Genomic data processing with GenomeFlow
Fuente:
arXiv
Salvato in:
| Autori principali: | Park, Junseok, Maury, Eduardo A., Oh, Changhoon, Shin, Donghoon, Denisko, Danielle, Lee, Eunjung Alice |
|---|---|
| Natura: | Preprint |
| Pubblicazione: |
2025
|
| Soggetti: | |
| Accesso online: | |
| Tags: |
Aggiungi Tag
Nessun Tag, puoi essere il primo ad aggiungerne!!
|
Documenti analoghi
Adaptive Parallel Downloader for Large Genomic Datasets
di: Swargo, Rasman Mubtasim, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Swargo, Rasman Mubtasim, et al.
Pubblicazione: (2025)
Optimizing the Variant Calling Pipeline Execution on Human Genomes Using GPU-Enabled Machines
di: Kumar, Ajay, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Kumar, Ajay, et al.
Pubblicazione: (2025)
Looking for (Genomic) Needles in a Haystack: Sparsity-Driven Search for Identifying Correlated Genetic Mutations in Cancer
di: Prabhu, Ritvik, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Prabhu, Ritvik, et al.
Pubblicazione: (2026)
Characterizing Compute-Communication Overlap in GPU-Accelerated Distributed Deep Learning: Performance and Power Implications
di: Lee, Seonho, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Lee, Seonho, et al.
Pubblicazione: (2025)
FlexiWalker: Extensible GPU Framework for Efficient Dynamic Random Walks with Runtime Adaptation
di: Park, Seongyeon, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Park, Seongyeon, et al.
Pubblicazione: (2025)
NAVIS: Concurrent Search and Update with Low Position-Seeking Overhead in On-SSD Graph-Based Vector Search
di: Song, Jaeyong, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Song, Jaeyong, et al.
Pubblicazione: (2026)
Breaking the Capacity Bottleneck in Model-Heterogeneous Federated Learning via Gradual Model Restoration
di: Ma, Chengjie, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Ma, Chengjie, et al.
Pubblicazione: (2025)
Bringing computation to the data: A MOEA-driven approach for optimising data processing in the context of the SKA and SRCNet
di: Parra-Royón, Manuel, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Parra-Royón, Manuel, et al.
Pubblicazione: (2026)
NestedFP: High-Performance, Memory-Efficient Dual-Precision Floating Point Support for LLMs
di: Lee, Haeun, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Lee, Haeun, et al.
Pubblicazione: (2025)
Eliminating Hidden Serialization in Multi-Node Megakernel Communication
di: Oh, Byungsoo, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Oh, Byungsoo, et al.
Pubblicazione: (2026)
WANify: Gauging and Balancing Runtime WAN Bandwidth for Geo-distributed Data Analytics
di: Mohapatra, Anshuman Das, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Mohapatra, Anshuman Das, et al.
Pubblicazione: (2025)
Action Deviation-Aware Inference for Low-Latency Wireless Robots
di: Park, Jeyoung, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Park, Jeyoung, et al.
Pubblicazione: (2025)
MPI-over-CXL: Enhancing Communication Efficiency in Distributed HPC Systems
di: Kwon, Miryeong, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Kwon, Miryeong, et al.
Pubblicazione: (2025)
Towards Exascale Computation for Turbomachinery Flows
di: Fu, Yuhang, et al.
Pubblicazione: (2023)
di: Fu, Yuhang, et al.
Pubblicazione: (2023)
bittide: Control Time, Not Flows
di: Bastiaan, Martijn, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Bastiaan, Martijn, et al.
Pubblicazione: (2025)
Quantifying Autoscaler Vulnerabilities: An Empirical Study of Resource Misallocation Induced by Cloud Infrastructure Faults
di: Park, Gijun
Pubblicazione: (2026)
di: Park, Gijun
Pubblicazione: (2026)
RUBICON: A Framework for Designing Efficient Deep Learning-Based Genomic Basecallers
di: Singh, Gagandeep, et al.
Pubblicazione: (2022)
di: Singh, Gagandeep, et al.
Pubblicazione: (2022)
Litmus: Fair Pricing for Serverless Computing
di: Pei, Qi, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Pei, Qi, et al.
Pubblicazione: (2024)
AGAThA: Fast and Efficient GPU Acceleration of Guided Sequence Alignment for Long Read Mapping
di: Park, Seongyeon, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Park, Seongyeon, et al.
Pubblicazione: (2024)
CaGR-RAG: Context-aware Query Grouping for Disk-based Vector Search in RAG Systems
di: Jeong, Yeonwoo, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Jeong, Yeonwoo, et al.
Pubblicazione: (2025)
Performance Modeling and Evaluation of Hyperledger Fabric: An Analysis Based on Transaction Flow and Endorsement Policies
di: Melo, Carlos, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Melo, Carlos, et al.
