Rotational Dynamics of ATP Synthase: Mechanical Constraints and Energy Dissipative Channels
Fuente:
arXiv
Salvato in:
| Autori principali: | Matar, Islam K., Fahimi, Peyman, Matta, Cherif F. |
|---|---|
| Natura: | Preprint |
| Pubblicazione: |
2025
|
| Soggetti: | |
| Accesso online: | |
| Tags: |
Aggiungi Tag
Nessun Tag, puoi essere il primo ad aggiungerne!!
|
Documenti analoghi
Electrostatics of Salt-Dependent Reentrant Phase Behaviors Highlights Diverse Roles of ATP in Biomolecular Condensates
di: Lin, Yi-Hsuan, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Lin, Yi-Hsuan, et al.
Pubblicazione: (2024)
Training Dynamics of Learning 3D-Rotational Equivariance
di: Shen, Max W., et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Shen, Max W., et al.
Pubblicazione: (2025)
GTP before ATP: The energy currency at the origin of genes
di: Mrnjavac, Natalia, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Mrnjavac, Natalia, et al.
Pubblicazione: (2024)
Generative design and validation of therapeutic peptides for glioblastoma based on a potential target ATP5A
di: Qian, Hao, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Qian, Hao, et al.
Pubblicazione: (2025)
Decoding Polyphenol-Protein Interactions with Deep Learning: From Molecular Mechanisms to Food Applications
di: Liu, Qiang, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Liu, Qiang, et al.
Pubblicazione: (2025)
Rotational Sampling: A Plug-and-Play Encoder for Rotation-Invariant 3D Molecular GNNs
di: Jin, Dian
Pubblicazione: (2025)
di: Jin, Dian
Pubblicazione: (2025)
Decoding the Hot-Mitochondrion Paradox
di: Fahimi, Peyman, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Fahimi, Peyman, et al.
Pubblicazione: (2025)
Learning Structure, Energy, and Dynamics: A Survey of Artificial Intelligence for Protein Dynamics
di: Tang, Haocheng, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Tang, Haocheng, et al.
Pubblicazione: (2026)
Probing the Dark Energy in the Functional Protein Universe
di: Galpern, Ezequiel A., et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Galpern, Ezequiel A., et al.
Pubblicazione: (2025)
Energy-based generative models for monoclonal antibodies
di: Pereira, Paul, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Pereira, Paul, et al.
Pubblicazione: (2024)
Preservation Constraints on aDNA Information Generation and the HSF Posterior Sourcing Framework: A First-Principles Critique of Conventional Methods
di: Zhao, Wan-Qian, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Zhao, Wan-Qian, et al.
Pubblicazione: (2026)
An Energy-Adaptive Elastic Equivariant Transformer Framework for Protein Structure Representation
di: Zhang, Zhongyue, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Zhang, Zhongyue, et al.
Pubblicazione: (2025)
Modal Geometry Governs Proteoform Dynamics
di: Cobley, James N.
Pubblicazione: (2025)
di: Cobley, James N.
Pubblicazione: (2025)
PLD-Tree: Persistent Laplacian Decision Tree for Protein-Protein Binding Free Energy Prediction
di: Xu, Xingjian, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Xu, Xingjian, et al.
Pubblicazione: (2024)
Mechanism of Electricacupuncture Treating Detrusor Bladder Neck Dyscoordination After Suprasacral Spinal Cord Injury by Proteomics
di: Tang, Liya, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Tang, Liya, et al.
Pubblicazione: (2025)
Calibrating Generative Models to Distributional Constraints
di: Smith, Henry D., et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Smith, Henry D., et al.
Pubblicazione: (2025)
Predicting ATP binding sites in protein sequences using Deep Learning and Natural Language Processing
di: V, Shreyas, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: V, Shreyas, et al.
Pubblicazione: (2024)
Comprehensive Insights into the Cholesterol-Mediated Modulation of Membrane Function through Molecular Dynamics Simulations
di: Khodadadi, Ehsaneh, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Khodadadi, Ehsaneh, et al.
Pubblicazione: (2025)
Targeting Melanoma-Specific Tyrosinase: Cyclic Peptide Disrupts Actin Dynamics for Precision Apoptosis Induction
di: Zhao, Ruoyang, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Zhao, Ruoyang, et al.
Pubblicazione: (2025)
Exploring the Role of Molecular Dynamics Simulations in Most Recent Cancer Research: Insights into Treatment Strategies
di: Bozorgpour, Reza
Pubblicazione: (2023)
di: Bozorgpour, Reza
Pubblicazione: (2023)
Conditioned Generative Modeling of Molecular Glues: A Realistic AI Approach for Synthesizable Drug-like Molecules
di: Islam, Naeyma N., et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Islam, Naeyma N., et al.
