Enhancing TCR-Peptide Interaction Prediction with Pretrained Language Models and Molecular Representations
Fuente:
arXiv
Gespeichert in:
| Hauptverfasser: | Qi, Cong, Fang, Hanzhang, jiang, Siqi, Hu, Tianxing, Wei, Zhi |
|---|---|
| Format: | Preprint |
| Veröffentlicht: |
2025
|
| Schlagworte: | |
| Online-Zugang: | |
| Tags: |
Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
|
Ähnliche Einträge
Rep3Net: An Approach Exploiting Multimodal Representation for Molecular Bioactivity Prediction
von: Islam, Sabrina, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Islam, Sabrina, et al.
Veröffentlicht: (2025)
TCR-EML: Explainable Model Layers for TCR-pMHC Prediction
von: Li, Jiarui, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Li, Jiarui, et al.
Veröffentlicht: (2025)
HiGraphDTI: Hierarchical Graph Representation Learning for Drug-Target Interaction Prediction
von: Liu, Bin, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Liu, Bin, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Dual-Modality Representation Learning for Molecular Property Prediction
von: Zhao, Anyin, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Zhao, Anyin, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Multi-Modality Representation Learning for Antibody-Antigen Interactions Prediction
von: Guo, Peijin, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Guo, Peijin, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Question Rephrasing for Quantifying Uncertainty in Large Language Models: Applications in Molecular Chemistry Tasks
von: Chen, Zizhang, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Chen, Zizhang, et al.
Veröffentlicht: (2024)
ImmSET: Sequence-Based Predictor of TCR-pMHC Specificity at Scale
von: Noceda, Marco Garcia, et al.
Veröffentlicht: (2026)
von: Noceda, Marco Garcia, et al.
Veröffentlicht: (2026)
Ankh3: Multi-Task Pretraining with Sequence Denoising and Completion Enhances Protein Representations
von: Alsamkary, Hazem, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Alsamkary, Hazem, et al.
Veröffentlicht: (2025)
FARM: Enhancing Molecular Representations with Functional Group Awareness
von: Nguyen, Thao, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Nguyen, Thao, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Zero-Shot Learning with Subsequence Reordering Pretraining for Compound-Protein Interaction
von: Zhang, Hongzhi, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Zhang, Hongzhi, et al.
Veröffentlicht: (2025)
PGraphDTA: Improving Drug Target Interaction Prediction using Protein Language Models and Contact Maps
von: Bal, Rakesh, et al.
Veröffentlicht: (2023)
von: Bal, Rakesh, et al.
Veröffentlicht: (2023)
Align Your Structures: Generating Trajectories with Structure Pretraining for Molecular Dynamics
von: Iyengar, Aniketh, et al.
Veröffentlicht: (2026)
von: Iyengar, Aniketh, et al.
Veröffentlicht: (2026)
Optimizing Mirror-Image Peptide Sequence Design for Data Storage via Peptide Bond Cleavage Prediction
von: Lu, Yilong, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Lu, Yilong, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Geometric Stability: The Missing Axis of Representations
von: Raju, Prashant C.
Veröffentlicht: (2026)
von: Raju, Prashant C.
Veröffentlicht: (2026)
Adapting Differential Molecular Representation with Hierarchical Prompts for Multi-label Property Prediction
von: Kang, Linjia, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Kang, Linjia, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Graph-Theoretic Models for the Prediction of Molecular Measurements
von: Niane, Anna, et al.
Veröffentlicht: (2026)
von: Niane, Anna, et al.
Veröffentlicht: (2026)
Integrating Single-Cell Foundation Models with Graph Neural Networks for Drug Response Prediction
von: Rossner, Till, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Rossner, Till, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Learning Molecular Representation in a Cell
von: Liu, Gang, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Liu, Gang, et al.
Veröffentlicht: (2024)
SubGDiff: A Subgraph Diffusion Model to Improve Molecular Representation Learning
von: Zhang, Jiying, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Zhang, Jiying, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Few-Shot Large Language Models for Actionable Triage Categorization of Online Patient Inquiries
von: Zhou, Liqi, et al.
Veröffentlicht: (2026)
von: Zhou, Liqi, et al.
Veröffentlicht: (2026)
Multi-scale Graph Autoregressive Modeling: Molecular Property Prediction via Next Token Prediction
von: Jiang, Zhuoyang, et al.
Veröffentlicht: (2026)
von: Jiang, Zhuoyang, et al.
