A Comparative Review of RNA Language Models
Fuente:
arXiv
Enregistré dans:
| Auteurs principaux: | Wang, He, Zhang, Yikun, Chen, Jie, Zhan, Jian, Zhou, Yaoqi |
|---|---|
| Format: | Preprint |
| Publié: |
2025
|
| Sujets: | |
| Accès en ligne: | |
| Tags: |
Ajouter un tag
Pas de tags, Soyez le premier à ajouter un tag!
|
Documents similaires
Physically Valid Biomolecular Interaction Modeling with Gauss-Seidel Projection
par: Chen, Siyuan, et autres
Publié: (2025)
par: Chen, Siyuan, et autres
Publié: (2025)
α-HMM: A Graphical Model for RNA Folding
par: Zhang, Sixiang, et autres
Publié: (2024)
par: Zhang, Sixiang, et autres
Publié: (2024)
RNA Secondary Structure Prediction Using Transformer-Based Deep Learning Models
par: Zhou, Yanlin, et autres
Publié: (2024)
par: Zhou, Yanlin, et autres
Publié: (2024)
Structure-Informed Protein Language Model
par: Zhang, Zuobai, et autres
Publié: (2024)
par: Zhang, Zuobai, et autres
Publié: (2024)
RiNALMo: General-Purpose RNA Language Models Can Generalize Well on Structure Prediction Tasks
par: Penić, Rafael Josip, et autres
Publié: (2024)
par: Penić, Rafael Josip, et autres
Publié: (2024)
Structure Language Models for Protein Conformation Generation
par: Lu, Jiarui, et autres
Publié: (2024)
par: Lu, Jiarui, et autres
Publié: (2024)
A Comprehensive Benchmark for RNA 3D Structure-Function Modeling
par: Wyss, Luis, et autres
Publié: (2025)
par: Wyss, Luis, et autres
Publié: (2025)
CoPRA: Bridging Cross-domain Pretrained Sequence Models with Complex Structures for Protein-RNA Binding Affinity Prediction
par: Han, Rong, et autres
Publié: (2024)
par: Han, Rong, et autres
Publié: (2024)
Steering Protein Language Models
par: Huang, Long-Kai, et autres
Publié: (2025)
par: Huang, Long-Kai, et autres
Publié: (2025)
Benchmarking Large Language Models for Molecule Prediction Tasks
par: Zhong, Zhiqiang, et autres
Publié: (2024)
par: Zhong, Zhiqiang, et autres
Publié: (2024)
Compact Artificial Neural Network Models for Predicting Protein Residue -- RNA Base Binding
par: Selitskiy, Stanislav
Publié: (2025)
par: Selitskiy, Stanislav
Publié: (2025)
S$^2$ALM: Sequence-Structure Pre-trained Large Language Model for Comprehensive Antibody Representation Learning
par: Yin, Mingze, et autres
Publié: (2024)
par: Yin, Mingze, et autres
Publié: (2024)
ZeroFold: Protein-RNA Binding Affinity Predictions from Pre-Structural Embeddings
par: Hanke, Josef, et autres
Publié: (2026)
par: Hanke, Josef, et autres
Publié: (2026)
A Model-Centric Review of Deep Learning for Protein Design
par: Kyro, Gregory W., et autres
Publié: (2025)
par: Kyro, Gregory W., et autres
Publié: (2025)
NbBench: Benchmarking Language Models for Comprehensive Nanobody Tasks
par: Zhang, Yiming, et autres
Publié: (2025)
par: Zhang, Yiming, et autres
Publié: (2025)
Fair splits flip the leaderboard: CHANRG reveals limited generalization in RNA secondary-structure prediction
par: Chen, Zhiyuan, et autres
Publié: (2026)
par: Chen, Zhiyuan, et autres
Publié: (2026)
Rethinking Performance Measures of RNA Secondary Structure Problems
par: Runge, Frederic, et autres
Publié: (2023)
par: Runge, Frederic, et autres
Publié: (2023)
Machine Learning Modeling Of SiRNA Structure-Potency Relationship With Applications Against Sars-Cov-2 Spike Gene
par: Oshunyinka, Damilola
Publié: (2024)
par: Oshunyinka, Damilola
Publié: (2024)
RNACG: A Universal RNA Sequence Conditional Generation model based on Flow-Matching
par: Gao, Letian, et autres
Publié: (2024)
par: Gao, Letian, et autres
Publié: (2024)
DecompDiff: Diffusion Models with Decomposed Priors for Structure-Based Drug Design
par: Guan, Jiaqi, et autres
Publié: (2024)
par: Guan, Jiaqi, et autres
Publié: (2024)
Diffusion Language Models Are Versatile Protein Learners
par: Wang, Xinyou, et autres
Publié: (2024)
par: Wang, Xinyou, et autres
Publié: (2024)
3D-based RNA function prediction tools in rnaglib