Pubblicazione: (2026)
Computational Explorations in Biomedicine: Unraveling Molecular Dynamics for Cancer, Drug Delivery, and Biomolecular Insights using LAMMPS Simulations
di: Bozorgpour, Reza
Pubblicazione: (2023)
di: Bozorgpour, Reza
Pubblicazione: (2023)
Entropy Transfer Throughout the Structure of PDZ-2 and TIM-Barrel Proteins. A Dynamic Gaussian Network Model Study
di: Galaz, German Mino, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Galaz, German Mino, et al.
Pubblicazione: (2025)
On Novel Approach for Computing Distance based Indices of Anti-tuberculosis Drugs
di: Gunawardhana, D. C., et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Gunawardhana, D. C., et al.
Pubblicazione: (2024)
High-throughput Screening of the Mechanical Properties of Peptide Assemblies
di: Yorke, Sarah K., et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Yorke, Sarah K., et al.
Pubblicazione: (2025)
Disordered But Rhythmic: the role of intrinsic protein disorder in eukaryotic circadian timing
di: Usher, Emery T., et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Usher, Emery T., et al.
Pubblicazione: (2025)
Leveraging Conformational Diversity for Enhanced Structure-Based Virtual Screening: Insights from Molecular Dynamics Simulations of HIV-1 Protease-Ligand Complexes
di: Yang, Pei-Kun
Pubblicazione: (2025)
di: Yang, Pei-Kun
Pubblicazione: (2025)
SynFlowNet: Design of Diverse and Novel Molecules with Synthesis Constraints
di: Cretu, Miruna, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Cretu, Miruna, et al.
Pubblicazione: (2024)
Geometric Signatures of Switching Behavior in Mechanobiology
di: Barkan, Casey O., et al.
Pubblicazione: (2022)
di: Barkan, Casey O., et al.
Pubblicazione: (2022)
Structural-dynamic behavior of histamine in solution: the role of water models
di: Gavryushenko, Dmytro A., et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Gavryushenko, Dmytro A., et al.
Pubblicazione: (2026)
ATP-Dependent Mismatch Recognition in DNA Replication Mismatch Repair
di: Zhang, Nianqin, et al.
Pubblicazione: (2022)
di: Zhang, Nianqin, et al.
Pubblicazione: (2022)
The standard coil or globule phases cannot describe the denatured state of structured proteins and intrinsically disordered proteins
di: Righini, F., et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Righini, F., et al.
Pubblicazione: (2025)
The Quantum Compass Mechanism in Cryptochromes
di: Chengye, Zou, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Chengye, Zou, et al.
Pubblicazione: (2025)
Mechanisms of DNA-mediated allostery
di: Segers, Midas, et al.
Pubblicazione: (2023)
di: Segers, Midas, et al.
Pubblicazione: (2023)
Origin‐Dependence of Dipole Moments of Charged Proteins: Theoretical Foundations and Implications, Revisited
di: Islam K. Matar, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Islam K. Matar, et al.
Pubblicazione: (2025)
GoForth: Language Models for RNA Design under Structure, Sequence, and Coding Constraints
di: Lindsey, Michael
Pubblicazione: (2026)
di: Lindsey, Michael
Pubblicazione: (2026)
Fluorescence Phasor Analysis: Basic Principles and Biophysical Applications
di: Angelini, Alvaro A. Recoulat, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Angelini, Alvaro A. Recoulat, et al.
Pubblicazione: (2025)
From sequence to protein structure and conformational dynamics with AI/ML
di: Ille, Alexander M., et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Ille, Alexander M., et al.
Pubblicazione: (2025)
Training a force field for proteins and small molecules from scratch
di: Blanco-González, Alexandre, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Blanco-González, Alexandre, et al.
Pubblicazione: (2026)
Constrained Diffusion for Protein Design with Hard Structural Constraints
di: Christopher, Jacob K., et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Christopher, Jacob K., et al.
Pubblicazione: (2025)
Documenti analoghi
-
Electrostatics of Salt-Dependent Reentrant Phase Behaviors Highlights Diverse Roles of ATP in Biomolecular Condensates
di: Lin, Yi-Hsuan, et al.
Pubblicazione: (2024) -
Training Dynamics of Learning 3D-Rotational Equivariance
di: Shen, Max W., et al.
Pubblicazione: (2025) -
GTP before ATP: The energy currency at the origin of genes
di: Mrnjavac, Natalia, et al.
Pubblicazione: (2024) -
Generative design and validation of therapeutic peptides for glioblastoma based on a potential target ATP5A
di: Qian, Hao, et al.
Pubblicazione: (2025) -
Decoding Polyphenol-Protein Interactions with Deep Learning: From Molecular Mechanisms to Food Applications
di: Liu, Qiang, et al.
Pubblicazione: (2025)