CFP-Gen: Combinatorial Functional Protein Generation via Diffusion Language Models
Fuente:
arXiv
Salvato in:
| Autori principali: | Yin, Junbo, Zha, Chao, He, Wenjia, Xu, Chencheng, Gao, Xin |
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| Natura: | Preprint |
| Pubblicazione: |
2025
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