Pubblicazione: (2025)
PIM-SHERPA: Software Method for On-device LLM Inference by Resolving PIM Memory Attribute and Layout Inconsistencies
di: Lee, Sunjung, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Lee, Sunjung, et al.
Pubblicazione: (2026)
SAGe: A Lightweight Algorithm-Architecture Co-Design for Mitigating the Data Preparation Bottleneck in Large-Scale Genome Sequence Analysis
di: Ghiasi, Nika Mansouri, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Ghiasi, Nika Mansouri, et al.
Pubblicazione: (2025)
Parallel Gaussian process with kernel approximation in CUDA
di: Carminati, Davide
Pubblicazione: (2024)
di: Carminati, Davide
Pubblicazione: (2024)
Majorum: Ebb-and-Flow Consensus with Dynamic Quorums
di: D'Amato, Francesco, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: D'Amato, Francesco, et al.
Pubblicazione: (2026)
Accelerating LLM Inference with Precomputed Query Storage
di: Park, Jay H., et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Park, Jay H., et al.
Pubblicazione: (2025)
Application of cloud computing platform in industrial big data processing
di: Yao, Ziyan
Pubblicazione: (2024)
di: Yao, Ziyan
Pubblicazione: (2024)
Efficient Long Context Fine-tuning with Chunk Flow
di: Yuan, Xiulong, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Yuan, Xiulong, et al.
Pubblicazione: (2025)
GriNNder: Breaking the Memory Capacity Wall in Full-Graph GNN Training with Storage Offloading
di: Song, Jaeyong, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Song, Jaeyong, et al.
Pubblicazione: (2026)
A Hierarchical Sharded Blockchain Balancing Performance and Availability
di: Jo, Yongrae, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Jo, Yongrae, et al.
Pubblicazione: (2025)
FlowMoE: A Scalable Pipeline Scheduling Framework for Distributed Mixture-of-Experts Training
di: Gao, Yunqi, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Gao, Yunqi, et al.
Pubblicazione: (2025)
FlowMesh: A Service Fabric for Composable LLM Workflows
di: Shen, Junyi, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Shen, Junyi, et al.
Pubblicazione: (2025)
PathWeaver: A High-Throughput Multi-GPU System for Graph-Based Approximate Nearest Neighbor Search
di: Kim, Sukjin, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Kim, Sukjin, et al.
Pubblicazione: (2025)
Flow-Bench: A Dataset for Computational Workflow Anomaly Detection
di: Papadimitriou, George, et al.
Pubblicazione: (2023)
di: Papadimitriou, George, et al.
Pubblicazione: (2023)
Scalable quality control on processing of large diffusion-weighted and structural magnetic resonance imaging datasets
di: Kim, Michael E., et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Kim, Michael E., et al.
Pubblicazione: (2024)
NMP-PaK: Near-Memory Processing Acceleration of Scalable De Novo Genome Assembly
di: Kim, Heewoo, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Kim, Heewoo, et al.
Pubblicazione: (2025)
NanoFlow: Towards Optimal Large Language Model Serving Throughput
di: Zhu, Kan, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Zhu, Kan, et al.
Pubblicazione: (2024)
Profiling and Modeling of Power Characteristics of Leadership-Scale HPC System Workloads
di: Karimi, Ahmad Maroof, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Karimi, Ahmad Maroof, et al.
Pubblicazione: (2024)
AgentFlow: Resilient Adaptive Cloud-Edge Framework for Multi-Agent Coordination
di: Chen, Ching Han, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Chen, Ching Han, et al.
Pubblicazione: (2025)
Hypersparse Traffic Matrices from Suricata Network Flows using GraphBLAS
di: Houle, Michael, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Houle, Michael, et al.
Pubblicazione: (2024)
Documenti analoghi
-
Adaptive Parallel Downloader for Large Genomic Datasets
di: Swargo, Rasman Mubtasim, et al.
Pubblicazione: (2025) -
Optimizing the Variant Calling Pipeline Execution on Human Genomes Using GPU-Enabled Machines
di: Kumar, Ajay, et al.
Pubblicazione: (2025) -
Looking for (Genomic) Needles in a Haystack: Sparsity-Driven Search for Identifying Correlated Genetic Mutations in Cancer
di: Prabhu, Ritvik, et al.
Pubblicazione: (2026) -
Characterizing Compute-Communication Overlap in GPU-Accelerated Distributed Deep Learning: Performance and Power Implications
di: Lee, Seonho, et al.
Pubblicazione: (2025) -
FlexiWalker: Extensible GPU Framework for Efficient Dynamic Random Walks with Runtime Adaptation
di: Park, Seongyeon, et al.
Pubblicazione: (2025)