Predicting and generating antibiotics against future pathogens with ApexOracle
Fuente:
arXiv
Salvato in:
| Autori principali: | Leng, Tianang, Wan, Fangping, Torres, Marcelo Der Torossian, de la Fuente-Nunez, Cesar |
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| Natura: | Preprint |
| Pubblicazione: |
2025
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