par: Oliver, Carlos, et autres
Publié: (2024)
par: Oliver, Carlos, et autres
Publié: (2024)
mRNAutilus: Multi-Objective-Guided Discrete Generation of mRNA with Optimized Therapeutic Properties
par: Patel, Sawan, et autres
Publié: (2026)
par: Patel, Sawan, et autres
Publié: (2026)
Proteomic Learning of Gamma-Aminobutyric Acid (GABA) Receptor-Mediated Anesthesia
par: Jiang, Jian, et autres
Publié: (2025)
par: Jiang, Jian, et autres
Publié: (2025)
Reprogramming Pretrained Target-Specific Diffusion Models for Dual-Target Drug Design
par: Zhou, Xiangxin, et autres
Publié: (2024)
par: Zhou, Xiangxin, et autres
Publié: (2024)
RiboGen: RNA Sequence and Structure Co-Generation with Equivariant MultiFlow
par: Rubin, Dana, et autres
Publié: (2025)
par: Rubin, Dana, et autres
Publié: (2025)
Long-context Protein Language Modeling Using Bidirectional Mamba with Shared Projection Layers
par: Wang, Yingheng, et autres
Publié: (2024)
par: Wang, Yingheng, et autres
Publié: (2024)
RNAFlow: RNA Structure & Sequence Design via Inverse Folding-Based Flow Matching
par: Nori, Divya, et autres
Publié: (2024)
par: Nori, Divya, et autres
Publié: (2024)
Energy Efficient Protein Language Models: Leveraging Small Language Models with LoRA for Controllable Protein Generation
par: Shah, Aayush, et autres
Publié: (2024)
par: Shah, Aayush, et autres
Publié: (2024)
SMI-Editor: Edit-based SMILES Language Model with Fragment-level Supervision
par: Zheng, Kangjie, et autres
Publié: (2024)
par: Zheng, Kangjie, et autres
Publié: (2024)
Atomic Trajectory Modeling with State Space Models for Biomolecular Dynamics
par: Shi, Liang, et autres
Publié: (2026)
par: Shi, Liang, et autres
Publié: (2026)
RNA-FrameFlow: Flow Matching for de novo 3D RNA Backbone Design
par: Anand, Rishabh, et autres
Publié: (2024)
par: Anand, Rishabh, et autres
Publié: (2024)
A Protein Structure Prediction Approach Leveraging Transformer and CNN Integration
par: Zhou, Yanlin, et autres
Publié: (2024)
par: Zhou, Yanlin, et autres
Publié: (2024)
Peptide Sequencing Via Protein Language Models
par: Pham, Thuong Le Hoai, et autres
Publié: (2024)
par: Pham, Thuong Le Hoai, et autres
Publié: (2024)
Binding-Adaptive Diffusion Models for Structure-Based Drug Design
par: Huang, Zhilin, et autres
Publié: (2024)
par: Huang, Zhilin, et autres
Publié: (2024)
Multimodal Large Language Models for Inverse Molecular Design with Retrosynthetic Planning
par: Liu, Gang, et autres
Publié: (2024)
par: Liu, Gang, et autres
Publié: (2024)
Integrating Protein Dynamics into Structure-Based Drug Design via Full-Atom Stochastic Flows
par: Zhou, Xiangxin, et autres
Publié: (2025)
par: Zhou, Xiangxin, et autres
Publié: (2025)
DISPROTBENCH: Uncovering the Functional Limits of Protein Structure Prediction Models in Intrinsically Disordered Regions
par: Zeng, Xinyue, et autres
Publié: (2025)
par: Zeng, Xinyue, et autres
Publié: (2025)
Unveiling Scaling Behaviors in Molecular Language Models: Effects of Model Size, Data, and Representation
par: Xu, Dong, et autres
Publié: (2026)
par: Xu, Dong, et autres
Publié: (2026)
Beyond ESM2: Graph-Enhanced Protein Sequence Modeling with Efficient Clustering
par: Jiao, Shujian, et autres
Publié: (2024)
par: Jiao, Shujian, et autres
Publié: (2024)
Documents similaires
-
Physically Valid Biomolecular Interaction Modeling with Gauss-Seidel Projection
par: Chen, Siyuan, et autres
Publié: (2025) -
α-HMM: A Graphical Model for RNA Folding
par: Zhang, Sixiang, et autres
Publié: (2024) -
RNA Secondary Structure Prediction Using Transformer-Based Deep Learning Models
par: Zhou, Yanlin, et autres
Publié: (2024) -
Structure-Informed Protein Language Model
par: Zhang, Zuobai, et autres
Publié: (2024) -
RiNALMo: General-Purpose RNA Language Models Can Generalize Well on Structure Prediction Tasks
par: Penić, Rafael Josip, et autres
Publié: (2024)