Buchumschlag

The signal is not flushed away: Inferring the effective reproduction number from wastewater data in small populations

Fuente: arXiv

Gespeichert in:

Bibliographische Detailangaben
Hauptverfasser:	Goldstein, Isaac H., Parker, Daniel M., Jiang, Sunny, Pappu, Aiswarya Rani, Minin, Volodymyr M.
Format:	Preprint
Veröffentlicht:	2025
Schlagworte:	Methodology Populations and Evolution
Online-Zugang:	Acceder al recurso
Tags:	Tag hinzufügen Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!

Ähnliche Einträge

Semiparametric inference of effective reproduction number dynamics from wastewater pathogen surveillance data
von: Goldstein, Isaac H., et al.
Veröffentlicht: (2023)

Phylogenetic least squares estimation without genetic distances
von: Chi, Peter B., et al.
Veröffentlicht: (2023)

Accounting for reporting delays in real-time phylodynamic analyses with preferential sampling
von: Medina, Catalina M., et al.
Veröffentlicht: (2024)

Inferring infectiousness: a joint model of the within-host viral kinetics of SARS-CoV-2
von: Boyer, Christopher B., et al.
Veröffentlicht: (2026)

The time-dependent reproduction number for epidemics in heterogeneous populations
von: Bouros, Ioana, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Identifiability of linear stochastic state-space models with application to ecology
von: Barraquand, Frederic, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Consensus-level substitution rates are distinct from the virion-level rate
von: Pascall, David J
Veröffentlicht: (2026)

Detection of evolutionary shifts in variance under an Ornsten-Uhlenbeck model
von: Zhang, Wensha, et al.
Veröffentlicht: (2023)

Hidden Markov modelling of spatio-temporal dynamics of measles in 1750-1850 Finland
von: Pasanen, Tiia-Maria, et al.
Veröffentlicht: (2024)

Infinite Mixture Models for Improved Modeling of Across-Site Evolutionary Variation
von: Gill, Mandev S., et al.
Veröffentlicht: (2024)

Bayesian mixture models for phylogenetic source attribution from consensus sequences and time since infection estimates
von: Blenkinsop, Alexandra, et al.
Veröffentlicht: (2023)

Causal attribution by the chain rule: unifying natural selection, learning, economics, and other disciplines
von: Frank, Steven A.
Veröffentlicht: (2026)

Extracting useful information about reversible evolutionary processes from irreversible evolutionary accumulation models
von: Johnston, Iain G.
Veröffentlicht: (2026)

Inhomogeneous continuous-time Markov chains to infer flexible time-varying evolutionary rates
von: Datta, Pratyusa, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Noise-free comparison of stochastic agent-based simulations using common random numbers
von: Klein, Daniel J., et al.
Veröffentlicht: (2024)

A sequential approach to calibrate ecosystem models with multiple time series data
von: Oliveros-Ramos, Ricardo, et al.
Veröffentlicht: (2015)

Using theory-driven Integrated Population Models to evaluate competitive outcomes in stage-structured systems
von: Paquet, Matthieu, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Approaches to biological species delimitation based on genetic and spatial dissimilarity
von: d'Angella, Gabriele, et al.
Veröffentlicht: (2024)

Algorithms for Reconstructing B Cell Lineages in the Presence of Context-Dependent Somatic Hypermutation
von: Li, Yongkang, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Random evolutionary games and random polynomials
von: Duong, Manh Hong, et al.
Veröffentlicht: (2023)

An introduction to statistical models used to characterize species-habitat associations with animal movement data
von: Florko, Katie R. N., et al.
Veröffentlicht: (2024)

Sensitivity analysis of epidemic forecasting and spreading on networks with probability generating functions
von: Boudreau, Mariah C., et al.
Veröffentlicht: (2025)

Logistic dynamics of small populations with demographic stochasticity
von: Brugevin, Lucas M., et al.
Veröffentlicht: (2026)

Filtering coupled Wright-Fisher diffusions
von: Boetti, Chiara, et al.
Veröffentlicht: (2024)

Application of the chemical master equation and its analytical solution to the illness-death model
von: Brinks, Ralph
Veröffentlicht: (2024)

Generalized Machine Learning for Fast Calibration of Agent-Based Epidemic Models
von: Najafzadehkhoei, Sima, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Improving the use of social contact studies in epidemic modelling
von: Britton, Tom, et al.
Veröffentlicht: (2024)

Estimating the household secondary attack rate with the Incomplete Chain Binomial model
von: Lindstrøm, Jonas Christoffer, et al.
Veröffentlicht: (2024)

Bayesian Inference in Epidemic Modelling: A Beginner's Guide
von: Okolie, Augustine
Veröffentlicht: (2026)

Explicit modeling of density dependence in spatial capture-recapture models
von: Zhao, Qing, et al.
Veröffentlicht: (2024)

Comparative Analysis of Practical Identifiability Methods for an SEIR Model
von: Saucedo, Omar, et al.
Veröffentlicht: (2024)

Deterministic epidemic models overestimate the basic reproduction number of observed outbreaks
von: Ali, Wajid, et al.
Veröffentlicht: (2023)

How big does a population need to be before demographers can ignore individual-level randomness in demographic events?
von: Bryant, John, et al.
Veröffentlicht: (2024)

Settlement Mapping for Population Density Modelling in Disease Risk Spatial Analysis
von: Mutasodirin, Mirza Alim, et al.
Veröffentlicht: (2024)

Epidemic reproduction numbers in spatial networks
von: Ghadiri, Zahra, et al.
Veröffentlicht: (2026)

Weak signals, strong debates: Density dependence and population regulation through the lens of model uncertainty
von: Johnson, Evan C.
Veröffentlicht: (2024)

Modeling and Inferring Metacommunity Dynamics with Maximum Caliber
von: Jackson, Zachary, et al.
Veröffentlicht: (2025)

ARB inactivation, ARGs and antibiotics degradation in hospital wastewater
von: Stefaniak, Kornelia, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Improving wastewater-based epidemiology through strategic placement of samplers
von: Wood, Anthony J, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Disentangling the interactive effects of anthropogenic disturbances on biodiversity
von: Planas-Sitjà, Isaac, et al.
Veröffentlicht: (2026)