Projected Gradient Descent Method for Tropical Principal Component Analysis over Tree Space
Fuente:
arXiv
Salvato in:
| Autore principale: | Yoshida, Ruriko |
|---|---|
| Natura: | Preprint |
| Pubblicazione: |
2025
|
| Soggetti: | |
| Accesso online: | |
| Tags: |
Aggiungi Tag
Nessun Tag, puoi essere il primo ad aggiungerne!!
|
Documenti analoghi
Tropical Fermat-Weber Points over Spaces of $M$-Ultrametrics
di: Cox, Shelby, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Cox, Shelby, et al.
Pubblicazione: (2025)
Tropical Logistic Regression Model on Space of Phylogenetic Trees
di: Aliatimis, Georgios, et al.
Pubblicazione: (2023)
di: Aliatimis, Georgios, et al.
Pubblicazione: (2023)
Covariance Decomposition for Distance Based Species Tree Estimation
di: Aliatimis, Georgios, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Aliatimis, Georgios, et al.
Pubblicazione: (2025)
Bandwidth Selection of Density Estimators over Treespaces
di: Yoshida, Ruriko, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Yoshida, Ruriko, et al.
Pubblicazione: (2025)
Phylogenetic Tree Inference with Tropical Axial Attention
di: Teska, Chris, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Teska, Chris, et al.
Pubblicazione: (2026)
Phylogenetics in a warm place: computational aspects of the Tropical Grassmannian
di: Bhatt, Samir, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Bhatt, Samir, et al.
Pubblicazione: (2025)
The GFB Tree and Tree Imbalance Indices
di: Cleary, Sean, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Cleary, Sean, et al.
Pubblicazione: (2025)
Probability Metrics for Tropical Spaces of Different Dimensions
di: Talbut, Roan, et al.
Pubblicazione: (2023)
di: Talbut, Roan, et al.
Pubblicazione: (2023)
Order-Dependent Dissimilarity Measures on Phylogenetic Trees
di: Linz, Simone, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Linz, Simone, et al.
Pubblicazione: (2025)
Sackin Indices for Labeled and Unlabeled Classes of Galled Trees
di: Fuchs, Michael, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Fuchs, Michael, et al.
Pubblicazione: (2024)
A strengthened bound on the number of states required to characterize maximum parsimony distance
di: Fischer, Mareike, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Fischer, Mareike, et al.
Pubblicazione: (2025)
Bounds on the sequence length sufficient to reconstruct binary level-$1$ phylogenetic networks under the CFN model
di: Frohn, Martin, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Frohn, Martin, et al.
Pubblicazione: (2025)
Defining a phylogenetic tree with the minimum number of small-state characters
di: Long, Yangjing, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Long, Yangjing, et al.
Pubblicazione: (2025)
Bounding the SNPR distance between two tree-child networks using generalised agreement forests
di: Kelk, Steven, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Kelk, Steven, et al.
Pubblicazione: (2025)
Metaconcepts of rooted tree balance
di: Fischer, Mareike, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Fischer, Mareike, et al.
Pubblicazione: (2025)
Distinguishing Phylogenetic Level-2 Networks with Quartets and Inter-Taxon Quartet Distances
di: Holtgrefe, Niels, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Holtgrefe, Niels, et al.
Pubblicazione: (2025)
Revealing the building blocks of tree balance: fundamental units of the Sackin and Colless Indices
di: Knüver, Linda, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Knüver, Linda, et al.
Pubblicazione: (2025)
Characterizing semi-directed phylogenetic networks and their multi-rootable variants
di: Holtgrefe, Niels, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Holtgrefe, Niels, et al.
Pubblicazione: (2025)
Generalizing matrix representations to fully heterochronous ranked tree shapes
di: Jennings-Shaffer, Chris, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Jennings-Shaffer, Chris, et al.
Pubblicazione: (2025)
Binary normal networks without near reticulations can be reconstructed from their rooted triples
di: Francis, Andrew, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Francis, Andrew, et al.
Pubblicazione: (2025)
Coconvex characters on collections of phylogenetic trees
di: Czabarka, Eva, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Czabarka, Eva, et al.
