Assay2Mol: large language model-based drug design using BioAssay context
Fuente:
arXiv
Gespeichert in:
| Hauptverfasser: | Deng, Yifan, Ericksen, Spencer S., Gitter, Anthony |
|---|---|
| Format: | Preprint |
| Veröffentlicht: |
2025
|
| Schlagworte: | |
| Online-Zugang: | |
| Tags: |
Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
|
Ähnliche Einträge
Chemical Language Model Linker: blending text and molecules with modular adapters
von: Deng, Yifan, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Deng, Yifan, et al.
Veröffentlicht: (2024)
AssayBench: An Assay-Level Virtual Cell Benchmark for LLMs and Agents
von: De Brouwer, Edward, et al.
Veröffentlicht: (2026)
von: De Brouwer, Edward, et al.
Veröffentlicht: (2026)
Comparison of Optimised Geometric Deep Learning Architectures, over Varying Toxicological Assay Data Environments
von: Kalian, Alexander D., et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Kalian, Alexander D., et al.
Veröffentlicht: (2025)
Exploring zero-shot structure-based protein fitness prediction
von: Sharma, Arnav, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Sharma, Arnav, et al.
Veröffentlicht: (2025)
MolTC: Towards Molecular Relational Modeling In Language Models
von: Fang, Junfeng, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Fang, Junfeng, et al.
Veröffentlicht: (2024)
A Comprehensive Review of Transformer-based language models for Protein Sequence Analysis and Design
von: Ghosh, Nimisha, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Ghosh, Nimisha, et al.
Veröffentlicht: (2025)
A Text-guided Protein Design Framework
von: Liu, Shengchao, et al.
Veröffentlicht: (2023)
von: Liu, Shengchao, et al.
Veröffentlicht: (2023)
Heterogeneous network drug-target interaction prediction model based on graph wavelet transform and multi-level contrastive learning
von: Dai, Wenfeng, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Dai, Wenfeng, et al.
Veröffentlicht: (2025)
BioMaze: Benchmarking and Enhancing Large Language Models for Biological Pathway Reasoning
von: Zhao, Haiteng, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Zhao, Haiteng, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Recent advances in deep learning and language models for studying the microbiome
von: Yan, Binghao, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Yan, Binghao, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Augmenting generative models with biomedical knowledge graphs improves targeted drug discovery
von: Malusare, Aditya, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Malusare, Aditya, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Apo2Mol: 3D Molecule Generation via Dynamic Pocket-Aware Diffusion Models
von: Zheng, Xinzhe, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Zheng, Xinzhe, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Interpretable Droplet Digital PCR Assay for Trustworthy Molecular Diagnostics
von: Wei, Yuanyuan, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Wei, Yuanyuan, et al.
Veröffentlicht: (2025)
From thermodynamics to protein design: Diffusion models for biomolecule generation towards autonomous protein engineering
von: Li, Wen-ran, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Li, Wen-ran, et al.
Veröffentlicht: (2025)
BioCube: A Multimodal Dataset for Biodiversity Research
von: Stasinos, Stylianos, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Stasinos, Stylianos, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Improving Diseases Predictions Utilizing External Bio-Banks
von: Pinto, Hido, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Pinto, Hido, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Contextualizing biological perturbation experiments through language
von: Wu, Menghua, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Wu, Menghua, et al.
Veröffentlicht: (2025)
PhaGO: Protein function annotation for bacteriophages by integrating the genomic context
von: Guan, Jiaojiao, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Guan, Jiaojiao, et al.
Veröffentlicht: (2024)
BioArc: Discovering Optimal Neural Architectures for Biological Foundation Models
von: Fang, Yi, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Fang, Yi, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Multimodal AI predicts clinical outcomes of drug combinations from preclinical data
von: Huang, Yepeng, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Huang, Yepeng, et al.
Veröffentlicht: (2025)
MolSculpt: Sculpting 3D Molecular Geometries from Chemical Syntax
von: Chen, Zhanpeng, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Chen, Zhanpeng, et al.
