Molecule Generation for Target Protein Binding with Hierarchical Consistency Diffusion Model
Fuente:
arXiv
Gespeichert in:
| Hauptverfasser: | Li, Guanlue, Jiang, Chenran, Gao, Ziqi, Liu, Yu, Liu, Chenyang, Chen, Jiean, Huang, Yong, Li, Jia |
|---|---|
| Format: | Preprint |
| Veröffentlicht: |
2025
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