Pubblicazione: (2025)
A sharp lower bound for the number of phylogenetic trees displayed by a tree-child network
di: Semple, Charles, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Semple, Charles, et al.
Pubblicazione: (2025)
Enumerative combinatorics of unlabeled and labeled time-consistent galled trees
di: Agranat-Tamir, Lily, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Agranat-Tamir, Lily, et al.
Pubblicazione: (2025)
Metrics for classes of semi-binary phylogenetic networks using $μ$-representations
di: Reichling, Christopher, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Reichling, Christopher, et al.
Pubblicazione: (2024)
Bounds on the Treewidth of Level-k Rooted Phylogenetic Networks
di: Markin, Alexey, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Markin, Alexey, et al.
Pubblicazione: (2024)
A complete characterization of pairs of binary phylogenetic trees with identical $A_k$-alignments
di: Wilde, Mirko, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Wilde, Mirko, et al.
Pubblicazione: (2024)
Combinatorial comparison of general galled trees, time-consistent galled trees, and simplex time-consistent galled trees
di: Agranat-Tamir, Lily, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Agranat-Tamir, Lily, et al.
Pubblicazione: (2026)
A height-based metaconcept for rooted tree balance and its implications for the $B_1$ index
di: Fischer, Mareike, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Fischer, Mareike, et al.
Pubblicazione: (2026)
0-1 laws for pattern occurrences in phylogenetic trees and networks
di: Bienvenu, François, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Bienvenu, François, et al.
Pubblicazione: (2024)
Bounding the softwired parsimony score of a phylogenetic network
di: Döcker, Janosch, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Döcker, Janosch, et al.
Pubblicazione: (2024)
A $μ$-distance for semidirected orchard phylogenetic networks
di: Ribas, Gerard, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Ribas, Gerard, et al.
Pubblicazione: (2026)
The weighted total cophenetic index: A novel balance index for phylogenetic networks
di: Knüver, Linda, et al.
Pubblicazione: (2023)
di: Knüver, Linda, et al.
Pubblicazione: (2023)
A kernel for the maximum agreement forest problem on multiple binary phylogenetic trees
di: Kelk, Steven, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Kelk, Steven, et al.
Pubblicazione: (2026)
Characterising rooted and unrooted tree-child networks
di: Döcker, Janosch, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Döcker, Janosch, et al.
Pubblicazione: (2024)
Perfect taxon sampling and fixing taxon traceability: Introducing a class of phylogenetically decisive collections of taxon sets
di: Fischer, Mareike, et al.
Pubblicazione: (2012)
di: Fischer, Mareike, et al.
Pubblicazione: (2012)
Cherry picking in forests: A new characterization for the unrooted hybrid number of two phylogenetic trees
di: Huber, Katharina T., et al.
Pubblicazione: (2022)
di: Huber, Katharina T., et al.
Pubblicazione: (2022)
Equidistant Circular Split Networks
di: Kagy, Bryson, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Kagy, Bryson, et al.
Pubblicazione: (2024)
A dissimilarity measure for semidirected networks
di: Maxfield, Michael, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Maxfield, Michael, et al.
Pubblicazione: (2024)
Phylogenetic network classes through the lens of expanding covers
di: Francis, Andrew, et al.
Pubblicazione: (2023)
di: Francis, Andrew, et al.
Pubblicazione: (2023)
The space of multifurcating ranked tree shapes: enumeration, lattice structure, and Markov chains
di: Zhang, Julie, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Zhang, Julie, et al.
Pubblicazione: (2025)
Documenti analoghi
-
Tropical Fermat-Weber Points over Spaces of $M$-Ultrametrics
di: Cox, Shelby, et al.
Pubblicazione: (2025) -
Tropical Logistic Regression Model on Space of Phylogenetic Trees
di: Aliatimis, Georgios, et al.
Pubblicazione: (2023) -
Covariance Decomposition for Distance Based Species Tree Estimation
di: Aliatimis, Georgios, et al.
Pubblicazione: (2025) -
Bandwidth Selection of Density Estimators over Treespaces
di: Yoshida, Ruriko, et al.
Pubblicazione: (2025) -
Phylogenetic Tree Inference with Tropical Axial Attention
di: Teska, Chris, et al.
Pubblicazione: (2026)