Veröffentlicht: (2026)
Statistical NLP for Optimization of Clinical Trial Success Prediction in Pharmaceutical R&D
von: Doane, Michael R.
Veröffentlicht: (2025)
von: Doane, Michael R.
Veröffentlicht: (2025)
A Novel Recurrent Neural Network Framework for Prediction and Treatment of Oncogenic Mutation Progression
von: Parthasarathy, Rishab, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Parthasarathy, Rishab, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Tabular LLMs for Interpretable Few-Shot Alzheimer's Disease Prediction with Multimodal Biomedical Data
von: Kearney, Sophie, et al.
Veröffentlicht: (2026)
von: Kearney, Sophie, et al.
Veröffentlicht: (2026)
Predicting Biomedical Interactions with Probabilistic Model Selection for Graph Neural Networks
von: KC, Kishan, et al.
Veröffentlicht: (2022)
von: KC, Kishan, et al.
Veröffentlicht: (2022)
HIGHT: Hierarchical Graph Tokenization for Molecule-Language Alignment
von: Chen, Yongqiang, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Chen, Yongqiang, et al.
Veröffentlicht: (2024)
MolBind: Multimodal Alignment of Language, Molecules, and Proteins
von: Xiao, Teng, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Xiao, Teng, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Drug-Target Interaction/Affinity Prediction: Deep Learning Models and Advances Review
von: Vefghi, Ali, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Vefghi, Ali, et al.
Veröffentlicht: (2025)
DrugAgent: Multi-Agent Large Language Model-Based Reasoning for Drug-Target Interaction Prediction
von: Inoue, Yoshitaka, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Inoue, Yoshitaka, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Enhancing Drug Discovery: Autoencoder-Based Latent Space Augmentation for Improved Molecular Solubility Prediction using LatMixSol
von: Hasankhani, Mohammad Saleh
Veröffentlicht: (2025)
von: Hasankhani, Mohammad Saleh
Veröffentlicht: (2025)
Peptide-GPT: Generative Design of Peptides using Generative Pre-trained Transformers and Bio-informatic Supervision
von: Shah, Aayush, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Shah, Aayush, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Graph Residual based Method for Molecular Property Prediction
von: Sen, Kanad, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Sen, Kanad, et al.
Veröffentlicht: (2024)
BAPULM: Binding Affinity Prediction using Language Models
von: Meda, Radheesh Sharma, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Meda, Radheesh Sharma, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Efficient Fine-Tuning of Single-Cell Foundation Models Enables Zero-Shot Molecular Perturbation Prediction
von: Maleki, Sepideh, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Maleki, Sepideh, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Driving Accurate Allergen Prediction with Protein Language Models and Generalization-Focused Evaluation
von: Wong, Brian Shing-Hei, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Wong, Brian Shing-Hei, et al.
Veröffentlicht: (2025)
CAGenMol: Condition-Aware Diffusion Language Model for Goal-Directed Molecular Generation
von: Li, Yanting, et al.
Veröffentlicht: (2026)
von: Li, Yanting, et al.
Veröffentlicht: (2026)
GeneMamba: An Efficient and Effective Foundation Model on Single Cell Data
von: Qi, Cong, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Qi, Cong, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Multi-Peptide: Multimodality Leveraged Language-Graph Learning of Peptide Properties
von: Badrinarayanan, Srivathsan, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Badrinarayanan, Srivathsan, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Regressor-guided Diffusion Model for De Novo Peptide Sequencing with Explicit Mass Control
von: Chen, Shaorong, et al.
Veröffentlicht: (2026)
von: Chen, Shaorong, et al.
Veröffentlicht: (2026)
MolTC: Towards Molecular Relational Modeling In Language Models
von: Fang, Junfeng, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Fang, Junfeng, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Ähnliche Einträge
-
Rep3Net: An Approach Exploiting Multimodal Representation for Molecular Bioactivity Prediction
von: Islam, Sabrina, et al.
Veröffentlicht: (2025) -
TCR-EML: Explainable Model Layers for TCR-pMHC Prediction
von: Li, Jiarui, et al.
Veröffentlicht: (2025) -
HiGraphDTI: Hierarchical Graph Representation Learning for Drug-Target Interaction Prediction
von: Liu, Bin, et al.
Veröffentlicht: (2024) -
Dual-Modality Representation Learning for Molecular Property Prediction
von: Zhao, Anyin, et al.
Veröffentlicht: (2025) -
Multi-Modality Representation Learning for Antibody-Antigen Interactions Prediction
von: Guo, Peijin, et al.
Veröffentlicht: (2025)