Organisation and dynamics of individual DNA segments in topologically complex genomes
Fuente:
arXiv
Gespeichert in:
| Hauptverfasser: | Ramakrishnan, Saminathan, Patnaik, Auro Varat, Grillo, Guglielmo, Tubiana, Luca, Michieletto, Davide |
|---|---|
| Format: | Preprint |
| Veröffentlicht: |
2025
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