Leveraging Retrieval-Augmented Generation and Large Language Models to Predict SERCA-Binding Protein Fragments from Cardiac Proteomics Data
Fuente:
arXiv
Salvato in:
| Autori principali: | Phillips, Taylor A, Huskey, Alejandro W., Huskey, Patrick T., Robia, Seth L., Kekenes-Huskey, Peter M. |
|---|---|
| Natura: | Preprint |
| Pubblicazione: |
2025
|
| Soggetti: | |
| Accesso online: | |
| Tags: |
Aggiungi Tag
Nessun Tag, puoi essere il primo ad aggiungerne!!
|
Documenti analoghi
Title VI Summary 2000-2001.
di: Huskey, Barton
Pubblicazione: (2001)
di: Huskey, Barton
Pubblicazione: (2001)
Title VI Summary, 2000-2001. Publication Number 00.22
di: Huskey, Barton
Pubblicazione: (2001)
di: Huskey, Barton
Pubblicazione: (2001)
Title VI Summary. 2001-2002. Publication Number 01.03
di: Huskey, Barton
Pubblicazione: (2002)
di: Huskey, Barton
Pubblicazione: (2002)
sjhuskey/enenlhet-cli-tools: First Release
di: Samuel J. Huskey
Pubblicazione: (2026)
di: Samuel J. Huskey
Pubblicazione: (2026)
sjhuskey/coptic_metadata_viewer: Second release under seed funding
di: Samuel J. Huskey
Pubblicazione: (2025)
di: Samuel J. Huskey
Pubblicazione: (2025)
CAP: Commutative Algebra Prediction of Protein-Nucleic Acid Binding Affinities
di: Zia, Mushal, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Zia, Mushal, et al.
Pubblicazione: (2025)
Leveraging Protein Language Model Embeddings for Catalytic Turnover Prediction of Adenylate Kinase Orthologs in a Low-Data Regime
di: Muir, Duncan F., et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Muir, Duncan F., et al.
Pubblicazione: (2025)
ProtT-Affinity: Sequence-Based Protein-Protein Binding Affinity Prediction Using ProtT5 Embeddings
di: Lou, Hongfu
Pubblicazione: (2025)
di: Lou, Hongfu
Pubblicazione: (2025)
Twin Peaks: Dual-Head Architecture for Structure-Free Prediction of Protein-Protein Binding Affinity and Mutation Effects
di: Dey, Supantha, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Dey, Supantha, et al.
Pubblicazione: (2025)
Seq2Bind Webserver for Decoding Binding Hotspots directly from Sequences using Fine-Tuned Protein Language Models
di: Ma, Xiang, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Ma, Xiang, et al.
Pubblicazione: (2025)
sjhuskey/enenlhet: Second release under seed funding
di: Samuel J. Huskey, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Samuel J. Huskey, et al.
Pubblicazione: (2025)
Title V Summary Report, 2002-2003. Publication Number 02.03
di: Huskey, Barton, et al.
Pubblicazione: (2003)
di: Huskey, Barton, et al.
Pubblicazione: (2003)
Retrieval-Enhanced Mutation Mastery: Augmenting Zero-Shot Prediction of Protein Language Model
di: Tan, Yang, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Tan, Yang, et al.
Pubblicazione: (2024)
Leveraging Machine Learning Models for Peptide-Protein Interaction Prediction
di: Yin, Song, et al.
Pubblicazione: (2023)
di: Yin, Song, et al.
Pubblicazione: (2023)
Scaling and Data Saturation in Protein Language Models
di: Spinner, Aviv, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Spinner, Aviv, et al.
Pubblicazione: (2025)
Enhancing Protein-Ligand Binding Affinity Predictions using Neural Network Potentials
di: Zariquiey, Francesc Sabanes, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Zariquiey, Francesc Sabanes, et al.
Pubblicazione: (2024)
Beyond the Clinic: A Large-Scale Evaluation of Augmenting EHR with Wearable Data for Diverse Health Prediction
di: Wang, Will Ke, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Wang, Will Ke, et al.
Pubblicazione: (2025)
Topological Machine Learning for Protein-Nucleic Acid Binding Affinity Changes Upon Mutation
di: Liu, Xiang, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Liu, Xiang, et al.
Pubblicazione: (2025)
RadDiff: Retrieval-Augmented Denoising Diffusion for Protein Inverse Folding
di: Han, Jin, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Han, Jin, et al.
Pubblicazione: (2025)
DualBind: A Dual-Loss Framework for Protein-Ligand Binding Affinity Prediction
di: Liu, Meng, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Liu, Meng, et al.
