Treemble: A Graphical Tool to Generate Newick Strings from Phylogenetic Tree Images
Fuente:
arXiv
Gespeichert in:
| Hauptverfasser: | Allard, John B., Kumar, Sudhir |
|---|---|
| Format: | Preprint |
| Veröffentlicht: |
2025
|
| Schlagworte: | |
| Online-Zugang: | |
| Tags: |
Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
|
Ähnliche Einträge
ESL-PSC Toolkit: a graphical software environment for linking shared genetic changes to convergent phenotypes
von: Allard, John B., et al.
Veröffentlicht: (2026)
von: Allard, John B., et al.
Veröffentlicht: (2026)
Order-Dependent Dissimilarity Measures on Phylogenetic Trees
von: Linz, Simone, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Linz, Simone, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Estimation of Phylogenetic Tree using Gene Sequencing Data
von: Rafiuddin, S M
Veröffentlicht: (2025)
von: Rafiuddin, S M
Veröffentlicht: (2025)
CLTree: A Tool for Annotating, Rooting, and Evaluating Phylogenetic Trees Leveraging Genomic Lineages
von: Zuo, Guanghong
Veröffentlicht: (2025)
von: Zuo, Guanghong
Veröffentlicht: (2025)
Tropical Logistic Regression Model on Space of Phylogenetic Trees
von: Aliatimis, Georgios, et al.
Veröffentlicht: (2023)
von: Aliatimis, Georgios, et al.
Veröffentlicht: (2023)
Phylogenetic least squares estimation without genetic distances
von: Chi, Peter B., et al.
Veröffentlicht: (2023)
von: Chi, Peter B., et al.
Veröffentlicht: (2023)
Group-Based Phylogenetic Models on 3-Sunlet Networks
von: Cox, Shelby, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Cox, Shelby, et al.
Veröffentlicht: (2024)
ARTreeFormer: A Faster Attention-based Autoregressive Model for Phylogenetic Inference
von: Xie, Tianyu, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Xie, Tianyu, et al.
Veröffentlicht: (2025)
MyESL: Sparse learning in molecular evolution and phylogenetic analysis
von: Sanderford, Maxwell, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Sanderford, Maxwell, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Statistics for Phylogenetic Trees in the Presence of Stickiness
von: Lammers, Lars, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Lammers, Lars, et al.
Veröffentlicht: (2024)
PhyloFrame: A DataFrame-based Library for Fast, Flexible Phylogenetic Computation
von: Moreno, Matthew Andres, et al.
Veröffentlicht: (2026)
von: Moreno, Matthew Andres, et al.
Veröffentlicht: (2026)
Phylogenetics in a warm place: computational aspects of the Tropical Grassmannian
von: Bhatt, Samir, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Bhatt, Samir, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Phylogenetic Tree Inference with Tropical Axial Attention
von: Teska, Chris, et al.
Veröffentlicht: (2026)
von: Teska, Chris, et al.
Veröffentlicht: (2026)
Distinguishing Phylogenetic Level-2 Networks with Quartets and Inter-Taxon Quartet Distances
von: Holtgrefe, Niels, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Holtgrefe, Niels, et al.
Veröffentlicht: (2025)
PhyloProfile v2: Scalable Exploration of Multilayered Phylogenetic Profiles via Dimensionality Reduction
von: Tran, Vinh, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Tran, Vinh, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Metagenomic Analysis using Phylogenetic Placement -- A Review of the First Decade
von: Czech, Lucas, et al.
Veröffentlicht: (2022)
von: Czech, Lucas, et al.
Veröffentlicht: (2022)
Bounds on the Treewidth of Level-k Rooted Phylogenetic Networks
von: Markin, Alexey, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Markin, Alexey, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Phylogenetic network classes through the lens of expanding covers
von: Francis, Andrew, et al.
Veröffentlicht: (2023)
von: Francis, Andrew, et al.
Veröffentlicht: (2023)
Unsupervised Learning of Phylogenetic Trees via Split-Weight Embedding
von: Kong, Yibo, et al.
Veröffentlicht: (2023)
von: Kong, Yibo, et al.
Veröffentlicht: (2023)
R3F: An R package for evolutionary dates, rates, and priors using the relative rate framework
von: Tao, Qiqing, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Tao, Qiqing, et al.
Veröffentlicht: (2025)
PhyloVAE: Unsupervised Learning of Phylogenetic Trees via Variational Autoencoders
von: Xie, Tianyu, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Xie, Tianyu, et al.