Veröffentlicht: (2025)
DeepCRE: Transforming Drug R&D via AI-Driven Cross-drug Response Evaluation
von: Wu, Yushuai, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Wu, Yushuai, et al.
Veröffentlicht: (2024)
WISER: Weak supervISion and supErvised Representation learning to improve drug response prediction in cancer
von: Shubham, Kumar, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Shubham, Kumar, et al.
Veröffentlicht: (2024)
PatchProt: Hydrophobic patch prediction using protein foundation models
von: Gogishvili, Dea, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Gogishvili, Dea, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Product Manifold Representations for Learning on Biological Pathways
von: McNeela, Daniel, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: McNeela, Daniel, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Accelerating the inference of string generation-based chemical reaction models for industrial applications
von: Andronov, Mikhail, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Andronov, Mikhail, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Discovering intrinsic multi-compartment pharmacometric models using Physics Informed Neural Networks
von: Nasim, Imran, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Nasim, Imran, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Transfer Learning Bayesian Optimization to Design Competitor DNA Molecules for Use in Diagnostic Assays
von: Sedgwick, Ruby, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Sedgwick, Ruby, et al.
Veröffentlicht: (2024)
GraPPI: A Retrieve-Divide-Solve GraphRAG Framework for Large-scale Protein-protein Interaction Exploration
von: Li, Ziwen, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Li, Ziwen, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Surrogate modeling of Cellular-Potts Agent-Based Models as a segmentation task using the U-Net neural network architecture
von: Comlekoglu, Tien, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Comlekoglu, Tien, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Automating proton PBS treatment planning for head and neck cancers using policy gradient-based deep reinforcement learning
von: Wang, Qingqing, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Wang, Qingqing, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Machine learning-based multimodal prognostic models integrating pathology images and high-throughput omic data for overall survival prediction in cancer: a systematic review
von: Jennings, Charlotte, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Jennings, Charlotte, et al.
Veröffentlicht: (2025)
A New Deep-learning-Based Approach For mRNA Optimization: High Fidelity, Computation Efficiency, and Multiple Optimization Factors
von: Gong, Zheng, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Gong, Zheng, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Distilling and Adapting: A Topology-Aware Framework for Zero-Shot Interaction Prediction in Multiplex Biological Networks
von: Deng, Alana, et al.
Veröffentlicht: (2026)
von: Deng, Alana, et al.
Veröffentlicht: (2026)
Property-Isometric Variational Autoencoders for Sequence Modeling and Design
von: Sadeghi, Elham, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Sadeghi, Elham, et al.
Veröffentlicht: (2025)
EVA: Towards a universal model of the immune system
von: Scienta Team, et al.
Veröffentlicht: (2026)
von: Scienta Team, et al.
Veröffentlicht: (2026)
Chemist-aligned retrosynthesis by ensembling diverse inductive bias models
von: Maziarz, Krzysztof, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Maziarz, Krzysztof, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Generative modeling of protein ensembles guided by crystallographic electron densities
von: Maddipatla, Sai Advaith, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Maddipatla, Sai Advaith, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Multi-objective generative AI for designing novel brain-targeting small molecules
von: Noori, Ayush, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Noori, Ayush, et al.
Veröffentlicht: (2024)
CaLMFlow: Volterra Flow Matching using Causal Language Models
von: He, Sizhuang, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: He, Sizhuang, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Ähnliche Einträge
-
Chemical Language Model Linker: blending text and molecules with modular adapters
von: Deng, Yifan, et al.
Veröffentlicht: (2024) -
AssayBench: An Assay-Level Virtual Cell Benchmark for LLMs and Agents
von: De Brouwer, Edward, et al.
Veröffentlicht: (2026) -
Comparison of Optimised Geometric Deep Learning Architectures, over Varying Toxicological Assay Data Environments
von: Kalian, Alexander D., et al.
Veröffentlicht: (2025) -
Exploring zero-shot structure-based protein fitness prediction
von: Sharma, Arnav, et al.
Veröffentlicht: (2025) -
MolTC: Towards Molecular Relational Modeling In Language Models
von: Fang, Junfeng, et al.
Veröffentlicht: (2024)