Pubblicazione: (2024)
BAPULM: Binding Affinity Prediction using Language Models
di: Meda, Radheesh Sharma, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Meda, Radheesh Sharma, et al.
Pubblicazione: (2024)
Generating Molecular Fragmentation Graphs with Autoregressive Neural Networks
di: Goldman, Samuel, et al.
Pubblicazione: (2023)
di: Goldman, Samuel, et al.
Pubblicazione: (2023)
AutoProteinEngine: A Large Language Model Driven Agent Framework for Multimodal AutoML in Protein Engineering
di: Liu, Yungeng, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Liu, Yungeng, et al.
Pubblicazione: (2024)
MolBind: Multimodal Alignment of Language, Molecules, and Proteins
di: Xiao, Teng, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Xiao, Teng, et al.
Pubblicazione: (2024)
AgentPLM: Agentic Protein Language Models with Reasoning-Augmented Decoding for Protein Sequence Design
di: Rahman, Sahil, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Rahman, Sahil, et al.
Pubblicazione: (2026)
Driving Accurate Allergen Prediction with Protein Language Models and Generalization-Focused Evaluation
di: Wong, Brian Shing-Hei, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Wong, Brian Shing-Hei, et al.
Pubblicazione: (2025)
Hierarchical Contrastive Learning for Multi-Domain Protein-Ligand Binding
di: Zhang, Shuo, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Zhang, Shuo, et al.
Pubblicazione: (2026)
AbAffinity: A Large Language Model for Predicting Antibody Binding Affinity against SARS-CoV-2
di: Ashraf, Faisal Bin, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Ashraf, Faisal Bin, et al.
Pubblicazione: (2026)
PLA-SGCN: Protein-Ligand Binding Affinity Prediction by Integrating Similar Pairs and Semi-supervised Graph Convolutional Network
di: Abbasi, Karim, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Abbasi, Karim, et al.
Pubblicazione: (2024)
VibeProteinBench: An Evaluation Benchmark for Language-interfaced Vibe Protein Design
di: Seo, Hyunjin, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Seo, Hyunjin, et al.
Pubblicazione: (2026)
Knowledge from Large-Scale Protein Contact Prediction Models Can Be Transferred to the Data-Scarce RNA Contact Prediction Task
di: Jian, Yiren, et al.
Pubblicazione: (2023)
di: Jian, Yiren, et al.
Pubblicazione: (2023)
Detection of circular permutations by Protein Language Models
di: Hu, Yue, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Hu, Yue, et al.
Pubblicazione: (2024)
Enhancing Protein Predictive Models via Proteins Data Augmentation: A Benchmark and New Directions
di: Sun, Rui, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Sun, Rui, et al.
Pubblicazione: (2024)
TourSynbio-Search: A Large Language Model Driven Agent Framework for Unified Search Method for Protein Engineering
di: Liu, Yungeng, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Liu, Yungeng, et al.
Pubblicazione: (2024)
Automated Protein Motif Localization using Concept Activation Vectors in Protein Language Model Embedding Space
di: Shamail, Ahmad, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Shamail, Ahmad, et al.
Pubblicazione: (2025)
Automating Exploratory Proteomics Research via Language Models
di: Ding, Ning, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Ding, Ning, et al.
Pubblicazione: (2024)
ProtSolM: Protein Solubility Prediction with Multi-modal Features
di: Tan, Yang, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Tan, Yang, et al.
Pubblicazione: (2024)
Binding Free Energies without Alchemy
di: Brocidiacono, Michael, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Brocidiacono, Michael, et al.
Pubblicazione: (2026)
Enhancing Alzheimer's Disease Prediction: A Novel Approach to Leveraging GAN-Augmented Data for Improved CNN Model Accuracy
di: Sunkara, Akshay, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Sunkara, Akshay, et al.
Pubblicazione: (2024)
ProT-GFDM: A Generative Fractional Diffusion Model for Protein Generation
di: Liang, Xiao, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Liang, Xiao, et al.
Pubblicazione: (2025)
Documenti analoghi
-
Title VI Summary 2000-2001.
di: Huskey, Barton
Pubblicazione: (2001) -
Title VI Summary, 2000-2001. Publication Number 00.22
di: Huskey, Barton
Pubblicazione: (2001) -
Title VI Summary. 2001-2002. Publication Number 01.03
di: Huskey, Barton
Pubblicazione: (2002) -
sjhuskey/enenlhet-cli-tools: First Release
di: Samuel J. Huskey
Pubblicazione: (2026) -
sjhuskey/coptic_metadata_viewer: Second release under seed funding
di: Samuel J. Huskey
Pubblicazione: (2025)