Veröffentlicht: (2025)
The Cognate Data Bottleneck in Language Phylogenetics
von: Häuser, Luise, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Häuser, Luise, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Multivariate Aspects of Phylogenetic Comparative Methods
von: Bartoszek, Krzysztof
Veröffentlicht: (2024)
von: Bartoszek, Krzysztof
Veröffentlicht: (2024)
Bayesian Re-Analysis of the Phylogenetic Topology of Early SARS-CoV-2 Case Sequences
von: Weissman, Michael B.
Veröffentlicht: (2025)
von: Weissman, Michael B.
Veröffentlicht: (2025)
PhyloGen: Language Model-Enhanced Phylogenetic Inference via Graph Structure Generation
von: Duan, ChenRui, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Duan, ChenRui, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Inferring Phylogenetic Networks from Required and Forbidden LCA-Constraints
von: Ebert, Patricia A., et al.
Veröffentlicht: (2026)
von: Ebert, Patricia A., et al.
Veröffentlicht: (2026)
On the Approximation of Phylogenetic Distance Functions by Artificial Neural Networks
von: Rosenzweig, Benjamin K., et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Rosenzweig, Benjamin K., et al.
Veröffentlicht: (2025)
PhyloGFN: Phylogenetic inference with generative flow networks
von: Zhou, Mingyang, et al.
Veröffentlicht: (2023)
von: Zhou, Mingyang, et al.
Veröffentlicht: (2023)
WebCVTree4: A Newly Designed Phylogenetic and Taxonomic Study Platform for Prokaryotes Using Composition Vectors and Whole Genomes
von: Zuo, Guanghong
Veröffentlicht: (2026)
von: Zuo, Guanghong
Veröffentlicht: (2026)
Evaluating Phylogenetic Comparative Methods under Reticulate Evolutionary Scenarios
von: Morley, Lydia, et al.
Veröffentlicht: (2026)
von: Morley, Lydia, et al.
Veröffentlicht: (2026)
Temporal and probabilistic comparisons of epidemic interventions
von: Boudreau, Mariah C., et al.
Veröffentlicht: (2023)
von: Boudreau, Mariah C., et al.
Veröffentlicht: (2023)
Phylogenetic network models as graphical models
von: Sullivant, Seth
Veröffentlicht: (2025)
von: Sullivant, Seth
Veröffentlicht: (2025)
Phylogenetic degrees for Jukes-Cantor model
von: Dinu, Rodica Andreea, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Dinu, Rodica Andreea, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Weighted Food Webs Make Computing Phylogenetic Diversity So Much Harder
von: Schestag, Jannik
Veröffentlicht: (2025)
von: Schestag, Jannik
Veröffentlicht: (2025)
Orthology and Near-Cographs in the Context of Phylogenetic Networks
von: Lindeberg, Anna, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Lindeberg, Anna, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Bayesian Credible Sets for Phylogenetic Tree Topologies with Applications to Coverage Analysis and Cross-Model Comparison
von: Klawitter, Jonathan, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Klawitter, Jonathan, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Phylogenetic Corrections and Higher-Order Sequence Statistics in Protein Families: The Potts Model vs MSA Transformer
von: Khatri, Kisan, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Khatri, Kisan, et al.
Veröffentlicht: (2025)
A Class of Unrooted Phylogenetic Networks Inspired by the Properties of Rooted Tree-Child Networks
von: van Iersel, Leo, et al.
Veröffentlicht: (2026)
von: van Iersel, Leo, et al.
Veröffentlicht: (2026)
The GFB Tree and Tree Imbalance Indices
von: Cleary, Sean, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Cleary, Sean, et al.
Veröffentlicht: (2025)
DNA Replication Timing, Genome Stability and Non-adaptive Radiation
von: Herrick, John
Veröffentlicht: (2025)
von: Herrick, John
Veröffentlicht: (2025)
Ähnliche Einträge
-
ESL-PSC Toolkit: a graphical software environment for linking shared genetic changes to convergent phenotypes
von: Allard, John B., et al.
Veröffentlicht: (2026) -
Order-Dependent Dissimilarity Measures on Phylogenetic Trees
von: Linz, Simone, et al.
Veröffentlicht: (2025) -
Estimation of Phylogenetic Tree using Gene Sequencing Data
von: Rafiuddin, S M
Veröffentlicht: (2025) -
CLTree: A Tool for Annotating, Rooting, and Evaluating Phylogenetic Trees Leveraging Genomic Lineages
von: Zuo, Guanghong
Veröffentlicht: (2025) -
Tropical Logistic Regression Model on Space of Phylogenetic Trees
von: Aliatimis, Georgios, et al.
Veröffentlicht: (2023)