HelixDesign-Antibody: A Scalable Production-Grade Platform for Antibody Design Built on HelixFold3
Fuente:
arXiv
Salvato in:
| Autori principali: | Gao, Jie, Hu, Jing, Zhang, Shanzhuo, Zhu, Kunrui, Qian, Sheng, Huang, Yueyang, Zhang, Xiaonan, Fang, Xiaomin |
|---|---|
| Natura: | Preprint |
| Pubblicazione: |
2025
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