mohammad, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Rahbar, Mohammad, et al.
Veröffentlicht: (2025)
An Efficient Integrator Scheme for Sampling the (Quantum) Isobaric-Isothermal Ensemble in (Path Integral) Molecular Dynamics Simulations
von: Liang, Weihao, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Liang, Weihao, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Nonadiabatic Field: A Conceptually Novel Approach for Nonadiabatic Quantum Molecular Dynamics
von: Wu, Baihua, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Wu, Baihua, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Path sampling challenges in large biomolecular systems: RETIS and REPPTIS for ABL-imatinib kinetics
von: Vervust, Wouter, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Vervust, Wouter, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Bayesian umbrella quadrature accelerates free-energy calculations across diverse molecular systems and processes
von: Kempkes, Eline K., et al.
Veröffentlicht: (2026)
von: Kempkes, Eline K., et al.
Veröffentlicht: (2026)
Thermodynamic Bounds on Symmetry Breaking in Linear and Catalytic Biochemical Systems
von: Liang, Shiling, et al.
Veröffentlicht: (2022)
von: Liang, Shiling, et al.
Veröffentlicht: (2022)
Ähnliche Einträge
-
Causality in Liquid Water as a Hallmark of Emergent Glassy Dynamics
von: Huet, Leon, et al.
Veröffentlicht: (2026) -
Good rates from bad coordinates: the exponential average time-dependent rate approach
von: Mazzaferro, Nicodemo, et al.
Veröffentlicht: (2024) -
Arbitrage equilibria in active matter systems
von: Venkatasubramanian, Venkat, et al.
Veröffentlicht: (2024) -
Pattern stability in reaction-diffusion systems depends on path entropy
von: Heller, Eric R., et al.
Veröffentlicht: (2026) -
Continuous Gated First-Passage Processes
von: Scher, Yuval, et al.
Veröffentlicht: (2022)